狱中自缢身亡，时年四十八岁。有司又弹劾削其爵士，诏令减掉一半封邑，于是改封为松滋县侯，食邑千户。
当初，元起在荆州，刺史随王起用元起为从事，别驾庾荜坚持不同意，元起怀恨在心。大军已经到达京城，庾荜在城内，非常害怕。当京城安定下来后，元起先派人去迎接庚荜，对人说：“庾别驾如被乱军杀掉了，我无以自明。”并厚礼相赠。少时又曾到他的西沮田舍，有沙门上门乞讨，元起问农人：“有多少稻？”回答说：“有二十斛。”元起全部施舍了，当时人们称之为大度。
元起初为益州刺史，路过江陵迎接其母，其母信道教，刚居馆，不肯出。元起拜请同行。其母说：“贫贱家儿忽得富贵，怎么可能保持长久，我宁死也不能与你共罹祸败。”元起到达巴东，闻蜀叛乱，让蒋光济卜筮，遇蹇，喟然叹曰：“吾岂邓艾而及此乎。”其后果然如卜筮所言。儿子邓鉴继承。
陈朝吏部尚书姚察说：“永元末年，荆州方未有..，萧颖胄统领全楚之兵，首先响应义举，难道是天之所启，人..之谋？不然，为什么响应依附的那么果断。颖达叔侄庆流后嗣，夏侯、杨、邓都享隆名，非常兴盛。详之谨慎忠厚。杨、蔡廉节，君子各有所取。”
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