侍郎何宗彦以吏科给事中张延登不署名，不得预；御史薛敷教、萧毅中、左光斗、李征仪、倪应春、彭际遇、张新诏等交章惜之。而礼科都给事中元诗教、兵科薛凤翔又屡驳，具如延登指；各归责于辅臣元从哲，从哲奏辨。俱不报。先是，国本之论起，庙堂益相水火。上颇厌恶之，斥逐相继；持论者益坚，乃一切置之高阁。方从哲独相七年，上喜其无能而安之；山东赵焕为冢宰，诗教又从哲门人，故其势尤张。已而邹之麟倡言：张凤翔为选君，必以年例处姚宗文、刘廷元；齐、浙遂离。之麟既被黜，其友夏嘉遇、魏光国、尹嘉宾、锺惺皆有才名，俱改用；而嘉遇素洁清，亦与众共摈。赵兴邦为兵垣，仍入礼闱；之麟、嘉遇遂纠之，并及诗教。言路合疏纠嘉遇，兴邦遽升京卿；御史唐世济助嘉遇攻兴邦，而元、赵之势衰。时廷议所喧持者唯禁道学一事，吏治、边防俱置不理。
泰昌元年（即万历四十八年也）八月己酉，起邹元标为大理寺卿。科臣惠世扬上言：『君子小人之进退，关系国家之治乱。然小人不退，则君子不进』；吏部尚书周嘉谟奏列建言得罪诸臣王德完等三十三人，于是、王德完、孟养浩、锺羽正、满朝荐等悉起部寺诸官。
壬戌，以侍读学士刘一憬、韩爌为礼部尚书兼东阁大学士，直文渊阁；仍谕内阁：特召旧辅叶向高。初，光宗践祚，逾月崩，未及用向高等；熹宗既即位，乃遣行人征之。
十一月，结事中惠世扬遇灾陈言，因参大学士孙如游荐高攀龙、刘宗周、孙居相、刘策、王之寀、陆大受等。
十二月，大学士方从哲致仕。从哲以红丸、移宫二案，台省交章论之；至是，归。
天启元年春正月，兵科给事中杨涟予告回籍。涟以移宫一案，御史贾继春侵之，涟因乞归。御史马逢皋上言：『杨涟何罪？无罪即功。功在安社稷，罪在攻大珰；罪珰未诛，而发珰罪者先作楚囚，君子退、则小人进矣』！二月，御史周宗建上言：『国家之治乱，由于议论之公私。皇祖戊申以后、沈一贯未败之时，在朝者岂无君子？而一杂以小人，则沈鲤可逐、郭正域可芟、察典可坏，大狱可兴；时则有钱梦皋、康丕扬为之首。庚戌、辛亥之交，在朝者岂无君子？而一杂以小人，则大贪之淮抚可保、极险之铨佐可阿、直节可摧、清流可放；时则有史记事、徐缙芳等为之首。壬子、癸丑之交，在朝者岂无君子？而一杂以小人，则学差可摈、考选可排、吏兵之诸事可日试以为尝、考察之把持可一纲以无阱；时则有元诗教、赵兴邦为之首：有如今日三咨并下，君子进庸矣。而臣窃为先事之虑者，以用人言之：如所引董应举、高攀龙、史孟麟、李邦华、熊明遇、魏云中等二十余人，类皆磊落奇才。如必借此相引，积横之贪邪，亦思梯架于月旦；穷凶之丑类，尚留春梦于余灰。将朝廷大公之盛举，翻作臣下市德之私缘：臣之所谓不得不虑也。以移宫言之：如方震孺、毛士龙等十有余章，阐发既明。在科臣，杨涟洁志远嫌，不难听召用于他日；台臣，贾继春质心爱主，何妨付定论于国人！若复侈谈羽翼、追忆几筵，欲扫疑端，愈僧滋蔓：又臣之所谓不得不虑也。臣请约言之：铨除在真品，毋容夹杂以同升；朝论在舆评，毋轻出言以佐斗：国家要以边事为首务，毋自起室内之戈！今日终以君德为大本，毋徒为将顺之节』！
三月，起刘宗周礼都主事、王之寀刑部主事、高攀龙光禄寺丞。
八月，给奉圣夫人客氏地。以陵工成，命叙录魏进忠；御史王心一、马鸣起、吏科给事侯震旸、倪思辉、朱钦相等先后纠之，降调有差。
二年春正月，起吏部郎中赵南星为太常寺卿。
三月，礼科惠世扬疏参辅臣沈漼借募兵之名为护身之术，阴使其党晏日华潜入大内诱刘朝等练兵，再见江彬之事；外戚郑养性厚募死士，有违祖制。不听。御史侯震旸亦以劾漼，调外。六月，刑部尚书王纪奏劾『辅臣沈漼巧能移人主之视听、力足倒天下之是非，交结权党、诛锄臣士；黄台瓜词已赋，同文馆狱将兴』。又曰：『臣指其蔡京，而漼不肯受；试取惠世扬、周朝瑞、魏大中、董羽宸等疏一一读之，则京之为京，隐括于此矣』！上以烦言责之。漼寻予告回藉，纪革职为民。
八月，以杨涟为太常寺少卿。
兵科给事朱童蒙疏劾都御史邹元标、副都御史周从吾建坛讲学、醵金立院之非。标等上疏自理，上优诏答之。工科给事郭与治复劾内有「比拟妖贼」诸语，上责其狂悖，夺俸。于是元标、从吾五疏乞休；元标即移家出城，遂予告驰驿去。翰林修撰文震孟上言勤政讲学之实，留中；庶吉士郑鄤疏促之，俱降调。太仆少卿满朝荐上言：『国事颠倒』，成于陛下者十之一、二，成于当事大臣者十之八、九』。疏入，除籍为民。
十一月，以赵南星为都察院左都御史。
十二月，以顾秉谦、魏广微为大学士，入阁办事。
三年二月，夺御史周宗建俸。南京御史徐世业劾宗建保举熊廷弼，宗建疏辨，词连郭巩，有『结交宫闱、献媚进忠』之语；中旨切责。
冬十月，以杨涟为右佥都御史，协理院事。
四年二月，推南京吏部尚书邹元标，中旨以衰老罢之。
夏四月，吏都尚书赵南星上言：『吏部四司，惟稽勋司一人，余司皆二人；以稽勋事寡也。然今日之稽勋皆储为文选、考功之用，宜就近推补司官，不拘资格，一省不妨二人』。引陆光祖调吏部吕坤、黄克念等同邑同司之例为言，上从之。于是南星调职方司、郎中邹维琏为稽勋，主外察。维琏与原任主事吴羽文皆江西人。羽文遂拘旧事求去，维琏亦不敢履任；刑科傅櫆疏侵之，羽文求去益坚，维琏亦上疏力辞。櫆复疏以佥都御史左光斗、吏科都给事魏大中交通故内监王安、中书汪文言；诏下言于狱，严讯之。光斗上疏自理，大略为：『櫆之意不利于稽勋有邹维琏、铨司有程国祥、吏垣有魏大中，故欲一网去之』；且指其冒东厂理刑傅继教为兄弟，布置窟穴。大中亦上疏辨；得旨：命大中赴任供职。御史袁化中、给事中甄淑相继为光斗辨。大学士叶向高请骸骨，疏曰：『臣十八疏乞归，皇上谓时艰主忧，臣即去何安！顾臣罪戾多矣，即如科臣傅櫆所论汪文言，实臣具题。左光斗、魏大中之善文言，尚属暖昧；而臣之用文言，则事迹甚明。臣取罪之故，当听公论；不敢妄辨，以滋纷纭。耿耿愚忠，窃谓言官之讦奏，衅不可开；驾帖之拏人，渐不可长。惟皇上罪臣一人而稍宽其它，于以释宫府之嫌、消缙绅之祸』。上慰谕留之。已而大中既莅任，复传旨诘责：大中、櫆情事未明，何得赴任？櫆乃上言明旨不宜二三，中旨恐开旁窃、纠近臣以自解。
七月，大学士叶向高予告回藉。向高再入相，政移忠贤；同事者更希意阿旨，向高动即掣肘。杨琏二十四罪疏上，忠贤恨刺骨；御史林汝翥忤珰，群珰围向高第索之。向高知时不可为，发愤决去；疏三十三上，后得请。
左都御史高攀龙纠劾贪污，御史崔呈秀落职回籍。呈秀巡按淮阳，有狼藉声；吏科都给事魏大中发其馈遗，攀龙因考察劾罢之。已而，呈秀以魏珰义子起用。
冬十月朔，有事太庙，辅臣魏广微不至；魏大中纠其无礼，指称惟奢安不拜正朔。广微深衔之，上疏自辨。御史李应升复疏纠之，谓广微不可见乃父于地下；广微见疏恚甚。广微父，魏允贞也；尝为谏官，得罪阁臣去。降吏科都给事魏大中、吏都员外夏嘉遇、御史陈九畴三级，调外。吏部尚书赵南星、左都御史高攀龙乞罢，许之；给事中沈惟炳疏救不允，亦调外。时推山西巡抚，南星以太常卿谢应祥沈静有为，欲以处之，言于员外夏嘉遇。嘉遇述其意于湖南道御史袁化中，化中深然之。及化中途逢大中，告以故：先是，应祥令嘉善，大中知其才守，遂会推焉。陈九畴有私恨，遂言应祥昏耄，大中以门墙私之；互相奏辨。有旨会勘；吏部坐台臣论人失实上，中旨以朋比切责之，降大中等。于是南星、攀龙皆引罪去；大学士韩爌力救，不听，引疾归。已而刑部尚书乔允升、吏部侍郎陈于庭、都御史杨涟、左光斗、太常卿谢应祥、部属张光前、邹维琏、科道袁化中、许誉卿等一时尽黜，部署皆空。户科给事中陶崇道上言：『诸臣各执成见，不无异同；尤望皇上尽入陶镕，化其畛域。而天语频烦，责以朋比；彼此之互异既章，水火之情形立见。虞廷黜陟，不过贤奸；唐，宋末流，可为殷鉴』！疏入，降调。
十二月，起徐兆魁为吏部左侍郎，朱童蒙、郭允厚、李春煜太仆寺少卿，徐大化、吕云鹏、孙杰大理寺寺丞，霍维华、郭与治、杨维垣等皆科道。以御史梁梦环追论，复逮汪文言。自是罗织靡已，杨涟、魏大中相继毙于狱。御史蕃疏劾辅臣朱国祯。时韩矿既去，魏广微未得为首辅，嗾蕃劾之。
五年秋八月，御史张讷请废天下书院，杀熊廷弼。初，杨、左事起，以移宫为案；但属杨、左，与顾大章等无与也。已复改为封疆；周朝瑞曾疏荐廷弼，而顾大章与杨维垣相疏辨，与杨、左又无与也。乃以封疆牵入移宫，于是一网尽矣。
七年八月，上崩，无嗣，遗命以信王入继大统。诛魏忠贤、客氏，其党相继伏法。
冬十月，吏科都给事中陈尔翼上言：『东林余孽遍布长安，每欲因事起衅，忧不在小；乞敕下厂卫严缉禁之』。上曰：『群臣流品，先帝澄汰已分。朕初御极，嘉与士大夫臻平康之理，毋事揣靡形影，以滋争竞』！
十一月，户部员外王守履劾崔呈秀荐旧辅韩爌；上以韩爌清忠有执，下所司知之。
崇祯元年春正月，翰林院编修倪元璐上言：『臣入都，邸抄凡攻崔、魏者，必引东林为并案，一则曰「邪党」、再则曰「邪党」；夫崔、魏而既「邪党」矣，向之劾忠贤、论呈秀者，又邪党乎？虚中言之，东林则亦天下之才薮也。其所宗主者，大都秉清挺之标，而或绳人过刻；树高明之帜，而或持论太深。此之谓非中行则可，谓之非狂狷则不可。且天下之议论，宁涉假借而必不可不归于名义；士人之行已，宁任矫激而必不可不准诸廉隅。自以假借矫激深咎前人，而彪虎之徒公然毁裂廉隅，背叛名教矣！连篇颂德，匝地生祠。夫颂德不已，必将劝进；生祠不已，必且嵩呼。而人犹宽之曰「无可奈何」。嗟乎！充一无可奈何之心，又将何所不至哉！议者能以忠厚之心曲厚此辈，而独持已甚之论苛责吾徒，亦所谓悖理者矣！今大狱之后，汤火仅存，恩纶酌用。乃任事诸臣犹以「道学封疆」四字持为铁案，深院报复；臣窃以为过计也。水落石出，正人相见。既属崔、魏之异已，即可化牛、李为同心。况年来借东林以媚崔、魏者，其人自败，不须东林报复；若其不附崔、魏又能攻而去之者，其人既已乔岳矣，虽百东林乌能报复哉！臣所谓方隅未化也』。与杨维垣互出疏相往复，上是其言。时元璐屡言事，大学士来宗道常曰：『渠何事多言？吾词林故事惟香茗耳』！时谓宗道清客宰相。
五月，御史袁宏勋劾大学士刘鸿训：『一入黄扉，扬扬自得；悏旬之闲，革职闲住无虚日。其最可异者，杨所修、贾继春、杨维垣夹攻表里之奸，有功无罪；而诛锄禁锢，自三臣始。且军国大事未暇平章，惟亟毁「要典」，谓水火元黄，是书为祟。今毁矣，水火元黄息耶？战耶？未毁以前，崔、魏借之以空善类；既毁以后，鸿训又借之以殛忠良以暴易暴，长此安穷』！镇抚司佥书张道浚亦讦攻鸿训；工科给事中颜继祖争之，且言道浚出位乱政，非重创不止，御史史范、高捷相继弹鸿训，鸿训寻以事罢归。
十一月庚申，会推阁员吏部侍郎成基命、礼部侍郎钱谦益等。礼部尚书温体仁讦谦益天启初主试浙江，贿中钱千秋，不宜枚卜。上召廷臣及体仁、谦益于文华殿，质辨良久。上曰：『礼仁所参神奸结党，谁也』？曰：『谦益党与甚众，臣不敢尽言；即枚卜之典，俱自谦益主持』。吏部给事中章允儒曰：『体仁资浅望轻，如纠谦益，欲自先于枚卜也』！体仁曰：『前犹冷局；今枚卜相事大，不得不为皇上慎用人耳』！允儒曰：『朋党之说，小人以陷君子，先朝可鉴』！上叱之；下锦衣卫岳，削籍。礼部以钱千秋试卷呈，上责谦益，引罪而出。旋回籍，除名为民；下千秋于刑部。周延儒曰：『自来会推，会议皆故事，仅一、二人主持，余无所言；即言出而祸随之矣』！上大称善，遂停枚卜，卒用延儒。延儒力援体仁，明年亦入政府。初，延儒以召对称
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