言之：昔之偽鎮營蟻附脅從，皆受鄭成功、鄭經父子結恩舊人，籠絡相依；今劉國軒舛戾操權，動輒殺戮，以威制人，誰肯甘為魚肉？是我舟師未到澎湖，權猶在劉國軒一人之主持。我舟師若抵澎湖，勢難遏各汛偽卒之變亂；則踞守澎湖逆賊縱有萬餘，內多思叛。驅萬心之眾，以抗我精練勇往之師，何足比數？雖劉國軒輕命死敵於人猜忌之際，靡有不潰。則可破、可剿之機，又無過乎是。今我皇上若以俟有可破、可剿之時，溫旨下頒，則汪洋巨浪之中，誰肯效命七尺之驅，而殫力三窟之險？勢必藉旨意為居奇，遷延歲月，虛縻浩費。所謂「築室道旁，三年不成」，是賊終無可剿、可破之日矣。矧夫按兵不動，若以撫諭；劉國軒沐猴鴟張，操縱自若，志得意滿，斷無輸誠向化之念。雖其中偽鎮營賊眾有心歸正，奈邇來各港嚴密，一船不許出港，縱有謀叛隱情，亦難通報。故非聯絡進發，疾行撲擊，安有自甘獻俘？坐待賊亡，竟在何時？在督臣滅賊之念實切！惜乎生長北方，水性海務非其所長；登舟之際，混心嘔吐，身體惟艱。所以前疏懇留督臣居中調度，蓋為此也。中有一、二視此畏途，未免低迴，以致督臣疑惑不決。臣雖庸愚，料敵頗效。前於康熙二（一作三）年間，海逆猖獗，皇上特差兵部中黨到閩，問臣機宜，當即決意攻廈門。時督臣李率泰亦以臣過於擔當，然兩島竟為臣克平。旋於康熙六年十一月，為「邊患宜靖，逆賊難容」等事具題，未奉諭旨，乃使逆孽於甲寅年有燎原之變。今鄭經雖死，留此餘黨，負踞絕島。臣丁年六十二，血氣未衰，尚堪報稱。今不使臣乘機撲滅，再加數年，將老無能為。後更恐無擔當之臣，敢肩渡海滅賊之任！是以臣鰓鰓必滅此朝食。惟是臺灣殘孽未殲，故設許多鎮營官兵，糜費錢糧，貽累生民。所設水師鎮營，原為航海搗巢之用。今就中挑選精兵二萬有奇、大小戰船三百號，儘堪破賊；可以無用陸師。倘相牽制，卒難成功。若陸師之中，間有勇敢效忠、熟練海務能將，容臣調選一、二，以為臂指，共勷大舉之需。伏思臣累受國恩，奉召晉京，即寵擢內大臣之列，豢養十餘載。今復謬荷起用，寸功未效，又叨更晉官銜，特賜御膳金榻！亙古未有受君恩如是也！即赴湯蹈火，臣志所不辭。倘荷皇上信臣愚忠，獨任臣以討賊，令督、撫二臣催趲糧餉接應；俾臣整頓官兵，時常在海操演。勿限時日，風利可行，臣即督發進取；出其不意，攻其無備，何難一鼓而平？事若不效，治臣之罪。臣樸質武夫，一片圖報微忱，惟知欽遵天語煌煌，責臣必破臺灣，克奏膚功。臣以君命為重，故當克盡臣節，不禁煩瑣，激切瀝陳；斷無浮言飾辭，冒昧於君父之前。伏乞皇上睿鑑，俯將臣疏留中，大賜乾斷決策，嚴旨速命！事必見效，民生幸甚！封疆幸甚！緣系密陳「欲靖海逆根株事理」，字多逾格，貼黃難盡。伏乞寬恩，全覽施行！為此具本，謹密陳請旨』。
十五夜四更，臺灣彗星再見於申卯方，至二十夜方滅。八月初一日申刻，復現於西方，光芒指北。至初五日酉刻，芒又轉指東方。初十夜二更，大小星數百墜下雞籠山。不日，守將總兵鄭仁、沈誠、副將黃明等病歿。其弁兵士，死者過半。
九月初一日，施琅統五營官兵船隻，就廈門開駕，至泉州海口臭塗，寄泊操演。又咨檄海壇、金門、銅山、興化各總兵、協鎮、營將以及聯絡趕繒等船，至平海衛會齊進剿。
十月二十日，施琅在平海衛接旨，有『進剿海逆，關係緊要，著該督、提等同心協力，催趲糧餉，勿致遲誤！前姚啟聖具題「功罪定例」，交與施琅遵行』。二十八日，又接旨：『若有可行機會，提督施琅等應遵前旨，統伊所派船兵，毋失機會而行可也』。琅連接旨意，進剿權咸歸己，遂咨請啟聖剿撫事宜，以便主決。啟聖覆以『賊之果否誠心投誠，難以逆料，未便遽行。遣官往撫，俟有機會……』之文。琅笑曰：『遣撫既不敢逆料懸揣，豈可虛縻錢糧？則當決計進剿』。但平海一澳土地荒蕪，所有井泉俱被沖壞；惟剩一井，又淤淺鹽澀，兵士雲集，取水惟艱。琅思昔日耿恭拜井，尚得甘泉。今我奉天子命平海，以救生靈，當效恭禱告。琅遂虔誠禱祝畢，令軍士將井淘淨，而泉水突湧。嘗之，其味清甘。日夜挑汲不竭，三軍是賴。遂勒石，名其井曰「師泉」（贊曰：海島已無泉，三軍幾斷煙！貞誠虔拜禱，汲引任回旋）。
十一月，琅因北風太硬，未敢進剿。令各鎮協營暫歸汛，自統船回廈。
十二月，啟聖以琅未敢渡海，查與劉國軒有舊好者革職副將黃朝用，即差往臺灣招撫，許其「不削髮，只稱臣納貢，照高麗、朝鮮事例」。至澎湖，見國軒。軒轉送過臺，其馮錫范、陳繩武總恃波濤，議未定。軒偵知琅撤兵各歸原汛，二十六日，亦回臺灣。
康熙二十二年癸亥（附稱永曆三十七年）正月，黃朝用見國軒、錫范等猶豫，無意投誠，連日辭回。劉國軒啟克塽：『和議大事，當遣能員入省報命』！洪磊舉天興知州林良瑞，材堪為使。塽加瑞總兵，改名林珩，同黃學、黃朝用往福州見啟聖；國軒囑珩密探船隻虛實。珩二十五日舟次遼羅，令快哨入廈報施琅，欲進見；琅卻之。二月初一日，黃朝用等船，泊惠安縣獺窟澳，馳報啟聖，聖令黃朝用同林珩等馳驛。初八日，到福州見啟聖。聖與喇哈達、金鋐禮待珩。會疏題報外，另知會施琅：遵剿撫之旨，以撫為善策。琅覆以『奉旨專征，撫不敢主。如果有真誠向化，當必遵制削髮』。啟聖等亦未能決，惟暫留林珩於貢院。十三日，劉國軒辭克塽，仍到澎湖調度防禦。但啟聖欲撫而琅欲剿，兩議未合。啟聖遂送黃學、林珩二人回臺。
四月十六日，澎湖狂風暴雨，濤湧翻天。次日，波息浪恬，一魚長二丈餘，四足，身上鱗甲金色，邊有火焰奪目，從海登陸。兵民見而異之。國軒率諸鎮暨澎湖安撫司陳謨等，各燒獻冥寶紙錢，金鼓送之下水。越三日，乘夜登山，死於百姓林英之廚下。天明，報國軒，軒令■〈疒〈癶上土下〉〉之（成功踞金廈，震動濱海。有問黃蘖寺隱元禪師曰：『成功是何星宿投胎』？元曰：『東海長鯨也』。再問：『何時得滅』？元曰：『歸東即逝』。辛丑，成功攻臺，紅毛望見一人峨冠博帶，騎鯨魚從鹿耳門遊漾而入。後功諸船果從是港進。癸卯年四月間，功未病時，有副將楊明夢成功寇帶騎鯨魚，由鯤身之東出於外海。覺而大異，與人述之。不數日，而成功卒。正符隱元「歸東即逝」之言。按隱元住黃蘖寺，德行精修。曾遣其首座報師過日本國。至港口，舟覆而死。越歲，元往。將至港口，夢首座領眾來迎。次日，風浪大作，群魚千萬。船眾咸恐慄，共請於元。元曰：『毋慮』！令侍者出紙筆書「免朝」二字於水仙門外焚之。頃而風息魚散。元居日本，國中人奉如活佛）。
五月，施琅以平海甘泉之湧，臺灣可收之兆，是天之將亡鄭氏，宜乘機進剿，不可違時。遂密題疏曰：『為海逆形勢將滅，不可少寬，自解賊危事。竊惟臣奉命專征，調集舟師，俟機進發，總期必滅此賊而後已。茲正月十六日，准督臣姚啟聖送到會題疏稿「為選將挑船，安頓上風等事」，內開：「選其善識水性，勇往敢戰，挑趕繪船六十只，佔踞上風灣泊。出其不意，直鼓奮擊，俾其驚疑莫定；則洋販無資、糗糧不給，一、二年間剿撫皆宜……』等因到臣。臣聞之，不解其意。督臣凡所有會同章疏，未嘗移稿議定，先已列名入告，然後知會，故臣不得不瀝陳緣由。照臺灣逆孽情形，臣籌度之甚悉。自去年出海，至十一月杪，各官兵船隻方得齊集平海衛澳；取給糧餉，僅領至十二月止。惟官兵渡海應得俸餉，必須預備隨帶。臣在平海，舟師時駕，出洋操演。若風可進，即直取澎湖；若風未便，則仍獲收回。故於十二月二十三日出洋，忽轉東南風，乃止。二十七日開駕至青水墘，風輕又轉東南順風，再收平海。雖未及直抵，使官兵屢涉汪洋之中，衝風顛浪，愈練慣熟，賊聞知亦自驚惶不暇。蓋大■〈舟宗〉之船，必藉風勢順利，自可直搗賊境，始克成功。若風勢未順，零星不齊，何能協力撲剿？茲於正月初七日據臣署左營中軍守備黃復謙報稱：「初二夜有原偽將劉秉忠等，在澎湖挈眷八十二名口，駕雙帆船一只，前來廈門投誠」……等情。據此，隨於正月十二日准同安鎮臣吳英咨送劉秉忠等到，臣詢問，據供：「去年五月間，劉國軒知我師往銅山，東南風進發，甚是驚慌莫措。後偵知撤回歸汛，劉國軒乃放心自回臺灣料理要口，將大小戰艘百號、賊眾七千餘名，交鎮將林陞、陳諒等，現在澎湖扼守。賊中人人思危，多有離叛之心」。口供在案。臣於本月隨將劉秉忠、洪貴二名，轉送督、撫二臣查訊去後；今督臣疏稱；「賊欲改砲船為洋販，聚眾耕種；請挑趕繒船六十只南北灣泊，一、二年間自然困疲，剿撫皆宜」。臣不解督臣如此主持不定，似非善策。臣今日水師齊集，在海操演，以制賊眾，譬若人焉：有扼其吭，氣將垂絕；一為稍松，即其氣舒而復起。矧以六十船之南北灣泊，北風，平海可灣；南風，則將軍澳、林景嶼豈可灣泊之處乎？臣之操演，所以俟機俟風進發。又屢奉溫旨：「進剿海逆，關係重大」。臣所統官兵二萬有奇，大小戰船二百餘號，責任甚重。大■〈舟宗〉舟師，渡海宜慎，不得不籌出萬全，豈敢輕舉妄動？又水師在海操演，皆出本分，行坐均各給糧，船兵又無額外添設之費。總以賊一日未滅，則臣一日未敢偷安。且此賊伎倆，臣熟籌深算。力任剿滅，矢志不移，寧敢有片語虛飾於君父之前？而督臣止欲仗趕繒船六十只可為困斃賊勢，誠恐一、二年後復張聲勢，其費力尤甚。臣素知海逆始終虛實：初時猶然疥癬；皆因彼時當道泛忽姑息，不亟攻治，養成廱疽潰壞，負抗四十餘載，荼毒數省，致煩聖慮，屢動大兵征討，縻餉不計。今若再一寬縱，又蹈前轍！故臣惟俟風信之便順，必無不破之理；斷不復遣此賊，以廑宸衷。緣系密題海逆形勢事理，貼黃難盡，伏乞皇上全覽乾斷，敕部議覆施行！為此具奏，謹密題請旨』！
劉國軒安設澎湖各島停當，集諸將商議戰守之策。林陞、江勝、邱煇、吳潛等皆願竭力死守，第患糧餉不足耳。軒遂公同啟克塽，塽下六官會議。錫范曰：『有土便有財……再勻派百姓車稅、毛丁等類』。國軒聞之，即飛啟云：『當今百凡皆出民間，五穀不登，米價騰貴，百姓困苦極矣。若再為搜括，恐人心搖動，則外侮立至。須出內帑或捐助，庶可萬全』！啟上，克塽示錫范。范曰：『兵原以衛民，民自應養兵。今內帑空虛，百僚蕭條，不取之民，將何所出』？鄭聰亦以范之言為是。克塽不能主決，拱手唯唯而已。上淡水通事李滄獻策，取金裕國，安撫司林雲為之轉啟。克塽令錫范問滄取金情由，滄曰：『從上淡水坐番邦小船蚊甲（蚊甲，番小船名）向東而行，行至方浪、石灣，轉北而南，溯溪直進，此水路也，可取金沙。陸路當從卑南覓社而入，內有強梁土番攔阻，須整師列隊，護而前行方可』。范允其議，啟塽。塽令監紀陳福，宣毅前鎮葉明統所部，護衛入番取金。明等至卑南覓社，見土番刺身箍肚，硬弓操槍，扼險以守，不得前進。即驅其土魁繞別路，到力踞社，連殺數番，亦不肯指其出金之處，無奈引還。鄭聰與智、明等牙爪顏臨、李郡、李靜等橫為肆虐，道路側目。禮官都吏林敷地見百姓不堪，上啟，有曰：『顏臨力能回天，道路側目！李郡奸能惑主，睚眥必報！李靜財足通神，犯之必死！……』等語。克塽批與錫范審報。雖諸公子關情，而懲儆頗各斂跡，百姓稍安。
五月十一、十二兩夜，臺灣有大星四、五箇從西北墜下，又有無數小星隨之。二十八日大雨傾盆，至六月初六日方晴。山川崩裂，溪澗沖陷，田園悉為沙壓。萬年州瀨口地方突有水牛一只，冒雨奔下海，漾過三鯤身登陸，由安平鎮過海；又從柴橋頭再跳下海，向大港出而死。
姚啟聖與施琅各執剿撫。萬正色陳「三不可行」，佐啟聖當撫；同啟聖合疏有云：『一曰、十年生聚，十年教養；況於數十年之積寇乎？二曰、汪洋萬頃之隔，波濤不測之險。三曰、彼船隻堅牢，水務精熟。……』之語。琅見主撫者眾，遂密陳可取疏曰：『為海逆有日蹙之勢、航船有可破之機，密陳情形，仰祈睿鑑事。竊惟臣奉命征討臺灣，於康熙二十年十月初六日抵任以來，一面整頓船兵，相機搗巢；並遣心腹三、四人，漸次密往臺灣、澎湖
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