一月二十八日，辛爱包围右卫城。这年冬天，减免山东、浙江受灾税粮。
当年，琉球来朝进贡。
嘉靖三十七年(1558)正月十四日，停开河南矿场。三月二十三日，开始减免三大营厅征调官军营造工役。
四月四日，赈救辽东饥荒。六日，倭寇分道侵犯浙江、福建。
八月十五日，吉能侵犯永昌、凉州，围攻甘州。
十月十日，礼部进献吉祥灵芝一千八百六十棵，下诏广泛采集直径在一尺以上的。十一月十四日，告诉法官抚恤刑狱。
这年，琉球、暹罗来朝进贡。
嘉靖三十八年(1559)二月二十八日，把都儿侵犯潘家口，渡过滦河，逼进三屯营。三月七日，抢掠迁安、蓟州、玉田。十八日，赐丁世美等进士和不同出身。二十一日，倭寇侵犯浙东，被海道副使谭纶打败。二十二日，逮捕浙江总兵官俞大猷。
四月六日，倭寇侵犯通州。十三日，进攻福州。十九日，进攻淮安，被巡抚凤阳都御史李遂打败于姚家荡，倭寇退守庙湾。二十五日，副使刘景韶大败倭寇于印庄。五月十日，逮捕总督蓟辽右都御史王忄予下狱。二十三日，刘景韶在庙湾大败倭寇，平定江北倭寇。六月五日，辛爱侵犯大同。
八月二十日，李遂、胡宗宪在刘家庄打败倭寇。二十五日，赈救辽东饥荒，给耕牛和粮种。这一月，俺答侵犯土木，游击董国忠等英勇战死。九月，侵犯宣府。
当年，土鲁番、天方、撒马儿罕、鲁迷、哈密、暹罗来朝进贡。
嘉靖三十九年(1560)正月二十日，俺答侵犯宣府。二月二十二日，南京振武营发生兵变。杀总督粮储侍郎黄懋官。二十三日，赈救顺天、永平饥荒。倭寇侵犯潮州。三月十七日，大同总兵官刘汉在灰河袭击打败兀慎。二十一日，打来孙侵犯广宁，攻陷中前所，杀守备武守爵、黄廷勋。
五月十七日，赈救山西三关饥荒。二十七日，盗贼进入广东博罗县，杀知县舒颛。
七月一日，把都儿侵犯蓟西，被游击胡镇击退。六日，刘汉在丰州袭击并打败俺答。九月六日，俺答侵犯朔州、广武。
十二月，土蛮侵犯海州东胜堡。这月，广贼侵犯江西。
当年，免畿内、山西、山东、湖广、陕西受灾税粮。暹罗来朝进贡。
嘉靖四十年(1561)二月初一日，应当出现日食，但没看见。赈救山东饥荒。十七日，景王到封国上任。三月二日，赈救京师饥荒。
四月十八日，赈救山西饥荒。五月十六日，李本因父母丧事去职。闰五月二十七日，盗贼侵犯泰和，杀副使汪一中、指挥王应鹏。
七月一日，有日食。二十二日，俺答侵犯宣府，被副总兵马芳击退。九月十三日，侵犯居庸关，被参将胡镇击退。十四日，赈救南畿灾害。
十一月八日，礼部尚书袁炜为户部尚书兼武英殿大学士，参与机要事务。二十四日，吉能侵犯宁夏，进逼固原。二十五日，万寿宫发生火灾。十二月十一日，把都儿侵犯辽东盖州。
这年，乌斯藏入朝进贡。
嘉靖四十一年(1562)三月七日，白兔生子，礼部请求祭告宗庙，世宗同意了，文武百官上奏庆贺。十八日，赐申时行等进士及第及不同的出身。二十五日，重建万寿宫完工。
五月十九日，严嵩停职。二十九日，土蛮进攻汤站堡，副总兵黑春奋力战死。
九月一日，三殿重修完工，改奉天殿为皇极殿，华盖殿为中极殿，谨身殿为建极殿。
十月，免南畿、江西受灾税粮。十一月五日，分别派御史探访寻找方士、法书。七日，逮捕胡宗宪，不久释放。二十一日，吉能侵犯宁夏，副总兵王勋英勇战死。二十九日，倭寇攻陷兴化。这月，延绥总兵官赵岢分兵出塞抗击吉能并将其击败。减免陕西、湖广受灾及福建遭受侵略之地税粮。
当年，琉球入朝进贡。
嘉靖四十二年(1563)正月二十九日，俺答侵犯宣府，向南侵掠隆庆。
四月十三日，倭寇侵犯福清，被总兵官刘显、俞大猷合兵围歼。二十日，副总兵戚继光在平海卫攻破倭寇。
八月二十九日，总兵官杨照在广宁塞外袭击俺答，奋力战死。
十月二十二日，辛爱、把都儿攻破墙子岭进入内地侵犯，京师戒严，下诏各卫兵入京师救援。二十三日，掠取顺义、三河，总兵官孙膑战败而死。三十日，大同总兵官姜应熊在密云抗击并打败入侵之敌。十一月二日，京师解除戒严令。
这年，琉球来朝进贡。
嘉靖四十三年(1564)正月十八日，土蛮黑石炭侵掠蓟镇，被参将白文智抵抗击退。二月六日，伊王典木英犯罪，废为庶人。十五日，倭寇侵犯仙游，总兵官戚继光大败倭寇，福建倭寇遂被平定。闰二月二十三日，盗贼占据漳平，知县魏文瑞死。三月十七日，官军攻破潮州倭寇。
四月四日，免畿内受灾税粮。五月初一日，有日食。十四日，世宗在帐幕中得到桃子，群臣上奏庆贺。六月二十一日，倭寇侵犯海丰，被俞大猷攻破。
十二月，南韶盗贼大起，守备贺铎、指挥蔡胤元被擒拿而死。俺答侵犯山西，游击梁平、守备祁谋战死。
这年，西番、哈密、安南来朝进贡，鲁迷国进贡狮子。
嘉靖四十四年(1565)三月二十日，赐范应期等进士及第及不同的出身。二十二日，袁炜辞官退职。二十四日，严世蕃被诛杀。这月，土蛮侵犯辽东，都指挥纟泉补衮、杨维藩英勇战死。
四月十四日，吏部尚书严讷、礼部尚书李春芳一起兼任武英殿大学士，参与机要事务。十六日，，俺答侵犯肃州，总兵官刘承业将其击退。六月九日，原睿宗庙一柱子上生长一枝灵芝，祭告祖庙接受庆贺，于是兴建玉芝宫。
八月十八日，世宗在御座上获得仙药，祭告祖庙。十一月十日，严讷辞官退职。十五日，献皇帝、献皇后神牌被奉安于玉芝宫。
这年，琉球来朝进贡。
嘉靖四十五年(1566)二月一日，户部主事海瑞上疏，被下锦衣卫狱。本月，俞大猷征讨广东山贼，大破山贼。浙江、江西矿贼攻陷婺源。三月二十八日，吏部尚书郭朴兼武英殿大学士，礼部尚书高拱兼文渊阁大学士，参与机要事务。
四月初一日，有日食。二十五日，俺答侵犯辽东。六月十七日，天旱，世宗亲自到凝道雷轩祈祷雨，过了三天，终于降下雨来，群臣上奏庆贺。
七月六日，俺答又侵犯万全右卫。
十月十日，侵犯固原，总兵官郭江战败而死。十六日，侵犯偏头关。闰十月十七日，侵犯大同，参将崔世荣奋力相战，竭力而死。十一月三日，世宗身体不舒服。十二月十四日，病危，从西苑回到乾清宫。当天死于宫内，终年六十岁，遗诏由裕王即位。隆庆元年(1567)正月，上尊谥，庙号世宗，葬于永陵。
评论：世宗登位之初，竭力根除一切弊政，天下曾一度得到治理。然而反复议论大礼，众人舆论沸腾，使奸臣趁机得势，不久大兴刑狱。世宗天性讲感情，做君主后亲自施行仁义政策，追尊谥号，建立祖庙，礼节也较为合适；然而升神牌于太庙，且高于武宗之上，这不是太过分了吗！因当时政治风云变幻，将士疲惫于边境御敌，奸贼趁机内讧，加上他崇尚道教，祭享也没有什么原则，营建经常兴起，使府库库藏告缺，百多年的富庶治平之大业，因此逐渐衰落。虽然曾经铲除奸臣，自己紧握大权，但概括起来也算一个功过各半的君主。
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