十一年底从安徽庐州出发。这年春夏间，进抵陕西，正向西安进攻，而庐州危急，回军援救，归到河南，庐州已陷。十月又从湖北郧阳进军陕西。十二月二十七日，克复陕西兴安府。
太平天国癸开十三年（清同治二年癸亥，一八六三年）
正月，浙东败退。
正月十七日（夏历正月初十日），浙江汤溪失陷。第二天，龙游，兰溪、金华被迫撤退。再过十多天，诸既、绍兴撤退。
二月，沃王张洛行被执牺牲。
二月初十日（夏历二月初五日），沃王张洛行战败，被叛徒李四一执送清营。二十三日（夏历二月十八日），在亳州义门集周家营壮烈牺牲。
五月初一日（夏历四月二十七日），石达开在四川老鸦漩河军覆身亡。
石达开自从走上分裂路线後，与敌人进行没有後方的战争，崎岖於黔、滇、川三省崇山峻岭间。最後在四川大渡河被困，走到老鸦漩河，五月初一日，向敌人伪降。清军把他的将士全部杀害，将他解去成都，凌迟处死。
五月，进北攻南军狼狈归京。雨花台、九洑洲要塞接连失陷。
进北攻南军到了皖北，遍地饥荒，不能前进。四月初六日（夏历四初二日），从安徽六安州狼狈归京。大军在皖北给饥饿所困，死丧了几万人。进北攻南战略失败。
五月初一日（夏历四月二十七日），雨花台要塞失陷。十八日（夏历五月十五日），作为天京接济咽喉，保卫天京南北两岸交通的要塞九洑洲又失陷。九洑洲要塞守军在贡王梁凤超率领下与曾国藩湘军水师血战六书夜，给敌人自建立水师以来空前未有的重大伤亡[一]。洲陷，全军壮烈牺牲。
八月，西北远征军克复陕西汉中府。
去年底，西北远征军克复陕西兴安府。今年春，从兴安府出发，分路从紫阳、汉阴、石泉等处进军汉中。八月二十日（夏历八月二十日），克复汉中府。二十三日（夏历八月二十三日），克复城固。
十月初二日（夏历十月初四日），天将江会义、■天义申法喜讨伐叛徒古隆贤，夺回广德州，力保当时军事上苏、浙、皖三省交通要行。
十月二十二日（夏历十月二十四日），叛徒纳王郜永宽、康王汪安钧、宁王周文嘉、比王伍天，郜永宽等八叛徒，就被敌人处死。
十一月初九日（夏历十一月十一日），天王拒绝撤出天京前往西北的战略，坚决死守天京。
天京自雨花台、九洑洲失守後，印子山、上方桥、江东桥、中和桥、双桥门、七甕桥、秣陵关、博望镇各要塞都失陷，资源断绝，粮食将尽。到苏州失陷，形势更为紧迫，已到了非撤退不可的时候。十一月初九日，李秀成上朝请天王撤出天京，取道安徽宁国、浙江常山、江西玉山绕湖北，向西北进军，与陈德才等西北远征军在陕西会师。
天王严斥不许。决死守天京，诏陈德才等争率师回救。
十二月二十九日（夏历正月初三日），扶王陈德才等接天王诏，本日西北远征军从陕西汉中拔营，分三路星驰电卷东归急救天京。
太平天国甲子十四年（清同治三年甲子，一八六四年）
正月十七日（夏历正月二十一日），天保城失陷，天京被合围。
天保城在锺山（又名紫金山）第三峰，居高临下，易守难攻。南京历战争辄以锺山为全城锁鑰，第三峰迫临城郊，尤为重要。所以太平天国在这里建筑天保城。第三峰南麓有一高阜，叫做龙尾坡，又叫龙广山。明初筑太平门，城跨其上，叫在城内的为富贵山，在城外的为龙膊子。太平天国又在龙膊子建筑地保城[一]。能守得住天保城，就可以截断敌人山南山北的连络，保障天京东面的交通线。保守得住地保城，就可以使敌人不得利用临城的制高点，进行逼近城根的进攻。它们是两座保卫天京的重要堡垒。正月十七日，天保城失陷，天京被合围。
三月下旬，西北远征军回到皖北边境，因苏、皖地区饥荒，无法行军，被迫停在中途。
春，苏、浙各城撤出军队，分路入江西就粮。
正月二十六日（夏历二月初一日），吴人杰、梁柏和踞江苏溧阳叛变，拒侍王李世贤入城。二月十二日（夏历二月十八日），浙江嘉兴郡失陷。二月十八日（夏历二月二十四日），杭州、馀杭守军同时撤退。三月二十九日（夏历四月初六日），江苏常州失陷。这时候，江苏、浙江各城撤出军队，都归侍王李世贤领导，分路入江西就粮食，约定八月後，徽、宁、句、溧一带秋稻熟时回军救天京。
四月十九日，天王因病逝世[一]二十二日，幼天王洪天贵福即位。
五月二十一日（夏历五月三十日），地保城失陷，敌随山高下，架炮数层，安炮百馀尊，书夜不停猛攻，迫近太平门城根开掘地道攻城。在猛烈的炮火下，太平军守城立脚不住，无法展开反地道战，天京遂致失守。
六月初六日（夏历六月十六日），天京失陷。
这一天午刻，太平门地道发，转陷城垣二十多丈。太平军奔向缺口，用火药倾盆烧死敌人无算，使敌人大队不得不退却。在缺口与敌人展开无比英勇的战斗。时天京军队不过一万多人，为饥锇困倒，能守城的不过三、四千人。敌人却以五万大军[一]首先在太平门转陷缺口，厚集精兵冲入，同时并向天京九门发动进攻。天京城大兵单，面面受敌，处处不能救应，太平门缺口无法再堵得住，而九门竟被先後攻陷。
到初更後，由李秀成当先冲锋率领将士保卫幼天王缺口冲出天京。有一些冲不出的就踞坚固的房屋击敌，到药将尽时，点燃起地雷，把敌人同时炸死。
反革命大头子曾国藩的湘军把天京抢光後，四面放火，大火八日不熄，火光烛天，如火山紫绛色，当时世界第一座大名城，被烧成瓦砾场[二]。
这班吃人的强盗，占据天京後，还以屠杀幼孩、老人作游戏，发泄他们的兽性。曾国荃的机要秘书赵烈文记他亲见的情况说：计城破後，精壮长毛……死者寥寥。……沿街死屍十之九皆老者。其幼孩未满二、三岁者亦斫戳以为戏，匍匐道上。妇女四十岁以下者一人俱无[一]老者无不负伤，或十馀刀，数十刀，哀号之声，达於四远[二]。这就是曾国藩向清同治皇帝奏报（克复金陵全股悍匪尽数歼灭），三日之间，毙贼共十馀万人[三]的真实情况，也正是曾国藩死後，同治给他树碑颂德所说那句（江淮流惠）[四]的褒词的真凭实据！
六月二十五日（夏历七月初六日），李秀成因把战马让给幼天王，保卫他行出天京後，在方山落後被俘。本日从容就义於天京。
七月十六日（夏历七月二十七日），浙江湖州大军撤出，保卫幼天王向江西进军。
幼天王冲出天京後，到达浙江湖州。决定会合江西、湖北各军，據荆、襄，以图长安的战略後，幼天王先去广德州。七月十六日，堵王黄文金率领湖州守军，以闪电的行动，在敌人围攻下，安全撤出。第二天，就到广德州，连夜保卫幼天王向江西进军。道经宁国县，黄文金病故，大军丧失了统帅全军的英勇大将。
八月初六日（夏历八月十八日），启王梁成富部西北远征军和云南起义军蔡昌荣部克复甘肃階州。
初，启王梁成富部西北远征军奉诏救天京，归到河南边界，被阻截不得东，复折回陕南。旋与云南起义军蔡昌荣部联合，向甘肃进军。八月初六日，攻克漳州。
九月初二日（夏历九月十四日），侍王李世贤克复福建漳州府。
九月二十六日（夏历十月初九日），扶王陈德才因叛徒马融和、吴青汰等叛变，在安徽霍山服毒死。
十月，幼天王洪天贵福、干王洪仁玕在江西南昌就义。
保卫幼天王入江西的军队，被敌人急追，八月二十七日（夏历九月初九日）夜，在江西石城县杨家牌全军覆败，干王洪仁玕等被俘。幼天王走脱，过十多天，在荒谷被执。十月，幼天王洪天贵福、干王洪二玕在江西南昌就义。
十月三十日（夏历十一月十四日），太平天国杰出统帅遵王赖文光领导■、亳人民组织的新军在河南郑州唐坡大败清军，今後在中原地区四年英勇战斗从此展开。
当天京失陷，敌人瓦解了江北大军扶王陈德才的部队之後，遵王赖文光首先鼓舞自己统率的部队，同时，团结以任化邦、牛宏升、张宗禹、李蕴泰等为首的■、亳队伍，领导他们奋起抗战。十月三十日，大败清科尔沁亲王僧格林沁军於河南郑州唐坡。僧格林沁带着几十个残兵逃入郑州城。十二月十七日（夏历正月初三日），再败僧格林沁军於河南鲁山，斩翼长护军统领恒龄，副都统舒伦保等。於是扭转了国破家亡後土崩瓦解的形势，展开了後四年[战无不捷，踏雪披霜，以期复国於指日][一]的辉煌战斗。
太平天国乙好十五年（清同治四年乙丑，一八六五年）
四月初一日（夏历四月二十一日），漳州失陷。太平军旋从福建分路进入广东。
四月初四日（夏历四月二十四日），歼灭清科尔沁亲王僧格林沁全军於山东曹州府高庄，斩僧格林沁。
太平军用精妙的战术，把僧格林沁全军在河南、山东、江苏三省广阔的战场上拖疲了，然後结集优势的兵力在山东曹州府高庄一举就歼灭敌人全军，尽俘满、蒙精骑。雉河集儿童张皮绠斩杀僧格林沁於麦陇中。这一役，堪与庚申十年天京解围战役媲美，同是农民起义战史上的杰作。
清廷大震，急命两江总督曾国藩为钦差大臣统领所部各军星夜赶赴山东，直隶总督刘长佑守大名，三口通商大臣崇厚带洋枪队守东昌，抗拒太平军北进。
五月初五日（夏历五月二十五日），曾国藩从江宁出发抗拒。
曾国藩接到清廷诏命，於本日从江宁出发。他握着政治与军事双管齐下的策略，除动员了装备、人数都居於绝对优势的准军和湘军，分从海陆两路迅速北上抗拒外，他到达清江浦，前线还不曾接触的时候，就首先出布告晓谕■、亳队伍的外围淮北民墟，严缉捻党。接着，就对■、亳队伍旧根据地亳州、蒙城、宿州、永城四州县颁布分化革命、铲除革命根基的[查办民墟]的毒辣条例。
五月，争夺雉河集根据地，不克。
雉河集在雉河入涡河之口，介在亳县涡城中间，向来是北用兵要行。■、亳队伍在此起义，建为根据地。癸开十三年二月，被僧格林沁攻陷，沃王张洛行牺牲。清朝统治者为铲除革命根据地计，在这里，设立一个叫做涡阳的新县，筑城增防，以皖省重兵驻守。
太平军在山东歼灭僧格林沁军後，就分路南归，争夺雉河集根据地。五月初五日（夏历五月二十五日），攻克高鑪集，截断雉河集粮道。初八日（夏历五月二十八日），猛攻雉河集清军营盘，四面合围。曾国藩飞调淮军来救，河南省清军也赶到。六月十一日（夏历六月初三日）撤围西过河南。
七月初十日（夏历七月初三日）夜，汪海洋在广东镇平刺杀统帅侍王李世贤。
九月二十一日（夏历九月十五日），太平军应山东迁来墾种微山湖涸出土地的农民湖团约，从山东入江苏丰县，分路直向徐州，攻入铜山县辛家寨，前锋离徐州仅六十里，时曾国藩驻徐州，急调各军回救。
十二月二十五日（夏历十二月二十二日）夜，长江以南大军从广东嘉应州撤退，军覆於丰顺县长峎山坳，全军将士壮烈牺牲。
苏、浙、皖三省经江西转战到闽、粤的大军，於十月二十五日（夏历十月二十一日），克复广东嘉应州。清廷命闽浙总督左宗棠率军来攻。十二月二十五日（夏历十二月二十二日）夜，从喜应州撤出，冲至丰顺线北溪村，轻重尽失，军饥无所得食，敌人追到，乳山曾叠，退走无路，军覆，全军将士壮烈牺牲。长江以南太平军覆败。
太平天国丙寅十六年（清同治五年年丙寅，一八六六年）
夏，再图夺回雉河集根据地，不逐。
四、五月间，太平军分两路回淮北：一路从泗、宿入怀远，一路由永城向毫州，企图南北夹攻夺回雉河集根据地。因敌人施行「查办民圩」的毒辣政策，使以前归附的民圩不敢从，革命群众也无法装旗接应。大军徘徊在怀远差不多一个月，不能回归蒙、亳老家。曾国藩叫器说「为前此所未闻」，赶着向皇帝奏报「著有成效」[一]。
夏，曾国藩用画河圈地兜围战略。
太平军用游击性运动战以制强敌，中原平旷，万骑驰，敌人都被迫跟追，
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