，又任行军总管去防守胡人入侵。
开皇末年，突厥的达头可汗侵犯边境，皇上令晋王和杨素从灵武出发，汉王杨谅和万岁从马邑进军。
万岁率领柱国张定和、大将军李药王、杨义臣越过边界，到达大斤山，与胡兵相遇。
达头可汗派使者侦问：“隋军主帅是谁？”使者回报道：“是史万岁。”突厥人又问：“莫不是敦煌守卒史万岁？”使者答：“是他。”达头听说是万岁带兵，害怕得率军撤离了战场。
万岁率兵追赶一百多里才赶上了他们，击败了突厥，斩杀了几千人，驱逐敌军到沙漠里几百里，敌人四处逃窜。
杨素害怕万岁功大对自己不利，于是谗害万岁说：“突厥已经投降了，况且他们本来不是侵略，只是放牧而已。”因此隐瞒了他的功劳。
万岁几次上书陈述情况，但皇上还是没了解到真实情况。
这时，皇上从仁寿宫刚回京都，废掉了皇太子，穷究东宫党羽。
皇上问万岁在什么地方，万岁实际在朝中，杨素见皇上正怒气冲冲，于是趁机说：“万岁拜访东宫去了。”用以激怒皇上。
皇上相信了杨素的话，命令召来万岁。
当时万岁所带领的将士在朝喊冤枉的有几百人，万岁对他们说：“我今天把你们的功劳极力地陈述给皇上，事情会解决好的。”就去拜见皇上，陈述将士有功，却被朝廷压抑，他的语气激昂愤慨，对皇上也不顺从。
皇上激怒了，命令左右当场摔死了他。
万岁死后皇上后悔不及，但为了尊严，还是下诏列出许多罪名。
死的那一天全国上下得知消息的，认识或不认识万岁的，没有一个不惋惜的。
万岁为将领，不严治军队，让士兵自由随便，夜晚也没有人警备，敌人却不敢偷袭。
面对敌军，随机应变，没有一定的方略，称为良将。
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