R语言及其医学应用

R语言及其医学应用
作 者: 王廷华 何蓉
出版社: 四川大学出版社
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作者简介

  王廷华,医学博士,留法博士后,教授,教YU部新世纪优秀人才,享受国务院政府特殊津贴,四川大学特聘教授,生物治疗国家重点实验室博士生导师,昆明医科大学实验动物学部主任(兼),神经科学研究所所长。现任世界中医药联合会中国综合医院委员会副主任委员,中国研究型医院神经再生与修复委员会常委,中国解剖学会理事,神经解剖专业委员会委员。主持国家级、省部级等20余个项目,获中华医学三等奖1项,省部级自然科学与科技进步二等奖4项、三等奖5项,主编著作23部、教材4部,教YU部长江学者评审专家。在国际高水平学术期刊Nature Communication等发表英文论文203余篇(通信181篇),中文论文400余篇;获授权专利11项。何蓉,计算机应用专业硕士,副教授,中华医学会教育技术分会委员。长期从事计算机技术及编程工作,主讲数据库原理、数据结构和大学计算机基础等课程,现为昆明医科大学实验动物学部信息中心数据分析师,主编著作3部,发表论文10余篇。

内容简介

R语言是具有强大数据分析和可视化功能的统计分析软件,已成为医学领域数据分析和可视化的重要工具。本书分11章介绍R 语言及其医学应用,包括R语言简介、R语言的数据结构、读写数据与程序、数据预处理等;同时介绍了基于R语言的数据可视化,包括使用R语言绘制条形图、饼图、直方图、盒形图,以及涉及的图形导出和par()函数、plot()函数操作,及使用ggplot2包绘制散点图、条形图、盒形图、小提琴图、直方图、密度图、韦恩图和热图等。此外,本书还重点介绍了基于R语言的医学大数据分析方法,包括常用描述统计量和分类变量列联表统计点、总体均数估计、假设检验、t检验、方差分析、卡方检验和非参数检验、多重回归分析、生存分析等,具有较强的实用性。本书可供高等医药院校临床医学、公共卫生及其他相关专业本科生和研究生,以及医药卫生管理人员使用,亦可供数据分析师、统计学及大数据挖掘从业人员学习参考。

图书目录

目录

第1章R语言简介(1)

11R语言(1)

12RStudio(6)

13R语言初探(7)

14查看R语言提供的文档(9)

第2章R语言的数据结构(12)

21R语言的一些基本语法(12)

22R语言的基本运算(14)

23向量(16)

24矩阵(21)

25数组(25)

26数据框(27)

27列表(29)

28因子(32)

29不同数据结构间的转换(35)

第3章读写数据与程序(36)

31R语言内置数据集(36)

32数据的输入(38)

33数据的输出(44)

34控制结构(46)

35函数定义(48)

第4章数据预处理(51)

41用基本包处理数据框(51)

42用dplyr包处理数据框(62)

43数据框的合并(66)

44缺失值的处理(71)

45大数据的处理策略(78)

第5章R语言初级绘图(81)

51条形图(81)

52饼图(84)

53直方图(86)

54盒形图(87)

55图形的导出(89)

56par()函数详解(92)

57plot()函数(99)

第6章R语言高级绘图(101)

61ggplot2包绘图(101)

62其他图形绘制(116)

第7章探索性数据分析(120)

71常用描述统计量(120)

72分类变量的列联表统计(126)

第8章常见统计分析(130)

81总体均数的估计(130)

82假设检验(133)

83t检验(136)

84方差分析(142)

85卡方检验(146)

86非参数检验(155)

第9章回归分析(163)

91简单线性回归(163)

92变量间的相关性(169)

93多重线性回归分析(171)

第10章Logistic回归分析(185)

101二分类的多重Logistic回归(185)

102无序多分类反应变量的Logistic回归(194)

103有序多分类反应变量的Logistic回归(198)

第11章生存分析(208)

111生存分析的方法(208)

112生存曲线的估计和比较(210)

113Cox回归(215)