高性能集群计算（第二卷 编程与应用）

第一部分 编程环境和开发工具

第1章 并行编程模型和范例

1. l 引言

1. 2 集群计算机及其结构

1. 3 并行程序及其开发

1. 4 代码粒度和非行层次

1. 5 并行编程模型和工具

1. 6 并行算法的系统化设计

1. 7 并行编程模式

1. 8 编程框架和模板

1. 9 小结

1. 10 参考文献

第2章 并行编程语言与环境

2. 1 引言

2. 2 早期的机制

2. 3 共享存储器环境

2. 4 分布式存储环境

2. 5 并行说明性环境

2. 6 小结

2. 7 参考文献

第3章 MPI和PVM编程技术

3. l 引言

3. 2 MPI和PVM的对比

3. 3 任意两点间的最短路径问题

3. 4 MPI编程环境

3. 5 PVM编程环境

3. 6 移植

3. 7 小结

3. 8 参考文献

第4章 链接消息传递环境

4. l 消息传递接口之间的互操作

4. 2 PLUS库简介

4. 3 系统结构

4. 4 加入新的消息传递环境

4. 5 性能测试结果

4. 6 相关的工作

4. 7 小结

4. 8 参考文献

第5章 主动对象

5. l 基于集群的并行系统中的对象

5. 2 主动和被动对象

5. 3 对象和原子操作

5. 4 BaLinda K对象

5. 5 投机处理

5. 6 小结

5. 7 参考文献

第6章 用作用域行为来优化数据共享模式

6. l 引言

6. 2 动机：数据共享模式

6. 3 Aurora：分布式共享数据系统

6. 4 实现概述

6. 5 并行程序模拟

6. 6 讨论及相关工作

6. 7 小结

6. 8 参考文献

第7章 基于组件的开发方法

7. 1 引言

7. 2 基于组件的应用开发

7. 3 高级特征

7. 4 在分布式环境中复用仿真软件

7. 5 各种方法的比较

7. 6 小结

7. 7 参考文献

第8章 使用LiPS的超计算

8. l 生成通信

8. 2 使用LiPS

8.3 LiPS运行时系统

8. 4 LiPS开发系统

8. 5 参考文献

第9章 高效元组空间编程环境

9. 1 引言

9. 2 元组空间编程

9. 3 编译环境

9. 4 运行时环境

9. 5 扩展

9. 6 小结

9. 7 参考文献

第10章 调试并行程序

10. l 引言

10. 2 自动并行

10. 3 调试中面临的问题

10. 4 使用Code Liberation进行调试

10. 5 实验结果

10. 6 小结

10. 7 参考文献

第11章 WebOS——应用于广域网的操作系统

11. l 引言

11. 2 WebOS概述

11. 3 命名

11. 4 一致性共享状态

11. 5 安全和认证

11. 6 进程控制

11. 7 Rent-A-Server

11. 8 相关工作

11. 9 小结

11. 10 参考文献

第二部分 用于高性能计算的Java

第12章 分布对象计算

12. l 引言

12. 2 CORBA

12. 3 Java RMI

12. 4 DCOM

12. 5 Voyager

12. 6 简单的性能测试

12. 7 参考文献

第13章 Java以及不同的并行程序设计模型

13. 1 引言

13. 2 Java线程对并行和并发的内部支持

13. 3 并行程序设计模型

13. 4 小结

13. 5 参考文献

第14章 HP模型及其Java绑定

14. l 引言

14. 2 Java语言绑定

14. 3 HPSpmd编程模型的Java程序包

14. 4 编程实例

14. 5 语言设计中的问题

14. 6 项目进展

14. 7 小结

14. 8 参考文献

第15章 基于Web的Java并行计算

15. l 引言

15. 2 基于Web的并行计算

15. 3 集群与基于Web并行计算的比较

15. 4 基于Internet并行计算的例子

15. 5 Java能用于基于Web的并行计算吗

15. 6 基于Web的并行计算需要解决的问题

15. 7 JET平台

15. 8 一些性能结果

15. 9 小结

15. 10 参考文献

第三部分 算法和应用

第16章 并行遗传算法的面向对象的实现

16. l 引言

16. 2 GA系统概览

16. 3 PGA的面向对象的实现

16. 4 表示个体的类

16. 5 局部遗传操作

16. 6 岛模型

16. 7 全局种群模型

16. 8 负载平衡

16. 9 文件和输入／输出操作

16. 10 PGA系统的框架

16. 11 实验结果

16. 12 小结

16. 13 参考文献

策17章 异构系统上特定应用的负载平衡

17. l 引言

17. 2 系统概述

17. 3 复数FDTD方程的实现

17. 4 负载平衡

17. 5 分析

17. 6 小结

17. 7 参考文献

第18章 并行仿真中的时间管理

18. l 引言

18. 2 并行仿真中的主要问题

18. 3 并行仿真的原理

18. 4 保守的同步协议

18. 5 小结

18. 6 参考文献

第19章 硬件系统仿真

19. 1 引言

19. 2 NEPSi

19. 3 讨论

19. 4 参考文献

策20章 实时资源管理中间件：开放系统及其应用

20. l 引言

20. 2 动态QoS管理中间件的体系结构

20. 3 自适应的资源分配

20. 4 自适应资源管理服务的实际应用

20. 5 小结

20. 6 参考文献

第21章 无共享数据库中的数据分布

21. l 引言

21. 2 数据安排

21. 3 划分

21. 4 安排

21. 5 二次分配

21. 6 动态重组

21. 7 小结

21. 8 参考文献

第22章 大型知识库的并行接口：实时推理的连接方法

22. 1 引言

22. 2 SHRUTI：结构化连接报理系统

22. 3 SHRUTI到并行机器上的映射

22. 4 SHRUTI在CM－5上的设计和实现

22. 5 SHRUTI－CM5的数学分析

22. 6 SHRUTI－CM5上对大规模知识库进行的试验

22. 7 小结

22. 8 参考文献

第23章 MaRT：用于并行光线跟踪的惰性计算

23. l 引言

23. 2 光线追踪并行化技术

23. 3 MaRT：惰性光线追踪器

23. 4 并行MaRT

23. 5 小结

23. 6 参考文献

第24章 基于内容的快速图像检索

24. 1 引言

24. 2 图像特征提取

24. 3 动态图像索引

24. 4 图像相似性度量

24. 5 图像搜索

24. 6 并行实现

24. 7 实验结果

24. 8 并行图像特征提取

24. 9 小结

24. 10 参考文献

第25章 海洋气候建模

25. l 引言

25. 2 模型描述

25. 3 不规则几何体的并行分解

25. 4 不同系统中的海洋模型

25. 5 科学结论

25. 6 小结

25. 7 参考文献

第26章 计算电磁学

26. l 引言

26. 2 物理光学方法

26. 3 有限差分的时间域方法

26. 4 有穷单元积分方程耦合方法

26. 5 小结

26. 6 参考文献

第27章 CFD模拟——软件工程中的实例研究

27. l 引言

27. 2 TfC——代表当前水平的工业CFD包

27. 3 并行CFD模拟的条件

27. 4 ParTfC的设计与实现

27. 5 科学软件的面向对象设计

27. 6 并行科学计算软件的生产应用

27. 7 参考文献

第28章 量子反应散射计算

28. 1 引言

28. 2 多体问题的描述. 分解和解决

28. 3 并行化策略

28. 4 CRAY T3E上的并行实现

28. 5 SGI Origin 2000上的并行实现

28. 6 元计算机上的并行实现

28. 7 小结

28. 8 参考文献

第29章 生物医学应用模型

29. l 引言

29. 2 染色体重构问题

29. 3 染色体重构的PVM算法

29. 4 心率可变性和Kolmogorov熵

29. 5 使用PVM计算K2熵的并行算法

29. 6 最佳缩放区域决定算法

29. 7 实验结果

29. 8 小结

29. 9 参考文献