壬辰（順治九年、永曆六年）
正月初二日，成功督師至海澄港，潮水大漲，直至中權關下，郝文興開城率將士出降，授前鋒鎮，掛印。以參軍黃維璟知縣事。
初十日，成功進兵江東，遣各鎮攻長泰縣。至溪西，擊敗漳州援兵。廿三日，援兵再至，復敗之。
二月初二日，遊兵營吳世珍奮勇登城，被砲燒死。成功令火器營何明築地道，用地雷以擊其城。
三月初四日，大清總督陳錦督步騎數萬來援長泰，扎營同安。初七日早，地雷發，不及城而止。陳錦按兵不進。是日，遂移兵扎江東。初十日，陳錦安營於牛蹄山，相去五里。十三日，親率諸軍出戰。成功命諸將擊之，錦大敗，棄營盤而走，全軍俱覆，喪失衣甲、馬匹、輜重，不可勝計，遂奔回，扎營同安城外。後為家丁庫成棟所刺，降於成功；成功賞之，以其弒主，陰令殺之。我長泰縣守將楊青棄城走，成功以參軍馮澄世知縣事。以甘輝為中提督，黃廷為前提督，黃山為後提督。
四月，進圍漳州，成功扎營南院。
五月，大清浙鎮馬進寶（號金衢馬）率兵援漳，屯東門，同王邦俊分道出戰，兵敗還城，遂嬰城固守，不敢出。成功圍之，數月不下。以張名振管地方事。陞協將萬禮為前衝鎮，副將陳朝為後衝鎮。成功移師金門後浦，扎營操練。
施琅前在南澳，兵付蘇茂代將，意回日後必復任；成功既不與，遂請為僧，成功諭令再募兵，許授前鋒鎮。施琅偶有親兵曾德逃亡，成功拔為親隨；琅擒回立斬之，成功怒而不發。二十日，傳令諸將在船，聽令出軍。陰令左先鋒黃廷執施琅，交忠定伯林習山囚於船中，令副將吳芳看守。琅家人著人詐稱成功令箭，取回審究。吳芳即同登岸。至草灣，琅將吳芳及押人打倒脫走，逃匿山穴中兩晝夜，投蘇茂。茂密以小舟渡海，依澄濟伯鄭芝豹。成功怒甚，欲斬林習山，未果，殺吳芳妻子，令芳追尋。二十一日，殺施琅之父及其弟施顯，以戎旗中協林勝為援勦左鎮。
二十二日，成功督兵入漳州境。二十七日，大破漳鎮王邦俊之兵於磁灶。六月回師。舊將黃興來降，授中權鎮；黃梧來降，授副將。以監督陳六御為北鎮，管騎兵。
五月，福建集舟師數百艘進攻廈門，成功令陳輝督水師禦之，戰於崇武所，閩兵大敗，棄船登岸而走。
九月，成功督師入漳浦境。漳鎮王邦俊來援，復大破之，追至龍井，降其部下數百人而還。
李長病篤，以黃昌為戎旗（鎮）親隨營。
大清固山金勵統浙直滿漢兵萬餘人入閩來援。至泉州，駐扎養馬。二十六日，成功解圍，退扎古縣，據險以待。固山由長泰入漳。
十月初三日，固山率滿騎衝營。是早西北風盡發，火箭、火砲被風打回，對面咫尺不見，滿兵乘煙衝突，海師潰散。成功退扎海澄。後提督黃山、禮武鎮陳俸、右先鋒鎮廖敬、親丁鎮郭廷、護衛右鎮洪承寵皆戰歿。
十一月，大清提督楊名高自福州率步騎入漳應援，成功逆之於小盈嶺，大破之，追至馬厝港，名高僅以身免。成功以騎兵營楊祖有功，掛印，陞營為鎮。
十二月，舊將陳堯策先投大清，同我將協守漳浦；至是獻城納降，成功以為護衛前鎮，照舊鎮守，以參軍林其昌知縣事。議築鎮門象鼻山，截溪流不得入海，欲以灌城；而奔流迅急，堤不得合，費工甚鉅，罷之。
成功不攻城，築長圍困之，使其糧盡自降。而城中兵盡括鄉紳富戶及百姓粟食之，粟盡民相枕藉餓死，殺人為食，有父食子、兄食弟、妻食夫，至於婦人群聚殺男子分食之者，毋論鼠雀及樹根、木葉、水萍、牛羊馬皮之屬盡食之。稀粥一碗值四金。自四月至十月，城中死者十七八。後大清署守道周亮工收髑髏凡七十三萬有奇，焚埋於東門外，名曰「同歸所」，築萬善庵其上，勒石記之。城外死者骨骸無數，不與焉。
癸已（順治十年、永曆七年）
三月，成功駐廈門，遣前軍定西侯張名振等率水師寇浙直州縣，並遣忠靖伯陳輝等一齊進入長江。
四月，金固山調集水陸官兵船隻，欲攻海澄。成功即遣水師左軍林察、右軍周瑞、後軍周崔（鶴）芝、阮駿、黃大振等前往堵截。後遇颶風，林察漂入興化港，被獲；至鄭、賈來議撫，始放回。
二十八日，金固山扎營祖山頭。
五月初一日，成功至海澄，調兵守禦。以前鋒鎮郝文興、戎旗鎮王秀奇、護衛前鎮陳堯策守鎮遠寨，前衝鎮萬禮守鎮遠寨外，以前提督黃廷、中提督甘輝守關帝廟前木柵，連接鎮遠寨。成功駐扎天妃宮，親行督戰。
初四日，金固山率馬步數萬扎營天妃宮前，巨砲、火箭並發，晝夜不絕。木柵燒壞，海兵多死傷山積。
初五日，後勁鎮陳魁、後衝鎮葉章各率精勇數百，合力擊之，遇砲銃齊發，葉章被砲打死，陳魁打傷右足。成功令收兵固守。以周全斌管後衝鎮，楊正管後勁鎮。大清兵連攻兩晝夜，海兵營壘隨築隨壞。成功率諸將登敵臺觀望，張蓋而坐。滿兵見之，砲矢齊發。甘輝翼成功下臺，座位隨擊碎矣。鎮遠寨邊新築籧篨，崩壞如平地，軍士無可站立；成功令神器鎮何明率洪善掘地河溝邊，夜埋火藥無數，藥心相續，候令而發
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