聞鳳山陷，飛檄調回郡城；而北討之議亦中止。
郝壯猷之復鳳山也，賊眾先回水底寮。鳳山衙署、民舍，賊焚之略盡。臺灣府經歷羅倫入城安民，而壯猷仍劄營東門外。明日，令參將瑚圖里領南路福寧兵六百人赴下淡水營，會同都司邵振綱往水底寮勦賊。
下淡水在鳳山東南六十里，東即山豬毛番社。雍正十一年，設都司一員，領兵三百名，駐劄山豬毛口，堵截生番。下淡水分港東、港西里，碁布一百餘莊，皆粵人。朱一貴之難，粵人李三直等糾義民拒賊，號為懷忠里，建忠義亭表其功。
林爽文南寇，臺灣道永福、同知楊廷理謀遣人赴下淡水招集粵民衛府城。有嘉應州舉人曾中立，掌教海東書院，願往。永福仍檄臺灣府教授羅前蔭、粵人劉繩祖隨之。曾中立等既至下淡水，而鳳山陷，即留寓其地。適賊首莊大田遣夥眾涂達元、張載柏等擾港東、港西里，招誘粵人。粵人不從，殺涂達元、張載柏。齊集忠義亭，選壯丁八千餘人，分為中、左、右，前、後及前敵六堆，設總理、副理事以資管束，推曾中立為主。
時乾隆五十一年十二月十有九日也。下淡水左右，三腳寮、冷水坑、姑婆寮、三腳窟及水底寮，皆賊巢。賊人棄鳳山歸，益負嵎為民患。瑚圖里至下淡水數日，株守無功。總兵郝壯猷檄令仍回鳳山。瑚圖里回至新園，賊人阻官軍，官兵死者數人，不能達。二月壬子（十四日），副將丁朝雄、遊擊蔡攀龍奉黃仕簡令，帶兵七百人自鳳山回郡城。郝壯猷恐兵單，又催調瑚圖里、都司邵振綱領兵至軍前聽遣。瑚圖里以賊人阻新園、萬丹辭，請發大兵接應。
三月壬申（初四日），遊擊鄭嵩、千總徐景慶、徐聯陞、邱安國、王奕魁、把總鄭日新、徐慶、吳必捷、外委許飛鵬、涂仕錄、陳必高、談有旺、湯貴、陳烈、黃振元、楊大斌等帶兵六百名接應瑚圖里。行至琉磺溪，賊眾先伏溪尾，乘官兵半渡，橫截官兵，四面圍逼。官兵驚潰，鄭嵩單騎潰圍出。時郝壯猷又遣兵三百人接應，始得歸。鄭嵩僅以身免，千總徐景慶以下十五員皆散失，或被賊害。瑚圖里聞援兵至，急赴九腳桶，而援兵先已敗績。見賊擁至，與戰，不勝，引退，兵丁死者十餘人。瑚圖里仍回下淡水。
甲戌（初六日），賊目莊錫舍領賊眾三千人，首犯鳳山營盤。郝壯猷歛兵入城內，屯城西龜山頂，分兵守城門。丙子（初八日）黎明，莊大田率大隊至，攻城。官兵發鎗砲禦之。賊佯退。日午，賊埋鍋造飯，官兵出城逐賊。賊復起合圍，官兵急退入城。賊以琉磺溪所得官兵衣帽著之，隨入。須臾，南門火起，賊攻城急。郝壯猷望見火起，單騎從西門出。官兵聞主將遁，皆潰，競赴打鼓港。賊急乘之，官兵擠于海死者大半。總兵郝壯猷、參將那穆素里、都司羅光炤、守備黃喬皆奪漁船逃回郡城。千總以下，盧思聰、廖朝興、林芳、施得陞、謝得明、姚登、許志興、林為瀚、劉天雲、黎士高等，先後逃回。遊擊鄭嵩、延山、陳元死之。有隨營同知王雋同經歷羅綸謀走打鼓港。王雋年老，足蹇不能行，被執，見莊錫舍，錫舍叱令跪，不屈，錫舍殺之佛頭寮。經歷羅綸脫歸。是役也，千總以下潰散無著者二十三員，兵丁三千，潰回者僅六百餘（後經將軍常青查明：陳亡官二員，甘瑞龍、江順寶；無著官十九員，柴景崗、高達、楊朝龍、朱光正、鄭希賢、潘朝培、俞成龍、周文錦、鄭朝梁、吳元照、袁正清、白大勇、李陞、廖鴻飛、王旺、劉其璉、余殿侯、鄭元彩，惟外委陳朝瑞陷于賊，至六月內逃回府城）。鳳山既陷，賊益猖獗不可制矣。
初，黃仕簡、任承恩領兵萬人渡海，兵勢甚盛。既而遷延兩月，無成功，民大失望。于是民間謠曰：『黃公大臣，提督軍門，一策莫展，寸步不行』。好事者書而揭之通衢。仕簡知而不問。由是上知二人不足恃，屢詔詢狀，二人皆飾辭奏，上切責之。詔江南提督藍元枚馳驛赴泉州署陸路提督事，令任承恩以兵事交普吉保內渡赴京。又詔湖廣總督李侍堯調任閩浙，常青以湖廣總督渡海督師，授革職山東按察使楊廷樺為臺灣府知府，隨常青之任。
正月甲申（十五日），藍元枚至泉州。二月乙卯（十七日），李侍堯至。丙寅（二十八日），常青發泉州，參將特克什布以兵五十人從。三月丁丑（初九日），湖廣總督常青至自泉州，而鳳山失陷已一日矣。常青賫諭旨詔提督黃仕簡至幕府聽宣，責以坐守郡城之罪。仕簡伏謝不能起。于是常青察勘情形，疏劾仕簡等。又請添調閩、浙、粵兵七千名。奏未發，而上已洞悉黃仕簡、任承恩株守之罪，有旨逮問矣。惟總兵柴大紀以保守府城功，賞戴花翎，暫署水師提督。又特授守備易連臺鎮左營遊擊，守備邱能成臺鎮中營遊擊，千總陳邦光北路協中軍都司，嘉其復諸羅、克彰化、守艋舺之功也。常青分送黃仕簡、任承恩回內地，聽總督李侍堯解京。戒副將丁朝雄監守郝壯猷候旨。
先是鳳山既陷，官兵鎗砲器械，盡為賊有，賊益橫。邀結北路大武隴、南仔仙賊目許尚謀寇郡城，又告捷于林爽文。于是三路賊眾皆合。常青患之，亟令道府浚溝濠，修城柵，獎勵義民以備不虞。
三月辛卯（二十三日），莊大田犯郡城小西門，桶盤棧官兵禦之，退屯上中洲。壬辰（二十四日），賊目陳靈光、謝檜率眾焚郡城東路新化里，掠竹篙厝，逼草店尾。乙未（二十七日），大武隴賊目許尚、陳聘率眾犯小北門、柴頭港，退屯洲仔尾。是日，林爽文遣其弟林永率眾千人至大穆降。郡城戒嚴。莊大田大喜。克期攻郡城，遣信告林永；林永許諾。于是遍戒眾賊目，皆曰『敬受令』。乙未（二十七日），莊大田攻桶盤棧，別遣其黨莊錫舍攻小南門，謝檜、陳建平攻草店尾，又分眾攻大東門，林水攻大北門，許尚、陳聘攻柴頭港，又分眾攻大北門。當是時，南北賊眾會合，號稱十萬。
總督常青聞賊至，命遊擊蔡攀龍固守桶盤棧，遊擊邱維揚、守備黃象新固守柴頭港，守備曾紹龍固守草店尾，而自佩弓弩赴大東門督戰。仍令守備王天植守小東門，參將那穆素里保護春牛埔城腳，都司羅光炤守小南門，參將宋鼎、左淵等防守大、小北門。齊集義民萬人出城助戰。
賊人環攻官兵，自黎明至日午，戰益力。官兵鎗砲齊發，賊旋退復進。遊擊蔡攀龍防守桶盤棧，與賊戰，賊兵東移，蔡攀龍亦引兵東；賊圍之，左右馳突不能脫，所乘馬被創倒地，徒步更戰。常青在城上見之，令參將特克什布馳兵往救，蔡攀龍亦引兵回擊，圍始解；把總余典、王澤高戰死，兵丁死者一百餘人。賊目謝檜等又壓小東門城腳縱火，守備王天植急擊救滅。維時義民將萬人，見官兵與賊戰竟日，賊不退，飢疲無人色，皆退入城，城中大擾亂，謂賊已破城，皆逃至海口。無何，賊目莊錫舍投戈請降，單身入城見常青。常青大喜，立予錫舍六品頂帶，賞銀二百兩，仍令錫舍出城擊賊立功。莊大田戰正酣，聞錫舍降，大駭，恐變生，急收眾回南潭。林永、謝檜、許尚等聞莊大田退，亦解去。
莊錫舍，晉江人，渡海家鳳山縣埤頭莊。林爽文倡亂，莊大田糾漳人，莊錫舍糾泉人，其勢相埒。繼而共推大田為主，凡號令皆大田出，錫舍已不能平。自再破鳳山，錫舍力居多，益負功不相下。錫舍有親屬充臺灣道吏，通信往來不絕，大田疑之，使人諷錫舍以所隸泉人歸大田，而以漳人歸錫舍。錫舍益恚。臺灣道永福聞其相猜忌也，囑其親屬以書招降。錫舍諾。至是果降。
莊大田既退，錫舍請赴南路竹滬招集義民，絕大田歸路。常青猶豫未許，知府楊廷樺力保其無二心，乃從之去。
四月戊戌朔，大武隴賊許尚等再攻柴頭港，遊擊邱維揚禦之，維揚中飛砲死，賊亦敗退。于是眾賊皆知郡城有備，終不可破矣。
初，總督李侍堯至泉州，因官兵勢分力弱，賊勢浸浸日盛，而常青先渡臺灣，惟帶兵五十人，兵力又不足辦賊，即移會兩廣總督孫士毅，密挑健兵四千備征調。于是孫士毅調廣東南澳、澄海、海門、平海水師兵二千名，選參將趙勇、廖光宇、都司麥瑞、殷佐良、守備林世春、千總、把總二十五員領之；調督標、提標香山、碣石、肇慶陸路兵二千名，選副將貴林、官福、謝廷選、遊擊雙德、李文昇、許廷進、都司王雄、蕭應德、杭富、曾燁、劉振唐、守備盧振雄、楊拜颺、嚴文奎、虎彪來、成基、陳上高、千總、把總十六員領之。皆至潮州聽命。而南澳鎮總兵陸廷柱先任臺灣總兵，自請行。孫士毅許之。至是常青請兵信至，總督李侍堯即以所備廣東兵檄陸廷柱管帶逕渡。又咨浙江巡撫琅玕、提督陳大用調溫州、黃巖兵三千名，以符常青所請兵七千之數。
無何，詔授湖廣總督常青為將軍，福州將軍恆瑞、陸路提督藍元枚為參贊大臣領兵渡海。又命廣東高廉鎮總兵梁朝桂馳往軍前，與陸廷柱分領粵兵。又詔總督李侍堯親至廈門、蚶江照料軍行。于是參贊恆瑞、協領豐申布、海興阿、色普興額、防禦札克丹、奇成額、佐領札魯永文、伊爾哈圖等，帶領驍騎校前鋒領催甲兵一千餘人至廈門渡鹿耳門。浙江溫州總兵魏大斌、副將詹殿擢、遊擊董秉燦、千總、把總十一員，兵一千名，亦至廈門渡鹿耳門。又分遣遊擊裴起鰲、都司田智、守備丁士偉、魏際隆、千總、把總二十四員，兵二千人至蚶江，隨參贊藍元枚渡鹿仔港。
初，莊大田圍府城急，常青日夜督將士堵禦。見將士不足恃，並疏請侍衛巴圖魯八員到軍前領兵。維時颶颱大作，自三月以來，幾二旬不得內地文報。常青盼望援兵，至廢寢食。四月丁巳（二十日），詔至臺灣，常青拜受將軍之命。又聞恆瑞、藍元枚授參贊，領大兵將至，心乃安。而廣東先調兵四千已連檣並至矣。兵勢大振。
有旨治失陷鳳山之罪，殛郝壯猷于臺灣市。參將那穆素里以下逃回各官，悉革職留軍前效力。總兵柴大紀、普吉保戴罪圖功，以責後效。
初，常青檄總兵柴大紀合鹿港官兵攻斗六門，通南北道路。柴大紀不可，辭曰：『諸羅見兵不過千餘，今棄縣城率兵輕進，賊人必乘虛攻縣。縣城萬有一失，其誰任此咎？某以為應分兵三路：一從他里霧出虎尾溪至大里杙；一從大埔林出斗六門向東，由石榴班、水沙連至南投；再令普總兵由鹿港出東西螺至石榴班合兵。三路並進，賊應接不暇，乃可圖也。然諸羅兵單，惟將軍亟發兵助之』。常青以大紀言告臺灣道府，皆曰：『宜如柴總兵言。』四月壬子（十五日），參將潘韜、守備曾紹龍、黃象新帶水師金門兵一千一百人往諸羅，從柴大紀之請也。癸丑（十六日），師次木柵，道阻，改由鹿耳門覓海船取道笨港至諸羅縣。
維時諸羅南至府城，北至鹿港，賊巢數十，時出劫掠。柴大紀患之。命孫朝亮帶兵一百人駐笨港，蔡朝頒帶兵二百人駐麻豆。笨港在縣東北二十里，上達鹿港；而麻豆則縣南府北適中之要隘也。
柴大紀接將軍常青檄促進兵，上書曰：『四月十二日，有從賊兵丁林盛、許高升詭赴軍前投到，某訊得其實，即問林爽文所在。據云：林爽文現在牛稠山，與軍師董喜謀約南路賊攻諸羅。某若領大兵北指，賊人聞風必竄歸，捕之益難為力。不若速飭普總兵帶鹿港之師前來會合，絕賊人歸路。若首逆就擒，則餘匪不攻自散矣。又諸羅之南，賊匪阻絕糧道，把總蔡朝頒現屯麻豆，而兵單恐為賊乘，亦望將軍發兵五、六百人赴麻豆協勦，使諸羅、府城道路常通、緩急可恃，實為目前急務』。常青得書，飛檄總兵普吉保帶鹿港大兵至諸羅，與柴大紀合兵擒逆首，而仍檄革職守備黃喬救麻豆。
四月庚申（二十三日），黃喬帶鳳山潰兵三百名至大溪墘，賊眾聞之，自大武隴南下撲官兵，官兵不能進。有蕭壟、麻豆各莊鄉民聞官兵為賊阻，合眾出拒賊。賊退。官兵既至麻豆，賊益橫。黃喬不能守，屢書告急。常青檄總兵柴大紀就近援之。柴大紀遣遊擊楊起麟、李隆、守備黃象新帶兵八百人，並鹿仔草、鹽水港、下加冬、哆囉嘓各鄉義民隨往救麻豆。五月丁丑（十一日），楊起麟等至鹽水港，而麻豆已失守矣。
先是黃喬等偵知賊人將來犯，先領官兵、義民出莊西拒賊。賊忽從莊中出攻官兵。官兵驚潰，黃喬走回府城。千總盧思聰、外委姚登皆死之。戊寅（十二日），楊起麟等率師至麻豆，賊力拒官兵。官兵擊賊，死亦數十人。既聞黃喬兵已潰散，麻豆莊民多與賊通，復聞有賊二千人自糞箕湖出擾鹽水港，乃旋師。
遊擊楊起
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