知以下委令十二人赴軍前差遣。又以蕩平之後，凡撫卹百姓、築立城垣，宜大臣督其事。于是奏請巡撫徐嗣曾渡臺灣。徐嗣曾至軍營，而首逆適就擒。將軍福康安因以北路民事委之經理焉。
丙子（十三日），將軍嘉勇公福康安統領大兵南下。先是普爾普領兵由嘉義至郡城，道經灣裡溪、鐵線橋，賊眾聞風歛跡，皆走匿大武隴山內。至林爽文被擒，大武隴賊目許大花等聞之，挈黨投出。而林爽文之弟林勇，先在大武隴與莊大田協力窺郡城，既聞大兵已定北路，黨羽皆渙散，乃罄其所掠財物，糾集餘黨據大武隴隘口。北路賊目蔡福及葉省妻黃玉娘等亦逃走南路，與之合力，思阻險自固。丁丑（十四日），將軍福康安分兵三路南下：普爾普由大排竹進山趨大武隴北面，鄂輝、許世亨由哆囉嘓、洗布埤迆西沿山搜捕，將軍福康安、參贊海蘭察統領大兵由灣裡溪、鐵線橋進兵。防守鹽水港總兵梁朝桂亦隨大兵南下。己卯（十六日），師次牛莊，賊目蘇魁、陳獻瑞率眾阻官兵。官兵射蘇魁殺之，生擒陳獻瑞等，戮于軍。
壬午（十九日），將軍福康安、參贊海蘭察直抵南潭。福州將軍常青、江寧將軍永慶、廣州副都統博清額、南澳總兵陸廷柱，皆領兵自關帝廳來會。而湖南總兵尹德禧、副將伊常阿、參將張宜淑、遊擊王希章、都司王朝佐、守備尹尚榮、陳綸、田武、千總以下二十六人，兵千名，亦由鹿港登岸陸續至軍。
初，常青聞將軍福康安東渡，自陳無功，請去將軍名號，以一事權。上以常青駐南路久，而福康安方經營北路，不欲遽加貶削。至是北路大定，福州將軍恆瑞坐逗留鹽水港革職，乃責授常青福州將軍，摘去雙眼花翎。
將軍福康安之定北路也，南路賊目皆氣沮。有民人數十至關帝廳請常青用兵。時關帝廳軍營兵不過三千，常青猶豫不能決。會總督李侍堯遣連江遊擊梁上掄、興化都司譚綸邦帶兵千人至營，常青致書將軍福康安，請帶兵二千人靖南路。將軍福康安以南路兵日久力疲，恐不得當，損威望，乃覆書令其審度形勢，毋輕進。會上亦嚴諭常青防海口，不責以兵事，常青南下之議遂止。
將軍福康安既至南潭，與常青晤，仍以府城委之防守。檄令江寧將軍永慶、廣州副都統博清額、總兵陸廷柱分守打鼓港、竹枝港。
有義民首鄭其仁者，先隨丁朝雄收復東港，擒賊目吳豹送郡城伏法，奉旨賞守備職銜。至是遣人至軍前，報收復枋寮捷音。將軍福康安遣臺灣府知府楊廷理馳往枋寮撫慰新附，並遣張芝元、許廷進帶廣東兵五百人隨往。
癸未（二十日），大兵發南潭，參贊鄂輝以兵來會。初，鄂輝與普爾普分路搜勦大武隴賊巢。鄂輝攻本縣莊，克頭社，轉戰皆捷，至大武隴河。普爾普亦克大武隴隘口。賊目莊大田、蔡福等由內山南走水底寮。普爾普復自大武隴北面深入內山搜勦餘匪。將軍福康安即令留守大武隴。鄂輝亦自大武隴南面入山，沿山搜捕，至大林莊出山，與大兵會。戊子（二十五日），大兵次下埤頭。
先是知府楊廷理奉令招撫枋寮，既至，鄉民皆出莊迎謁，意甚恭。楊廷理遍加慰勞，並令偵莊大田蹤跡，立功自效。于是楊廷理留宿莊中。夜半，枋寮賊陳昆、葉娥等復劫莊眾謀拒官兵。楊廷理聞變，單騎馳出莊，得免。有把總嚴廷選者，帶兵百人隨往，遇變皆死之。義民首鄭其仁亦死于亂。
參贊海蘭察既至下埤頭，聞之大怒，即率侍衛巴圖魯直抵枋寮，與賊遇，橫沖賊陣，賊不能當，射賊目陳建平殺之，賊皆潰走。官兵乘勝追之，斬首數千級，擠于海死者不可勝計，生擒賊目藍九榮等，戮于軍。賊目莊大田在水底寮，聞之，竄走瑯嶠。瑯嶠在鳳山極南，邊海，內通傀儡番社，山峻林密，道路險惡。
二月丁酉（初四日），大兵次風港。將軍福康安重賞瑯嶠各社番眾，令其堵緝內山隘口。戊戌（初五日），大兵發風港，穿林越箐，自黎明至日午，行三十里。凡遇隘口，皆留兵守之。賊眾伏密箐內，見官兵至，自山澗內突出，殊死拒。前鋒侍衛博斌、副將岱德、參將張朝龍等迎擊之，賊卻，官兵乘勝追之。至柴城，官兵四面圍逼，賊眾往來衝突，不能脫。知事急，皆相率投海。
初，將軍福康安遣侍衛烏作哈達領水師兵由海上抵瑯嶠。至是齊至，遇賊投水者，放鎗砲擊之，賊屍浮海面者無算。賊目莊大田知不可脫，率眾賊棄械竄伏山谷。官兵分途搜緝，生擒賊目莊大田、大田之弟大韭、許光來、許尚、簡天德、並大田之母黃氏。其義民、番眾擒獻者，林漢、陳才等又數百人。將軍福康安遣總兵袁國璜檻送莊大田等至府城，遣烏什哈達沿海搜查逸匪。乙巳（十二日），大兵凱旋，至東港。丁未（十四日），至山豬毛。
初，山豬毛義民團結鄉眾拒賊，上嘉其義勇，御賜褒忠扁額，鄉民建亭奉之。將軍福康安親至亭下招義民首慰勞之。
庚戌（十七日），至府城。府城紳民皆至三十里外設香案迎大兵，夾道歡呼。人人自慶。
將軍福康安既至府城，戮賊目張邦光等四百餘人於市。令普爾普械送莊大田之弟大韭、大麥、偽副元帥許光來、偽參軍簡天德、偽靖海侯許尚、偽先鋒陳牙、偽左將軍林漢至京伏法。惟莊大田傷重垂斃，僇于市，以首送京師。又擒林勇于大武隴，擒蔡福並莊大田之子天義、天勇、孫阿莫、婿楊由、並其妻女于灰窯。賊目劉升、陳秀英、鄭記、陳天送、嚴煙等皆先後就擒解京伏法。葉省妻黃玉娘亦就擒，戳于臺灣市。大田幼子天畏逃至嘉義，至六月內，效用知府錢受椿訪獲之，械送內地。林爽文、莊大田黨羽盡矣。其投誠賊目陶烏等幾百人，奉旨貰其死，分各省安插。惟董喜隨林爽文逃至番界，或云已為生番所戳云。
南路捷聞，上大喜，賞擒莊大田之功，六十七、德成、額岱德、王宣、王德俊皆賞號巴圖魯，加賞銀百兩。
三月乙丑（初三日），奉旨逮問陸路提督兼臺灣鎮總兵柴大紀于京師。柴大紀自守嘉義以來，上念其守城之功，眷顧優隆。既聞其在總兵任內，婪臟負職，多劣蹟，不稱任，而工部侍郎德成亦上言柴大紀營私玩寇。維時革職提督任承恩在刑部獄，上詔問之，其對如德成言。上知大紀所犯皆實，乃詔總督李侍堯、將軍福康安查明指參，以高廉總兵梁朝桂為陸路提督，轉汀州總兵普吉保為臺灣總兵。旨下，將軍福康安方統兵在鳳山，遣郎中長齡至嘉義逮大紀至郡。至凱旋郡城，同成都將軍鄂輝等以所犯面鞫之。大紀不能隱。又問大紀之弟大經，並經其家人林道清、巡捕官鄭名邦等皆言大紀縱兵市易，廢弛營伍。又挑補兵弁，皆以利進，及林爽文將作亂，畏賊回郡城各情，皆有徵。獄具，上聞。于是籍沒其家，逮大紀于京師，伏法。福州將軍常青坐不能糾舉，革職回京聽旨。
將軍福康安以臺灣大定，撤回防守南北兩路各征兵，凱旋內渡。參贊超勇公海蘭察率巴圖魯侍衛先由鹿仔港內渡。又分派諸軍，以次渡海。由鹿耳門配渡者，廣州駐防兵為第一起，都統博清額領之；次杭乍駐防兵，將軍永慶領之；次貴州兵，總兵許世亨領之；次廣西兵，副將巴爾布領之；次廣東兵，總兵陸廷柱領之。由鹿仔港配渡者，四川屯番兵為第一起，總兵穆克登阿領之；次湖南兵，總兵尹德禧領之；次福州駐防兵，協領海興阿領之；次浙江兵，副將詹殿擢領之。其在北路凱旋廣東官兵，則總兵李化龍領之。而福建水陸各官兵，除挑留戍兵外，分四起內渡。惟留廣東兵千人，命總兵張朝龍領之，鎮撫地方。至五月，內渡官兵以次凱旋。
于是將軍福康安籌計善後事宜，謂致亂之源，不可不究也。乃劾福建按察使李永祺、臺灣道永福先治楊光勛之獄不能盡根株，罪宜除名；而永福又受屬官金，與柴大紀同官不舉其罪，罪加重焉。臺灣縣知縣王露、權嘉義縣知縣陳良翼亦以餽永福金坐革職。又以海口文武官以守口為利藪，其弊不可不除也，乃斷自乾隆四十二年以後，凡任臺灣有守口之責者追臟問擬各有差。于是添置汛兵千二百人，又添設都司以下各官領之。以斗六門巡檢移治大武隴，而設縣丞一員治斗六門。又移鳳山縣知縣治下埤頭，以下淡水巡檢移治鳳山。又自知縣以上皆以五年受代，使久于其職，無苟且心。凡所以為臺灣善後計者，既詳且備。乃以撫卹百姓、搜緝逸匪、添建城垣委之巡撫徐嗣曾，于五月庚午（初九日）自鹿耳門登舟內渡。臺灣平。
上嘉平臺灣之功，命為將軍福康安、參贊海蘭察、領隊大臣普爾普、舒亮、總督李侍堯、巡撫徐嗣曾建生祠于臺灣嘉義，以旌其功。又圖畫平定臺灣內外功臣于紫光閣，上親為製贊詞曰：
近著勦滅臺灣逆賊、生擒林爽文紀事語，以為伊犁、回部、金川三大事各有耑文，王倫蘇、四十二、田五次三事不足薌其功。若茲林爽文之勦滅，介于六者間，雖弗親大事，而亦不為小矣。故其次三事訖未紀勳圖像。而茲福康安、海蘭察等渡海搜山，竟成偉蹟，靖海疆，吁亦勞矣！不可湮其功而弗識。故于紫光閣紀勳圖像，一如向三大事之為。然究以一區海濱，數月底績，故減其百者為五十，而朕親製贊五十者為二十，餘命文臣擬撰，一如上次之式。
夫用兵豈易事哉？昔漢光武有云：『每一發兵，頭鬚為白』。況予古稀望八之年，鬚鬢早半白，而拓土開疆過光武遠甚，更有何異而為佳兵之舉？誠以海疆民命，不得不發師安靖，所為乃應兵、非佳兵也。然亦因應兵、非佳兵，幸邀天助順而成功速。此予所以感謝鴻貺，不可以語言形容，而又不能已於言者也。
昔人有言：『滿洲兵至萬，橫行天下無敵』。今朕所發巴圖魯、侍衛、章京等纔百人，巳足以當數千人之勇。綠營兵雖多，怯而無用，茲精選屯練及貴州、廣東、湖南兵得近萬人，統而用之，遂以掃巢穴、縛逆首。是綠營果無用哉？亦在率而行之者、為之理根倡首、有以鼓勵之耳。若福康安未渡海以前，臺灣綠營已共有四萬餘兵，何以不能成功，則無以率而行之者，豈不然哉！
且臺灣一歲三收，蔗薯更富。朕若微有量田加賦之意，以致民變，天必罪之，不能如是成功速也。後世子孫當知此意，毋信浮論富國之言，愛民薄歛，明慎用兵，庶其恆承天眷耳。
近日以宮商三百，逐章饜飫其義，竟如幼年書室學詩之時。然彼時但知讀其章句，而今則究其義味。因思釆薇、出車諸章，乃上之勞下，其義正，斯為正雅；祈父、北山諸什，乃下之怨上，其義變，斯為變雅。夫上勞下、可也，下怨上、不可也。何則？下之怨上，固在下者不知忠義，然亦必在上者有以致之，斯則大不可也。我滿州舊風，以不得捐驅國事死于牖下為恥。其抱忠義，較祈父、北山之怨上為何如？是則綠營之多恇怯思家，伊古有之，無足多怪矣。然為上者不可不存釆薇、出車之意，更不可不知祈父、北山之苦。如其一概不知，而但欲開疆擴土，是誠佳兵黷武之為。望其有成，豈非北轅而適越乎？故因為功臣圖贊，而申其說如此，以戒奕葉子孫，並戒萬世之用兵者。
大學士一等誠謀英勇公阿桂
勘外守中，未恆亮功。馳咨軍務，志每予同。歸朝襄贊，剪逆除兇。三登紫閣，福厚功崇！
去歲在山莊籌辦臺灣軍務，其時阿桂留京辦事。七月間，又命往河工會辦堵築事宜。是此次軍務，阿桂並未辦理。惟間有指示方略，諭令閱看，覆奏每多竟見相同。及後報捷之時，阿桂甫得差竣回京。是以一體予以議敘。且以班次在前，故列為功臣之首。
大學士三等忠襄伯和坤
承訓書諭，兼通清漢。旁午軍書，惟明且斷。平薩拉爾，爾曾督戰。賜爵勵忠，竟成國幹！
大學士王杰
典學七閩，肅正士風。臺灣民俗，頗悉心中。山海險夷，參畫具通。有佐樽俎，圖貌記功。
協辦大學士吏部尚書陝甘總督一等嘉勇公福康安
金川領兵，已著偉名。幾處封疆，吏肅政成。解圍擒逆，能人不能。崇封殊錫，嘉爾忠誠！
領侍衛內大臣三等超勇公海蘭察
勇弗知書，謀勝智士。匹馬彎弓，賊不敢視。欲致活口，射勿令死。進爵錫服，言難盡美！
工部尚書福長安
父兄及己，胥國勳親。英年習政，其心孔純。承旨參議，有見敬申。忠良之報，並得圖麟。
戶部尚書董誥
舊例軍務，多用清文。茲或用漢，綠營海濱。治以馬上，亦頗效勤。堪同福將，閣表書勳。
閩浙總督李侍堯
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