功能蛋白质研究（第二版）

目录

**章 绪论 1

**节 功能蛋白质研究的历史回顾 1

第二节 功能蛋白质研究的主要内容及方法 7

第三节 功能蛋白质研究的挑战和展望 12

参考文献 13

第二章 蛋白质组：蛋白质的检测 15

**节 蛋白质组学的技术类别 15

第二节 基于质谱的蛋白质鉴定 23

第三节 基于质谱的蛋白质组定量 32

第四节 人类蛋白质组计划 46

第五节 蛋白质生物标志物 61

参考文献 67

第三章 蛋白质的生成 77

**节 翻译过程中各组分的组学测定 77

第二节 蛋白质的翻译中折叠 98

第三节 翻译调控与细胞功能 111

第四节 新蛋白的发现与功能 126

第五节 翻译异常与解救机制 133

参考文献 145

第四章 蛋白质的质量控制 157

**节 分子伴侣系统 159

第二节 蛋白质质量控制--内质网 165

第三节 蛋白质质量控制--线粒体 173

第四节 泛素与蛋白酶体 177

第五节 自噬-溶酶体途径相关的蛋白质降解 185

第六节 蛋白质质量控制相关疾病及分子机制 187

第七节 靶向蛋白质质量控制的*新疗法 190

参考文献 193

第五章 细胞内蛋白质的定位研究 198

**节 细胞内蛋白质的分选信号 198

第二节 内质网定位信号和蛋白质运输 211

第三节 高尔基体定位蛋白的分选和逆向运输 220

第四节 溶酶体相关的定位与功能 229

第五节 细胞外的蛋白质分选和运输 240

第六节 蛋白质定位的研究方法 248

参考文献 259

第六章 蛋白质的功能调节 278

**节 pH和水环境对蛋白质功能的调节 278

第二节 温度对蛋白质功能的调节 283

第三节 蛋白质的翻译后修饰 289

第四节 磷酸化修饰对蛋白质功能的调节 291

第五节 酰化修饰对蛋白质功能的调节 305

第六节 糖基化修饰对蛋白质功能的调节 308

第七节 泛素化修饰对蛋白质功能的调节 317

第八节 类泛素相关修饰物对蛋白质功能的调节 322

第九节 小泛素相关修饰物对蛋白质功能的调节 329

第十节 蛋白质前体激活 334

参考文献 339

第七章 蛋白质相互作用研究 343

**节 蛋白质相互作用的结构学基础 343

第二节 酵母双杂交技术 353

第三节 免疫共沉淀技术 361

第四节 GST融合蛋白沉降技术 365

第五节 串联亲和纯化 371

第六节 荧光共振能量转移技术 379

第七节 交联技术 387

第八节 预测蛋白质相互作用的生物信息学方法 397

第九节 蛋白质相互作用功能意义的研究策略 410

参考文献 411

第八章 蛋白质与核酸的互作 420

**节 核酸结合蛋白的功能与分类 420

第二节 DNA结合蛋白的结构 422

第三节 RNA识别的一般方式 427

第四节 序列特异性结合 430

第五节 蛋白质与核酸相互作用的研究技术 431

参考文献 443

第九章 基因编辑技术及其在功能蛋白质研究中的应用 446

**节 基因编辑技术概述及开发现状 446

第二节 锌指核酸酶 450

第三节 转录激活因子样效应物核酸酶 455

第四节 成簇规律间隔短回文重复序列及其相关核酸酶 458

第五节 碱基编辑 470

第六节 基因编辑技术面临的挑战及发展 477

参考文献 485

第十章 蛋白质功能的生物信息学分析 497

**节 蛋白质功能预测 498

第二节 蛋白质功能注释 523

第三节 蛋白质翻译后修饰的鉴定 541

参考文献 573

第十一章 蛋白质结构的研究方法 585

**节 核磁共振谱 585

第二节 X射线晶体衍射 607

第三节 X射线吸收光谱 617

第四节 电子顺磁共振谱 623

第五节 冷冻电子显微镜 629

第六节 圆二色光谱 637

第七节 AlphaFold预测蛋白结构 647

第八节 分子对接和动力学模拟 664

参考文献 679

第十二章 功能蛋白质研究技术在生物医药研究中的应用实例 691

**节 全基因组规模筛选鉴定肺癌抑癌蛋白质 691

第二节 基于新型邻近标记技术的卵巢癌突变TP53蛋白质相互作用组学研究 703

第三节 基于蛋白质组学的抗肿瘤药物靶标发现 720

参考文献 727