常用计算机辅助药物设计软件教程

常用计算机辅助药物设计软件教程
作 者: 张亮仁
出版社: 中国医药科技出版社
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暂缺《常用计算机辅助药物设计软件教程》作者简介

内容简介

计算机辅助药物设计已成为一门新兴的研究领域,在合理药物设计中发挥不可或缺的作用。《常用计算机辅助药物设计软件教程》依据实际工作中各种软件的应用,介绍了分子动力学模拟、分子对接、蛋白质同源模建、定量构效关系的研究、药效团的构建、虚拟筛选等内容,且每一内容有不止一个软件的使用介绍,适合入门计算机辅助药物设计的广大师生参考使用。

图书目录

第一章 同源模建法预测蛋白质结构

第一节 同源模建概述

第二节 同源模建

第二章 分子对接预测结合位点

第一节 利用AutoDock进行分子对接

第二节 利用D0CK进行分子对接

第三节 利用Surflex-Dock进行分子对接

第四节 利用GOLD进行分子对接

第三章 蛋白质与核酸的分子动力学模拟

第一节 分子动力学概述

第二节 利用GROMACS进行纯蛋白分子动力学模拟

第三节 蛋白与小分子复合物的动力学模拟

第四节 核酸分子动力学模拟

第四章 利用OpenEye组件包进行虚拟筛选

第一节 软件简介

第二节 利用OpenEye组件包进行虚拟筛选

第五章 定量构效关系分析

第一节 CoMFA&CoMSIA

第二节 HQsAR

第六章 药效团

第一节 药效团介绍

第二节 利用Discovery Studio进行药效团模型构建

第七章 全新药物设计

第一节 概述

第二节 利用LigBuilder进行全新药物设计

第八章 作图软件PyMOL的应用

第一节 PyMOL简介

第二节 PyMOL基本操作

第九章 药物设计实例

第一节 利用OpenEye发现F.tularensis烯酰基载体蛋白还原酶FabI抑制剂

第二节 基于模建结构的虚拟筛选发现对虾黄头病毒蛋白酶抑制剂

第三节 基于药效团建模和分子对接的虚拟筛选发现?-分泌酶抑制剂

参考文献

彩图