集戰艦，議往澎湖求互市。若不見許，必至搆兵。蓋阿南即紅毛番國，而咬■〈口留〉吧、大泥與之合謀，必不可以理論。為今日計，非用兵不可』。因列上調兵足餉方略，部議從之。正月，遣將先城鎮海港，且築且戰。番人退守風櫃城，居益增兵往助攻擊，數月猶不退；乃大發兵，命咨皋督諸軍齊進。寇勢窘，兩遣使求緩兵，容運米入舟即退去。諸將以窮寇莫追，許之。遂揚帆去。獨渠帥高文律等十二人據高樓自守，諸將破禽之，獻俘於朝。澎湖之警以息，而其據臺灣者猶自若也。
天啟五年，海寇顏思齊剽掠海上，往來臺澎諸島，鄭芝龍等附之。
思齊，海澄人；一時群盜陳衷紀、楊六、楊七、劉香等皆其所部。芝龍，成功父也，南安石井人，字飛黃，小名一官。其大父紹祖為泉州守葉善繼吏。芝龍方十歲，嘗戲投石子，誤中守額；守禽治之，見其容止，笑而醳焉。居無何，落魄去，之日本，娶倭婦，生成功；是夜，倭島萬火齊明，時天啟四年甲子也。已，芝龍與仲弟芝虎亡之思齊黨中為盜。衷紀亦澄人，最桀驁；芝龍委身事之。以所剽掠與紅毛市，因居於臺。濱海窮民，每闌出為紅毛耕作。臺有內地居人，自此始。適思齊死，眾推芝龍為魁；然大權猶屬衷紀。朝議招撫，以善繼習芝龍，為書招之。芝龍感激歸命。及降，善繼坐戟門，令芝龍兄弟泥首。芝龍素德善繼，屈意下之。而一軍皆譁，竟叛去。
崇禎元年秋九月，鄭芝龍殺陳衷紀於島上，率所部降。
天啟六年，巡撫朱一馮遣都司洪先春擊芝龍於漳浦之白鎮。會海潮夜生，先春漂泊失道，芝龍陰度前山及之；芝龍故有求撫意，迺佚先春。又自白鎮趣廈門，總兵俞咨皋與戰敗，又佚之。廈門人開城納之。泉守王猷遣人招諭。至是，率所部降於督師熊文燦。
崇禎三年，荷蘭犯廈門，鄭芝龍焚之，遁歸臺灣。
時豫章鄒維璉撫閩，拜芝龍為將。芝龍募龍溪人郭任功率十余人夜浮荷蘭船尾，潛入焚之，獲荷蘭五十余人；余船悉遁，不敢窺內地者數年。
崇禎十年，荷蘭駕四舶抵廣州求市；不可，乃遁歸。
蓋大姓有為之主者，當道議駈斥或從中撓之。會總督張鏡心初至，力持不可，乃引歸。嗣為奸民李葉榮所誘，交通總兵陳謙為居停出入；事露，葉榮下吏，謙自請調用以避禍。為兵科凌義渠所劾，坐逮訊。自是，沿海奸民不敢勾引，惟闌出貨物與市，而紅毛踞臺灣自若。
國朝順治十五年，甲螺（華言頭目也）郭懷一謀逐荷蘭；事覺被戮，漢人在臺者遭屠殆盡。
順治十八年夏五月，鄭成功入臺灣。冬十二月，荷蘭歸國。
先是，成功持明末朔踞廈門。由海道寇金陵，敗歸，勢蹙議遷；適紅毛甲螺何斌負債走廈，導之取臺。諸部以險阻為難。成功意銳，束甲捩柁遂行，泊澎湖。徇曰：『貾吾鷁首所向』。至鹿耳門，潮水驟漲丈余，大小戰艦縱橫畢入，乘濛霧引兵登岸。紅毛驚愕，以為自天而下，倉皇遁入臺灣城。成功攻之；不克，乃築籧篨環七鯤身以逼之。十二月，復攻城，因風縱火，焚其夾板船。時遷界命下，悉遷各省沿海居民；紅毛度無所接濟，乃自引去。成功入居臺灣域，改稱安平鎮。安平，成功故里，在泉州；稱安平者，志首邱也（余詳「沿革」、「古蹟」、「叢談」各志）。
康熙三十五年秋七月，新港民吳球謀亂伏誅。
球，新港東田尾人，好拳勇。有朱祐龍者，詐稱前明后裔，能遁法數。往來其家，陰集黨夥謀亂。鳳山縣吏陳樞之妻，球妹也。樞侵蝕課粟，官督之急，稱貸於球；球曰：『粟不必完矣。吾即日機事成，倉貯悉吾有也』。樞喜，因匿球家。尊祐龍為國師，招集漸眾。其黨余金聲約保長林盛同舉事。盛佯許諾，夜奔赴府首告。北路參將陳貴率兵環其宅，擒獲球、樞、金聲等七人，訊之得實，皆杖斃；而祐龍竟莫知所向。
康熙六十年夏四月己酉，南路賊翁飛虎等倡亂。丁巳，敗官軍，進逼府治。五月辛酉朔，總兵歐陽凱、水師副將許云、游擊游崇功等戰歿，府治陷。甲子，賊推朱一貴為首，據府僭號。庚午，總督覺羅滿保自福州馳駐廈門，檄水師提督施世驃進勦，以南澳總兵藍廷珍統偏師佐之。六月辛丑，官兵集澎湖。丙午，入鹿耳門，遂復安平鎮。壬子，復府治，賊眾逃散。閏月丁卯，獲一貴、飛虎等，械送京師磔之；余黨各正法。
上年，有高永壽首報傀儡山后朱一貴聚眾謀逆，鞫之無實，枷示逐水。是冬，天寒地震，民多失業，錢糧追呼逼迫，郡邑謠言肆起。
本年二月二十二日，總督覺羅滿保摺奏知府王珍居官辦事，任性不妥，請旨以汀州府知府高鐸調補，未至。三月間，南路匪類吳外、翁飛虎等十六人，在檳榔林唱戲拜把；粵匪杜君英、陳福壽主之，詭稱一貴在其家，遠近喧傳，盟黨響應。王珍攝鳳山縣篆，遣其次男同役往緝，混將鋸板採捕之人需索株連，各予重杖。吳外以他事被勾，逃入羅漢門內山。飛虎方負債，為勢家所迫，乘機鼓煽，糾夥八十余人。四月十九日，捏一貴名，豎旗岡山，搶汛塘軍器。旁午，入莊派飯。遇南路營把總帶兵遊巡，大呼逐之，兵盡遁。
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