，并补发所停发的月俸。磐不得已，只得再上朝理政。
这时正在伐宋，凡筹划议论之事不能决定者，立即遣使去征求王磐的意见。磐的陈奏也往往符合皇上的旨意。世祖准备征伐日本，问王磐意见如何。磐陈奏道“：现在正在伐宋，应以全力一举取胜，若再分兵于东夷，恐相持日久，难以成功。等灭宋之后，再征日本不晚。”江南平定之后，磐又上疏，其大略是“：约束军士不准滥杀，选择官吏，赏功罚罪，推广朝廷恩惠，安抚新归附百姓，消除寇盗。”这些都是当前紧要的事，都逐一施行。
朝廷打算淘汰冗官，一些有权有势的近侍之臣，感到按察司于他们不利，倡议裁撤。王磐陈奏说“：各路州郡距京师遥远，贪官污吏侵害百姓，无处控告，唯依靠按察司为他们申诉。若把按察使指为冗官，一概裁减，则小民冤死而无处申诉了。若让京师御史台去纠察四方之事，这是很不对的。御史台纠察朝廷百官、京畿州县，尚有不到之处，怎能完全纠察外省千百城之事？若欲并入运司，运司是专以营利收赋税为职，与管民官常常分为彼此，岂能有功夫顾及小民之冤情？”因此各地按察司未被废除。
朝廷记录平宋之功，升至宰相执政者二十余人。有人提出改定官制，磐上疏说：“历代制度是：有官品，有爵号，有职位。官爵是表示所受的荣耀恩宠，职位是要委以权力。臣下有功有劳，随其大小而给以官爵；有才有能，按其才能授其职位。这就是皇上驾御臣下之方式方法。臣认为，有功者加升散官，或赐五等爵号，如汉、唐封侯之制即可，不宜任其他职位。”
征讨日本，大军即将出发，磐入朝谏阻说“：日本小夷，海道既远且险，胜并不表现我们武功之盛，不胜则损害国威。臣以为不去征伐为好。”世祖大怒，认为这话不该说，是别有用心。磐回答说：“臣赤心为国，才敢于直言，如果有他心，为何从叛乱之地，冒着万死危险来归向朝廷？今臣已八十，况无子无嗣，若存有他心又是为了谁？”第二天，世祖遣侍臣和颜悦色地去慰抚，使磐无忧惧，又赐碧玉宝枕。
磐因年老，多次请求退休还乡。丞相和礼霍孙也帮他请求，终于允准，晋升为资德大夫而离职，仍给终身半俸禄。皇太子听说磐告老还乡，召请他入宫赐宴饯别。启程之日，公卿百官为他设宴饯行。第二天，皇太子又赐宴圣安寺，公卿百官送于丽泽门外。磐无子，命其婿著作郎李稚宾为东平判官，以便就近奉养。世祖常向大臣询问磐生活情况，始终眷恋不已。
磐禀性刚强，平时不妄言笑，每奏对皇帝，言辞正直，不肯阿谀奉承，世祖称赞他为人耿直，虽权臣和受皇帝宠爱的人对他怒目而视，他也不屑一顾。阿合马正掌权之时，以重金求写篇歌颂自己的碑文，他坚决拒绝。所荐举的宋..、雷膺、魏初、徐琰，胡祗..、孟祺、李谦，后来都是名臣。享年九十二岁而卒。赠端贞雅亮佐治功臣、太傅、开府仪同三司，追封氵名国公，谥“文忠”。
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