称颂祝贺明太祖封纳哈出为海西侯，先后赏赐给他很多东西，同时授予乃剌吾千户人家的赋税。
纳哈出已经投降，明朝皇帝认为元朝残存的军队终究是边境上的祸患，就在军队中拜蓝玉为大将军，封唐胜、郭英为副将军，耿忠、孙恪为左、右参将，率十五万军队去征讨元朝残兵。同年冬天，元朝将领脱脱向蓝玉投降。第二年春，蓝玉率领大军从大宁到庆州，听说脱古思帖木儿在捕鱼儿海，便从偏僻小路急速前进，到百眼井时，没发现敌军，便想率军回去。这时定远侯王弼说“：我们奉神圣皇帝的恩威，带领十多万军队出征，深入到这个地方，如果没有任何收获，回去怎么向皇帝交待？”蓝玉便令军队挖地为灶烧火煮饭，一夜之间急速赶到捕鱼儿海。黎明时分，距离敌人营地只有八十里远。此时起大风，沙土飞扬，白天天色也很昏暗，军队前进没人知道，敌人也没防备。王弼为前锋，直接攻入元军营地，大败元军，斩杀太尉、蛮子数千人。脱古思帖木儿带着太子天保奴、知院捏怯来、丞相失烈门等数十人逃走。俘获了脱古思帖木儿的第二个儿子地保奴及其配偶五十多人。他手下的首领三千人、男女百姓七万多人，同时缴获马匹、骆驼、牛羊等十万头，把收缴的铠甲兵器全集中起来烧毁，接着又打破脱古思帖木儿的将领哈剌章的军营，把他们全部降伏。这样大漠北部的祸患便去除了。捷报传到，明太祖非常高兴，用纸币赏赐给地保奴等人，并命令有关官吏陈设食具招待他们。不久，有人说蓝玉私藏了地保奴的主妃，皇帝听后发怒，主妃知道后既惭愧又害怕就自杀了。地保奴知道后口出怨言，皇帝便把他流放到琉球。
脱古思帖木儿已经逃脱，想到和林去依靠丞相咬住，行到土剌河时，被部下也速迭儿所袭击，大家又都逃散，脱古思帖木儿只与捏怯来等十六人在一起。恰好咬住来迎接他们，想一起去投靠阔阔帖木儿，因为大雪而不能出发。也速迭儿的兵马突然冲至，用绳勒死脱古思帖木儿，并杀死了天保奴。这样，捏怯来、失烈门等人便投降明朝，明朝把他们安置在全宁卫所。不久，失烈门袭击并杀死捏怯来，捏怯来的部下溃散。皇帝下诏书让朵颜等卫所招抚他们，于是来归降的人更多。洪武二十三年(1390)春，明朝命令颍国公傅友德等以北平的军队跟随燕王，定远侯王弼等以山西的军队跟随晋王，一起征讨咬住、乃儿不花和阿鲁帖木儿等。燕王从古北口出发，侦察了解到乃儿不花在迤都扎营，于是冒着大雪急速进兵，离敌只有一碛远，敌人并不知晓。燕王派遣指挥观童先去敌营。观童与乃儿不花有旧谊，两人一见相互流泪。一会儿后，明军包围了乃儿不花的营地，乃儿不花大惊想逃，观童制止了他，并把他引见给燕王，燕王赏饮料食物给乃儿不花并对他抚慰后又送他回去。乃儿不花大喜过望，于是偕同咬住等人一起来归降。很久以后，乃儿不花等人因谋叛罪被杀，敌人更加衰弱。明太祖也分封燕王、晋王等为边境的藩镇，又每年派遣大将在边境要塞巡行，监督各卫所的士兵屯田，保持高度的警戒，外敌一入侵都被当地守军击败。而敌方自脱古思帖木儿以后，各部首领互相争斗，内乱不已。等传了五代到坤帖木儿时，全部被部下所杀，已经不再知晓元朝的皇帝称号了。后来有一个名叫鬼力赤的人篡位自立，称为可汗，废去国号，于是称为鞑靼。
明成祖即皇帝位后，派遣使臣持皇帝的诏谕与他们通好，给鬼力赤可汗和他的知院阿鲁台、丞相马儿哈咱等各赏银币。此时鬼力赤与瓦剌互相仇杀，屡次在边境要塞地区往来，明成祖下令各边关将领带兵严密防范。
永乐三年(1405)，鞑靼的头目埽胡儿、察罕达鲁花等人先后来明朝归附。过了很长一段时间后，阿鲁台杀死鬼力赤，在别失八里这个地方迎接元朝皇帝的后裔本雅失里，把他立为可汗。
永乐六年(1408)春，明成祖修诏书给本雅失里说“：自从元朝的气运终了以后，顺帝的后代爱猷识理达腊到坤帖木儿传了六代，就好像瞬息之间的事情一样，没有听说他们中有一人是有好结果的。我的亡父太祖高皇帝对元朝人的子孙，总是有意抚慰体恤，凡是来归顺的，总是让他们回到北方老家，例如把脱古思帖木儿送回去，他的子孙成为可汗，这些都是南北方人所共同知晓的。我的心与我亡父太祖高皇帝的心是一样的。元朝皇族的世系像线一样没有断绝，是去是来机会摆在面前，是祸是福就看你们选择。你应该审慎地处理好这件事。”本雅失里没有听从明成祖的劝告。
第二年(1409)，明军俘获了本雅失里的士卒完者帖木儿等二十二人，明成祖因此再派给事中郭骥虔诚地修书前往对方处。郭骥被对方所杀，明成祖很愤怒。同年秋天，命令洪国公丘福为大将军，武城侯王聪、同安侯火真为副将军，靖安侯王忠、安平侯李远为左右参将，带精锐骑兵十万征讨北方，同时告诫他们不要丢失时机，也不要轻易进犯敌方，一次不能成功，可以等第二次。这时的本雅失里已被瓦剌所败，与阿鲁台一起迁徙到胪朐河居住。丘福率领一千骑兵先行，碰到本雅失里的游动散兵并击败他们。这时明军还没集中，丘福乘胜渡过河流追击敌人，而敌人总假装失败故意引他们深入。明军各位将领拿明成祖的告诫制止丘福深入，丘福不听。大股敌人铺天盖地而来，包围了他们，明朝五位将军全部覆没。明成祖听到后更加愤怒。
又过了一年(1410)，明成祖亲自带领五十万军队出边关。本雅失里听到消息后感到害怕，想和阿鲁台一起往西逃，阿鲁台不愿意，手下的人相继逃散，他们君臣之间开始各自拥有军队。本雅失里往西逃奔，阿鲁台往东逃奔。明成祖带兵追到斡难河，本雅失里拒绝出战。明成祖指挥军队奋勇出击，一声呐喊之下就打败了本雅失里。本雅失里抛弃了物资和牲畜，带着七个人骑马逃走。斡难河，是元太祖铁木真开始发迹的地方。明成祖率领军队回到静虏镇，遇到阿鲁台，明成祖派人送文书给阿鲁台要他来投降。阿鲁台想来，他手下的人不同意，于是发生战斗。明成祖率领精锐骑兵大声呼喊着冲击敌人，箭矢像雨点般射向对方，阿鲁台从马上掉了下来，被明军大败，明成祖率兵追了一百多里远才回来。同年冬天，派使者向明朝廷贡献马匹，明成祖接纳了。
过了二年，本雅失里被瓦剌部的马哈木等人所杀。阿鲁台已好几次派人向朝廷献贡物，明成祖都以厚礼还报他，并送还原来俘虏的阿鲁台的同母兄妹二人。至此，阿鲁台上奏书给明朝廷，说马哈木等人杀了自己的君主，擅自扶立答里巴，因此他愿意诚心依附明朝，请求明朝廷允许他替原来的君主报仇。明成祖认为他很忠义，封他为和宁王。从此，阿鲁台每年送一次贡物，或一年送二次贡物，都是常事。
永乐十二年(1414)，明成祖率军征讨瓦剌部落。阿鲁台派自己部落长以下的官吏来朝会明成祖。明成祖各按他们的等级，赏给他们五十石米、干肉、酒糗、彩币若干。永乐十四年(1416)阿鲁台打败瓦剌，派使者来明朝献俘虏。永乐十九年(1421)，阿鲁台派使者献贡物，到边关时要抢劫行人，明成祖告诫来使应该戒绝收敛这种行为，因这个原因阿鲁台不再顺从明朝，不再朝贡了。
阿鲁台之依附明朝，是因为他被瓦剌部落所困扰，走投无路才南投，想凭借明朝的势力在塞外休养生息。明成祖接纳了他并封他为王，他的母亲、妻子都成了王太夫人、王夫人，经过几年的人口繁殖和物力聚积，其畜牧业一天比一天繁盛，于是就怠慢明朝使者，把使者拘留起来。他们派来朝贡的使者回去时，也多有抢劫掠夺的行为，他们的部落也时常到边关地区来窥探动静。永乐二十年(1422)春天，他们大举侵入兴和。于是明成祖下诏亲自征讨他们。阿鲁台听到明朝大军出发征讨，感到害怕，他的母亲和妻子也都责骂他“：大明的皇帝有什么地方对不起你，你却一定要背叛他！”这样阿鲁台便把他的军用物资、马匹牲畜全部抛弃在阔滦海旁边，只带他的妻子儿女直往北迁徙。明成祖下令烧毁阿鲁台的军用物资，收留他留下的马匹牲畜，就带军队回去了。
第二年秋天，边关的将领说阿鲁台将要入侵明朝。明成祖说“：他意料我一定不会再出去亲征了，我应当先将军队驻扎在边关要地等他。”于是就做部署，派宁阳侯陈懋为先锋，到宿嵬山时并没有发现敌人，遇到王子也先土干带着妻子儿子和部下属人来归降。明成祖便封也先土干为忠勇王，赏赐他一个姓名叫金忠。忠勇王到京都，屡次请求出击敌人自愿效劳，明成祖说：“暂时等一等吧。”
永乐二十二年(1424)春天，守卫开平的将领上奏说阿鲁台在边关抢劫掠夺，各位大臣劝明成祖听忠勇王的话。明成祖又亲自出征，军队驻扎在答兰纳木儿河时，抓获一个探子，了解到阿鲁台已经远远地逃走了。明成祖对兵事也厌倦了，就下诏书公布阿鲁台的罪恶，对于他的部下来归降的，都宽宥他们，不能杀害。明成祖乘马车回京城，当行到榆木川时，逝世。不久，阿鲁台派使者给明朝廷献贡马，仁宗已经登上皇帝位，下诏接纳他们。从此，他们又像永乐年间一样每年都来进贡物给朝廷。
这时期阿鲁台屡次被瓦剌部落所打败，他手下的军队也逃离分散了。他手下的把的等人也先后来归顺明朝，朝廷都封官职给他们，赏赐给他们钞票，让有关官吏供给他们酒食。从此以后凡来归顺的人，待遇都跟前面一样。阿鲁台更加走投无路，便带领他的属下人往东逃到兀良哈，在辽州的边关地区放牧。各位将领请求出兵掩杀他，仁宗皇帝不听。
宣德九年(1434)阿鲁台再次遭到脱脱不花的袭击，他的妻子儿子被杀，牲畜几乎丧失殆尽，只好与他的儿子失捏干等人迁徙到母纳山、察罕脑剌等地居住。不久，瓦剌部落的脱飀袭击并杀死了阿鲁台和失捏干，于是阿鲁台的儿子阿卜只俺和孙媳速木答思等无依无靠，来乞求依附于明朝，宣宗皇帝可怜并安抚了他们。阿鲁台已死，他以前所立的阿台王子及其部属朵儿只伯等人又遭脱脱不花的为难，便逃奔到亦集乃路居住。表面上他们投诚明朝，而暗地里几次入侵甘州、凉州。正统元年(1436)，将军陈懋在平川打败朵儿只伯，追到苏武山，杀死和俘虏不少敌人。正统二年(1437)冬天，明朝任命都督任礼为总兵官，蒋贵、赵安为副总兵官，尚书王骥为督师，率兵看情况相机行事。第二年夏天，又在石城打败朵儿只伯等人。阿台与朵儿只伯汇合后，又在兀鲁乃地区被明军打败。明军追击到黑泉，又追击他们到刀力沟，出沙漠有千里之远，东西两方夹击，敌人几乎全军被歼，先后俘虏了他们的部落长官达一百五十人。这样，阿台、朵儿只伯等人只好来投降明朝。
不久，脱脱不花捉到了阿台等人，并杀了他们。脱脱不花这个人，是以前元朝人的后裔，鞑靼人的酋长。瓦剌脱飀已经袭击并杀死了阿鲁台，全部收留了阿鲁台的部属，兼并了贤义王、安乐王的人马，想自己立为可汗。众人认为这样不行，脱飀才立脱脱不花为可汗，把阿鲁台的人马归属给他，自己做丞相，表面上是推奉脱脱不花，实际上并不承接脱脱不花的号令。
脱飀死后，他的儿子也先继承了父亲的权位，更加桀骜自雄，各部都听命于他，脱脱不花只有可汗的虚名而已。脱脱不花每年来朝贡时，明朝皇帝都以厚礼还报他，比其他外族更优待，文书上称他为达达可汗，皇帝对他的赏赐恩及他的妃子。正统十四年(1449)秋天，也先谋划大举入侵明朝，脱脱不花制止他说：“我们的吃和穿，大多依赖大明朝，怎么忍心做这种事。”也先不听，说：“可汗不愿做，我就自己做。”于是两人分路行动，让脱脱不花入侵辽东，自己率领大军从大同入侵明朝。明英宗皇帝亲自带兵征讨，在土木堡被也先俘虏。景泰皇帝便从原来的监国位置上登极做皇帝，尊奉英宗皇帝为太上皇。第二年秋，太上皇被也先释放回来。这件事在本书《瓦剌传》有记载。
自太上皇回归朝廷后，脱脱不花给明朝廷的献贡比以前更勤。脱脱不花以前的妻子是也先的姊，生了个儿子，也先想立他，脱脱不花不愿意。也先对脱脱不花与中国通好颇有疑忌，认为这会对自己不利，于是整肃兵马攻打脱脱不花。也先杀了脱脱不花后，把他的妻子、儿女和牲畜收容起来分配给自己的部属，自己封为可汗。这是景泰皇帝接位第二年的事。明朝廷称也先为瓦剌可汗。
不久，也先被部
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