坊（伪时建，庙有宁靖王匾。康熙二十九年，巡道王效宗始修；五十三年，巡道陈璸重修；五十六年，里人鸠众改建；乾隆三年，巡道尹士俍倡修；三十一年，署巡道蒋允焄修，增建更衣厅于庙左；四十二年，知府蒋元枢修，五十四年，知府杨廷理修，于庙门外建戏台焉。嘉庆十二年，知县薛志亮捐俸倡修；绅士林朝英、吴春贵、陈启良等司其事。又坊里庙祀甚多：一在西定坊港口，俗呼小关帝庙，伪时建。一在道署左，康熙间建。雍正初，巡道吴昌祚修；有凤山县、大港社田租粟六十石，以奉香火。乾隆间，巡道金溶复修。一在土墼埕保，今圮。一在安平镇、一在永康里许厝甲、一在保舍甲、一在新丰里、一在长兴里，俱伪时建。一在保大东里、一在澎湖妈宫西，俱康熙间建。又其一在法华寺左，乾隆五十七年，郡守杨廷理新建）。
天后庙：在西定坊（后林姓，兴北莆田人。父名愿，五代时官都巡检。母王氏，以宋太祖建隆元年庚申三月二十三日产后于莆田之湄洲屿。方诞，红光满室，异气氤氲，生弥月，不闻啼声，故名默娘。八岁就塾读书，辄解奥义，喜焚香礼佛。十三岁得道，典秘法。年十六，观井得符，能布席海上济人。康熙四年丁亥秋九月九日，升化（或云二月十九日），年二十有八。是后常衣朱衣，乘云游岛屿间。里人祠之，有祷辄应。宣和间，赐顺济庙号；自是讫明，屡征灵迹。嘉靖中，编入祀典，以后迭加徽号。国朝康熙十九年，总督姚启圣、巡抚吴兴祚以荡平海岛，神灵显应，奏准敕封。二十二年，我师征澎湖，恍有神兵导引；及屯兵妈宫澳，靖海侯施琅谒庙，见神衣袍半湿、脸汗未干，始悟实邀神助。又澳中井泉，只可供数百口；是日驻师八万人，泉暴涌不竭。及琅率舟师入鹿耳门，复见神兵前导，海潮骤涨，表上其异，特遣礼部致祭。敕建神祠于原籍，纪功加封天后。五十九年，编入祀典。雍正四年，御赐「神昭海表」额于今庙。十一年，赐「锡福安澜」扁，令沿海各省一体奉祠致祭。后英灵溥济，呼吸感通，不可思议。沿海船户，俱各虔供香火。倘有危难，辄呼妈祖，洋中风雨晦冥，惨黑如墨，往往于樯端见神灯示佑，舟必无恙。今莆田林氏族中妇人饲子者，将往田园或采捕，以其儿置庙中；祝曰：『姑好看儿』！去竟日，儿不啼不饥，不出阈，暮各负以归。盖神之笃厚宗人又如此。康熙二十三年，靖海侯施琅建庙，即伪时宁靖王府；诸罗县知县季麒光置香灯园二十一甲，在安定里，岁收粟一百二十五石。乾隆五年十一月，镇标游击石良臣于后殿建左右厅，以其右庙祀总镇张玉麒。四十年，郡守蒋元枢修，有碑记。四十九年，郡守孙景燧复修，董某事者绅士陈名标、韩日文。嘉庆元年，绅士沈清泽、林有德、黄世绶辈同住持僧超如复募修焉）。
澎湖天后庙：在妈宫澳（澳以庙得名，即康熙二十一年靖海将军施琅克澎湖入庙见神衣半湿处）。
海安宫：在西定坊港口。乾隆五十三年，钦差大臣嘉勇公福康安偕众官公建，郡守杨廷理成其事。庙内御书扁曰：「佑济昭灵」，有文武官列名碑记（宫凡三进，中殿祀天后，其后殿祀观音大士。郡守杨廷理筹置香灯赀，有上横街店厝二所，年收税银一十八两，钱四千八百文。又其两旁旷地付居民盖搭，岁收租番银一十二饼；更右畔小船澳一所，岁收番银一十饼。嘉庆三年，董事赵宝、绅衿陈起良、郭拔萃辈倡修；增置禾寮港街店一所，年收租银六十饼。于是香灯之费，胥有赖焉。按天后庙祀，所在多有。官建者尚有鹿耳门庙；康熙五十八年，文武官公建，经历王士勷董其事。今总镇爱新泰重修。又，道署、府同知署皆有庙。其附郭者，如镇北坊水仔尾，俗呼小妈祖宫；则始初庙祀也。郡守蒋允焄、蒋元枢皆尝修焉。又宁南坊上横街庙，名曰温陵祖庙；泉人建。又西门外镇北坊有妈祖楼，其街以楼得名。又海边砻米街船厂、砖仔桥及武定里洲仔尾、新昌里濑北场皆有庙，他如澎湖各澳，有不胜载者）。
精忠庙：在东安坊（祀岳武穆王）。
马王庙：在东安坊（祀马祖，乃天驷房星之神。伪时建。乾隆四十二年，郡守蒋元枢修）。
药王庙：在西定坊北势街尾（祀药王韦慈藏。康熙五十七年，道标千总姚广建）。
韩文公祠：在镇北坊三山国王庙右（祀唐韩愈）。乾隆三十七年，邑潮州人建。举人傅修、国子生林文榜倡捐买置店星三间于旧县顶市仔头，收租以供祭费。四十一年，总镇颜鸣皋倡修，广其前后屋宇。嘉庆七年，国子生翁峻、生员陈应机等复修。
张睢阳庙：在大穆降庄（祁唐张巡，俗呼大使公。乾隆年间，张兴宗倡修；嘉庆九年，欧黄鹂等复修）。
谢东山庙：在大穆降庄（祀晋谢安，俗呼王公庙，与张睢阳庙建始俱无考。乾隆二十九年，里人姚兴邦等倡修；五十九年，陈光妙等复修）。
施公祠：在宁南坊（祀太子少保靖海侯施琅。有碑记。初侯之入台也，不戮一人，且奏请留台勿去，于台事多所建白；民怀其德，立祠以报功焉。康熙五十九年地震，祠圮）。
吴将军祠：在东安坊（祀太子少保威略将军福建水师提督吴英。钦赐御书匾额『作万人敌』；又对联：『但使虎貔常赫濯，不教山海有烟尘』。摹悬祠中。祠后有楼曰『仰止楼』。乾隆五十三年，知府杨廷理修。将军本泉州人，其子孙有来台者，居于此祠；改其额曰『吴氏家庙』。令殿宇倾圮，已就废）。
蒋公祠：在镇北坊真武庙后（祀江南观察使前台湾郡守蒋毓英）。
高公祠：在镇北坊关帝庙左（祀浙江按察使前台厦道高拱干。有碑记载「艺文」）。
靳公祠：在东安坊（祀广东分巡肇高廉罗道前台湾郡守靳治扬）。
卫公祠：在东安坊府城隍庙左（祀郡守卫台揆。有碑记，见「艺文」）。
吴公祠：在西定坊关帝庙右（祀山东按察使前台湾道吴昌祚）。
五忠祠：在安平镇水师协署之左（祀水师副将许云、游击游崇功、千总林文煌、赵奇奉、把总李茂吉五人。俱驻安平镇，辛丑之变，率水师入援府治殉难。游崇功时出哨北路外洋，自笨港回帆应援，死事尤烈。又附祀殉难兵丁，自吴国珍以下凡六十五人；又因公堕海者自陈宗以下五人。祠为雍正五年协镇陈伦炯建，营员春秋举祭。合营买置店屋五间，坐效忠里右营守备署后，收税以供祭费。乾隆四十九年，祠圮；协镇丁朝雄因附近金门旧馆改建焉。后以丙午、丁未之变，复增祀忠勇阵亡者曰水师游击杨起麟暨陈元、郑嵩三人，而义民陈三亦附焉）。
游将军祠：在小北门外厉坛后（祀水师左营游击游崇功。乾隆十五年，知县鲁鼎梅修）。
功臣祠（亦名生祠）：在宁南坊郡学宫之南，西向。乾隆五十三年，奉敕建。祀平台大将军太子太保大学士贝子公福康安、参赞大臣超勇公海兰察、成都将军鄂辉、护军统领舒亮、护军统领普尔普、闽浙总督李侍尧、福建巡抚徐嗣曾。按功臣祠牌位在后层，道光元年附置昭忠祠，略加修饰。前层为御碑亭，高耸壮伟，碑四；各高丈余。外周以墙，建中左右大门；三门之内，复旁列两御碑亭，东西相向。今亭圮碑存，外三门及围墙亦尽圮；前层渗漏剥落，雕镂细工，修补尤难。昭忠祠告竣时，道宪胡亲至阅视，并议捐修全祠，札学会县勘估。二年，署令范邦干先移交劝项饼番二百圆；嗣教谕郑兼才、训导王承纬以武学生案会县劝出饼番七百圆交办，俱蒙宪允。因前会勘宪批内有『仍交该学一手承办』之语，爰即召匠兴工，而以训导任其劳焉。
昭忠祠：在功臣祠侧。嘉庆七年奉谕旨：各直省一体建昭忠祠，祀诸阵亡者；官员正面、兵丁旁列，以五十人为一牌。八年，总督玉德等以遵办完竣覆奏，开列台湾建于福康安生祠之旁，实未于祠旁置座设位。十一年，巡道庆保始将蔡牵案内阵亡官将、弁兵列牌入祀东廊，而他案尚缺。于是教谕郑兼才董修学宫，以欧阳凯等十二人宜首入昭忠之祠，且并稽以后各案殉难诸人，列籍移县详请，以正祀典焉。按原案于嘉庆十二年由台令薛志亮详请，以未便更改，奉驳。二十五年，教谕郑兼才再调至，于道光元年仍汇造径请升任道宪叶、新任道宪胡、郡宪盖得照案承办。比训导王承纬调至，乃向绅士筹拨公项饼番三百金，会署令范邦干谨遵原奏置祠于生祠正厅之旁，左为昭忠东祠、右为西祠。祠内正龛各一，长各二丈，正面以供文武员弁；旁龛各二，长各一丈五尺，以供兵丁。其正龛首祀总镇欧阳凯、副将许云、游击孙文元、游崇功、守备胡忠义、千总蒋子龙、赵奇奉、林文煌并弟文甲、把总林彦、李茂吉、石琳等十二人；自台湾忠义孝悌祠移入。自嘉义移者，参将罗万仓、把总江先达。自凤山移者，守备马定国、千总陈元、把总林富、兵丁领旗王奇生，归入总牌。以上朱一贵案。查此案与林爽文案在嘉庆八年以前，已祀京师昭忠祠，因欧阳总镇等移祀，排列在首；若径接陈案，恐乡愚无知，疑缺林案，是以接联重祀。惟林案年久无稽，谨就道署发出乾隆五十四年议恤行知册、福建报销清单与前次兼才据办奏册，彼此详加参考，于阵亡伤亡淹毙及冲散遗失等员弁得有优恤者，计增五十余人，皆依次录祀：文职理番同知长庚、原任理番同知王隽、彰化县知县俞峻、凤山县知县汤大奎、凤山学教谕叶梦苓、训导陈龙池、南投县丞周大纶、罗汉门县丞署斗六巡检陈圣传、斗六巡检署猫雾拺渠永湜、竹堑巡检张芝馨、巡检署彰化典史冯启宗、俸满巡检陈庆、凤山典史史谦、诸罗典史钟燕超，武职北路副将赫生额、镇标中营游击耿世文、左营游击李中杨、邱能成、右营游击郑嵩、水师协中营游击杨起麟、福宁镇左营游击延山、北协中军都司王宗武、都司朱化英、都司王德俊、镇标守备杨彲、北协左营守备郝辉龙、署澎湖守备胥献珪、守备罗世德、题升守备铜山营千总陈昌登、镇标中营千总苏明耀、左营千总陈世杰、魏大鹏、南路营千总丁得秋、南淡水营千总蔡连升、水师协中营千总陈邦材、澎湖协右营千总陈淮、福宁镇中营千总邱国安、左营千总王奕魁、延平城守千总黄国恩、汀州镇右营千总钟川旸、邵武城守左军千总陈忠耀、诏安营千总汤国宝、水师提标后营千总潘金标、千总黄荣、千总吴联贵、千总陈汝志、原任千总沈瑞、原任千总卢思聪、镇标右营把总郭得胜、城守营把总吴洪、南淡水营把总萧世结、北路中营把总武成烈、陈国印、刘联升、左营把总杨连彪、右营把总尹贵、高茂、水师协中营把总陈元生、左营把总郭拔萃、徐庆、右营把总任赞元、澎湖协左营把总余寿、右营把总王泽高、水师提标中营把总蔡江、提标左营把总甘瑞龙、铜山营把总郑日新、金门镇右营把总江顺宝、南澳镇左营把总李松、建宁镇标右营把总官廷梅、左营把总席丰、陆路提标中营把总徐德升、前营把总黄拱辰、许升、铜山营把总徐国章、福州城守右军把总张射斗、同安营把总曾超群、督标水师营把总林肇升、抚标右营把总严廷选、武举候补把总陈桓璧、海坛镇左营把总蔡得恩、漳州镇右营把总蔡以和、把总刘斌全、石榴班把总陈和（此名系详请准祀）、镇标左营外委沈贤、右营外委方日高、南路营外委康宗保、许鹏飞、王朝桂、许连升、北路中营外委王光明、李国安、陈凤、水师协中营外委洪大猷、左营外委汪瑞麟、右营外委陈必高、澎湖协左营外委叶文郁、孙文元、外委邓永渭、外委江海、福宁镇左营外委郑朝凤、右营外委陈烈、铜山营外委汤贵、建宁镇左营外委潘健、金门镇右营外委萧富、陆路提标左营外委柯连升、后营外委苏安武、汀州镇左营外委熊发得、福州城守左军外委蓝志纯、右军外委许国忠、林永、督标左营外委王福、右营外委孙进、水师提标左营外委彭大猷、右营外委黄振元、云霄厅外委沈扬芳、延平城守左军外委李大魁、外委陈威、原任罗源营外委姚登、镇标中营额外外委段昭明、左营额外外委吴国宝、北路协额外外委毛进丰、陈清、苏国珍、水师协中营额外外委陆铨、左营额外外委包定邦、澎湖右营额外外委徐应标、额外外委黄一登。附赐恤知县衔彰化幕监生寿同春、粤义首监生李乔基（一作李安善）。上林爽文案。鹿港理番同知朱慧昌、彰化典史费增运、台协左营游击曾绍龙、北路中营千总吴见龙、镇标左营千总郭云秀、外委任尚标、额外外委王洪。上陈周全案。佳里兴巡检姜文炳、台镇右营额外外委徐刚。上陈锡宗案。凤山县知县吴兆麟、镇标左营游击武克勤、署城守营左军都司黄云台、
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