微生物天然药物化学研究

第一篇天然产物活性成分的发现

第一章真菌培养/2

第一节微生物次级代谢产物/2

第二节真菌的培养/4

第三节真菌分离培养研究实例/12

第二章提取分离方法/25

第一节微生物活性成分的提取/25

第二节微生物活性成分的分离/26

第三节活性成分提取分离研究实例/33

第四节手性分离/36

第五节手性化合物拆分研究实例/40

第三章天然产物的结构鉴定技术/43

第一节常规波谱解析方法/43

第二节量子化学计算方法/51

第三节化学方法/60

第四节晶体衍射方法/64

第二篇天然产物活性的虚拟筛选

第一章基于分子对接的虚拟药物筛选/77

第一节虚拟药物筛选背景/77

第二节靶点蛋白质结构的获得方法和途径/78

第三节基于分子对接的虚拟筛选常用软件和天然产物数据库/81

第四节化合物活性的实验性验证方法/84

第五节天然产物活性成分的虚拟筛选和分子对接/86

第二章天然产物蛋白质共结晶技术/94

第一节分子克隆技术和原理/94

第二节重组蛋白的分离纯化技术及相关原理/97

第三节蛋白质结晶技术与原理、蛋白质共结晶技术/98

第四节研究实例：甘草次酸与11βHSD1重组蛋白共结晶/101

第三篇活

性

筛

选

第一章化合物活性在细胞水平的筛选及检测/112

第一节原代及传代细胞培养/112

第二节细胞给药处理/115

第三节化合物的细胞毒性检测/116

第四节细胞中相关酶活性检测/119

第五节细胞中相关蛋白水平检测/122

第六节细胞中相关蛋白转录水平检测/125

第七节细胞中蛋白间相互作用水平检测/129

第八节细胞中相关蛋白质亚细胞定位分布检测/132

第九节FRET技术/134

第二章活性化合物在小鼠体内作用效果及机制/137

第一节小鼠饲养及动物模型选择/137

第二节小鼠给药方法/149

第三节小鼠行为学检测/153

第四节小鼠血样及组织取材/158

第五节小鼠脑内神经元电生理检测/160

第六节小鼠组织中相关酶活性、蛋白质水平检测/166

第七节组织形态学检测/166

第四篇天然产物活性成分的全合成、仿生合成和结构修饰

第一章天然产物全合成/180

第一节天然产物的结构确认/180

第二节天然产物结构修正/185

第三节天然产物样品制备/190

第四节丰富有机化学理论/197

第二章天然产物的仿生合成/203

第一节细胞松弛素的仿生合成/204

第二节Hyperjaponols

A—C的仿生合成/208

第三节Homodimericin

A的仿生全合成/211

第四节天然产物paeoveitol的首次仿生合成/212

第五节一锅法全合成具有复杂环结构的portentol/213

第三章天然产物的结构修饰或简化/215

第一节简化分子结构和增加代谢稳定性/215

第二节减少手性碳原子/216

第三节增强活性/217

第四节改善物理化学性质/218

第五篇天然产物生物合成

第一章绪论/228

第一节真菌天然产物合成通路研究/228

第二节基于合成生物学的新天然产物的发现/240

第二章真菌基因组DNA的提取/247

第三章真菌总RNA的提取及逆转录PCR/253

第一节真菌总RNA的提取/253

第二节逆转录PCR(RTPCR)/255

第四章基因克隆及敲除盒的构建/258

第一节基因片段扩增/258

第二节基因敲除盒的构建/261

第五章丝状真菌原生质体制备和转化/264

第一节丝状真菌原生质体制备/264

第二节基因敲除盒的原生质体转化/267

第六章生物合成基因的异源表达/273

第一节双酶切法表达载体构建/273

第二节InFusion技术载体构建/278

第三节Golden

Gate技术构建表达载体/281

第四节表达载体的酵母转化/283

第七章天然产物体外酶促生物转化/287

第一节大肠杆菌中蛋白过表达和纯化/287

第二节酵母中蛋白过表达和纯化/290

第三节异戊烯基转移酶(PT)生化功能的鉴定/292

第四节化学酶法合成/295

第六篇真菌次级代谢产物来源药物的研究开发

第一章从真菌中开发新药的方式/301

第二章真菌次级代谢产物来源的新药研究开发的阶段/306

第一节新药研究阶段/306

第二节新药开发阶段/307

第三章真菌次级代谢产物来源的新药研究的方法及需注意的问题/310

第一节真菌次级代谢产物来源的新药研究过程/310

第二节真菌次级代谢产物新药研究中需要注意的问题/311

第四章真菌次级代谢产物来源的新药研究的实例/313

第一节新药芬戈莫德的研究开发/313

第二节从土曲霉次级代谢产物中发现抗阿尔茨海默病活性的先导化合物/323