。舁妇人舆至幕中，使乘向海岸登舟。呼江国论、郑元长来，国论等度不可免，强诺请行，亦赐赆舁舆送之去。继呼杜会三至，亦如之。盖廷珍欲遣解诸贼，预备三舟，委弁目在舟以俟。自幕府至海滨，分令亲随丁壮，沿途徙倚，密为防备。顺则善遣之行，逆则于幕内捆手足，闭舆中如妇人，不动声色，市井可无有知者。君英等巽顺以行，舟中亦善待之。至厦，总督满保奏报，奉旨解陈福寿、杜君英、会三赴京师，与朱一贵对质。朱一贵、李勇、吴外、陈印、王玉全、翁飞虎、张阿山俱凌迟处死，亲属同坐。陈福寿、杜君英、会三以就抚从宽，斩于市。其余在军前擒抚诸贼，先后解到厦门，如黄殿、黄日升、郭国正、刘国基、林曹、江国论、林骞、林琏、陈正达、卢朱、张岳、张看、郑惟晃、郑元长等，总督满保发臬司收禁福州府狱候审，拟就地正法。
十有一月已丑，台湾镇总兵官陈策卒。署提督蓝廷珍移咨总督满保，檄金门镇总兵官黄英之台署事。
庚寅，南路余孽复叛。为首■〈艹〈束刂〉〉 瓜成（即陈成）、苏清、杨美、林阿尾等，集众竖旗于石壁寮。随发南路兵追剿。癸已黎明，千把总何勉、杜雄等率兵捣贼穴，擒苏清、高三二名。成等奔溃。杨美、王教逃匿下淡水，知县刘先泗擒获之。
蓝廷珍以罗汉门诸山素为匪类逋逃薮，不大举搜捕，扫清岩谷，无以净尽根株。分遣游击王良骏、薄有成、守备吕瑞麟率兵从角宿、冈山、刈兰坡岭一路搜入罗汉门，守备闫威由仁武庄、土地公崎、阿猴林一路，守备李燕、蔡勇由卓猴、木冈社一路。已亥午刻，咸会罗汉内门之中埔庄。别遣把总林三、陈云奇、郑荣才、游宽往大武垄，分路堵截，无令贼窜。庚子，分兵深入搜捕。罗汉内门诸将备，分搜银锭山、佳白寮、东方木、南马仙等处。大武垄诸弁目搜礁巴哖、郎包米、大龟佛、大湖等处。穷山密箐，无不遍历，焚毁贼窼数十所。凡二十七日，乃收军回营。据搜山将备及差员外委苏思维、陈祥、李得胜、林福、石瑀、蓝敦等先后报获■〈艹〈束刂〉〉 瓜成（即陈成）、林阿尾、林丁、庄谋、林读、林齐、郑教、陈璞等。而石壁寮再叛诸孽，尽行廓清矣。又据报获郑文苑、林沙掌、凶死郡（即陈国进）、戆昆（即林昆）、■〈氵〈厂外〈亻鸟〉内〉〉仔吴（即李吴）、洪迎、胡君用等，及台厦道陶范获解萧斌、麻恩、金丝猴（即林玉）等。而朱一贵案内附和倡乱诸贼，悉数俘囚，惟王忠、邱宝宣未获，遁逃傀儡内山、台湾山后。蓝廷珍分遣外委弁目，诸路访缉。复令外委郑国佐、林天成召致山番通事章旺，同入傀儡内山，遍查各社，谕番众嗣后不许窝留。复令郑国佐往郎娇，绕行山后，至卑南觅，传檄奖谕大土官文结，以官带补服赏劳之，令起崇爻七十余社壮番，从山后大加搜捕，将所有汉人逸贼尽缚以来。于是王忠等不敢复入番界，只身窜伏，束手待毙矣。
前此台变逃回道府厅县各文员，朝旨令督臣、提臣会审，发往台湾正法，并已故知府王珍尸棺剖枭示众。武赋周应龙等，亦令督臣会同提臣严审定拟。署提督尚未班师，十有二月，总督满保在厦亲审诸文员，将原任台厦道梁文煊、同知王礼、知县吴观域、朱夔、知府王珍尸柩、委海澄营游击安奎，赍令箭押送之台，十月八日甲戌决于市。而台湾县丞冯迪、典史王定国、诸罗县典史张青远，俱羁台湾县狱候部文秋后处决。
广东提督姚堂奉旨调任福建水师提督，署提督蓝廷珍遣游击王良骏赍印赴厦，克期班师。总督满保以地方初定，檄廷珍以南澳镇仍统征兵，暂留在台弹压。
时廷议台镇总兵官移设澎湖，台湾府治设陆地副将，裁去水陆两中营，将备弁兵撤归内地另补。民间忧惶，不安寝食，宵小之徒，讹言复肆。康熙六十有一年春正月，差员陈祥、王仁和续获韩渊、林良等。蓝廷珍念讹言摇惑，会商陶范、高铎、孙鲁，以逆贼苏清等多人在狱，久留未决，恐不足震慑奸顽。二月二十有九日甲申，将苏清、林阿尾、王教、林读、林丁、庄谋、林昆、韩渊、林良诸贼枭斩示众。李吴杖死。杨美先一日病死。陈成、郑文苑等剧贼十数人，及续获之邱宝宣、江邦俊，悉解内地，与黄殿等俱禁省狱。候审拟归案正法。
朝廷以台疆僻处天外，民间疾苦，无由上达，特命满汉御史各一员，岁奉差到台巡视。以南澳镇总兵官蓝廷珍调镇澎湖。总督满保疏荐督标中军副将徐左柱调补台湾陆路副将。
三月望日庚子，南路下淡水奸民林亨等复谋作乱，以「合心王」三字为勘合，颁于其党。方贸帛制旗，欲夜举事，有密报者，守备陈一得率官兵捕之，擒林亨，搜得勘合及伪札，供称同谋为首颜烟、李咸、陈法、王帅、王禄等，分遣弁兵围搜大昆麓罟寮及北路铁线桥诸处，并获之。复有余孽百余人遁入诸罗后山小石门、得宝寮等处，夜出行劫。蓝廷珍密檄北路参将朱文、协防游击林秀发兵搜捕。遣署守备李郡、把总郑高、林时叶分三路并进，复遣把总庄子俊、苏思惟率兵往大武垄堵截，绝其窜路。夏四月戊午，诸军齐集会剿，贼已先一夜遁至三林港，焚汛，杀伤兵丁，夺商贩小船二，入海逃生。蓝廷珍飞遣水师将弁出洋追捕。闻报，在内地青水墘刦坐商船，至铜山洋面又夺坐小渔船；料为潮贼，将散伙登岸，必于樟林、东陇、鸿沟、澄海等处。在三林多有带伤，又从朱一贵作乱时皆割截发辫，易于稽察。星夜飞请总督满保、巡抚吕犹龙移檄粤东，令潮州镇、道、府、县密行查缉。仍差千总一员赴潮催提。尽获刘国华、邱阿路、张阿舜、赖日辉、林阿元、胡阿发、黄阿赤、黄阿五、巫阿盛、陈阿日等贼党五十七人，皆解闽审讯监候正法。
癸亥夜，又有奸匪百余人在八掌溪、小溪洲拜旗作孽，行至竹仔脚塘，杀塘兵陈楠、王亘、苏天贵等三名，比晓皆散，回家为民。廷珍飞调将弁，上下堵截搜捕，寂无踪迹。差员四路密访，并令营县广差侦探。知县汪绅文缉获叶枕、廖猛、赖兴、赖勤等，供指同谋聚众群贼。因遣兵搜捕北埔寮诸山。千总李郡生擒渠魁李庆，夺贼旗械，及所劫赃物，焚毁窼庐。又据参将朱文、知县汪绅文、守备刘锡、千总何勉、陈章、把总陈云奇及外委弁目人等，先后缉获黄潜、苏齐、张成、李延卿、张乌畅、潮边、王妙、何岁、张镇、朱昆生等剧贼四十余人，俱解内地，收禁福州府狱，候审拟分别正法。
五月，署台湾府同知兼摄台湾知县事孙鲁调补诸罗县知县。钦差巡台御史吴达礼、黄叔璥至自京师。六月，新授台厦道陈大辇、台湾府同知杨毓健、员外郎知台湾县事周锺瑄及副将徐左柱等，俱先后抵台视事。
有奸民郑仕者，绰号急烧疏，复讹言惑众，招集亡命，谋于六月乙卯夜竖旗，不果。蓝廷珍捕治之，得其党萧兴祖、李柯等数人。甲戊，并擒会汛，搜获郑仕家档栅，开列伪爵人数，一时旁观，多有骇愕状。知县周锺瑄密白镇道当堂烧毁，将郑仕等处死，人心大定。
蓝廷珍以副将既至，欲遵旨赴澎湖驻札，百姓嚣嚣罢市，环钦差御史、道、府、厅、县各衙门吁呈请留。而新旨已下，允提臣姚堂所奏，副将仍设澎湖，总兵官仍驻台湾，水陆两中营悉还旧制，道标守备弁兵裁归台湾镇管辖，安设南北二路适中要害之处。百姓欣欣，以手加额，欢声载道。
新调凤山知县靳树畹抵任，署县刘光泗仍归海澄。漳浦知县汪绅文安抚缉捕事竣，仍归漳浦。靳树畹染疫病，未几卒，以同知杨毓健摄凤山县事。
雍正元年春正月十有九日已亥，逸盗杨合复谋作乱。合骤闻圣祖仁皇帝升遐，未知新天子即位，乘间思逞，散札招邀匪类，谋犯郡邑。蓝廷珍、高铎遣外委千总陈椰等擒获之，穷治其党，悉解散。
二月，登极恩诏到台湾，万姓舞蹈欢呼，共庆太平。士农商旅，安心乐业，无窝匪接济之人，一二余孽，栖身靡所，饥饿待毙。
夏四月十有五日甲子，千总何勉在南路凤山林捉获王忠、刘富生、陈郡等，蓝廷珍遣解内地，听总督满保题达正法。朱一贵孽党尽绝矣。台湾平。
蓝鼎元曰：台湾治乱之局，迥出人情意计之外。其地方数千里，其民几数百万，其守土之官，则文有道、有府、有县令、大小佐贰杂职若干员，武有总兵、副将、参将、游击、守备、大小弁目若干员，其额兵七千有奇，粮储、器甲、舟车足备。又当国家全盛，金瓯靡缺，而朱一贵以喂鸭小夫，欻焉倡乱，不旬日间，全郡陷没，此岂智能所及料欤！太平日久，文恬武嬉，兵有名而无人，民逸居而无教，官吏孳孳以为利薮，沈湎樗蒲，连宵达曙。本实先拨，贼未至而众心已离，虽欲无败，弗可得己。然鹿耳、鲲身，夙称天险，郑氏一踞其间，遂历三世；国家图之数十年，费钱粮几百千万，而后能收之。今不动声色，七日恢复，巨魁就擒，孽从授首；即使孙吴复生，亦未敢望功成若斯之速也。良由圣祖仁皇帝德福齐天，神威远震，将卒用命，海若效灵，是以摧陷廓清，不劳而边疆底定。谕旨遥颁，白叟黄童，无不感激流涕，盖至仁厚泽，沦浃人心者深也。诸臣或运筹帷幄，出力疆场，克敌致果，功在社稷。欲以鼓励将来，收千秋百岁用人之效，则不得以其为日无几少之矣。乱不久，祸不深，削平者之绩不大，此非君子之言也。赏罚明，则民易使。今日之酬勋，他年之龟鉴。知此说者，其知未雨绸缪之道乎？台湾海外天险，较内地更不可缓。而此日之台湾，较十年、二十年以前，又更不可缓。前此台湾，止府治百余里，凤山、诸罗皆毒恶瘴地，令其邑者尚不敢至；今则南尽郎娇，北穷淡水，鸡笼以上千五百里，人民趋若骛矣。前此大山之麓，人莫敢近，以为野番嗜杀；今则群入深山，杂耕番地，虽杀不畏，甚至傀儡内山、台湾山后、蛤仔难、崇爻、卑南觅等社，亦有汉人敢至其地，与之贸易。生聚日繁，渐廓渐远，虽厉禁不能使止也。地大民稠，则绸缪不可不密。今郡治有水陆兵五千余人，足供调遣。凤山南路一营，以四五百里山海奥区，民番错杂之所，下淡水、郎娇盗贼出没之地，而委之一营八百九十名之兵，固已难矣。诸罗地方千余里，淡水营守备僻处天末，自八里岔以下尚八九百里，下加冬、笨港、斗六门、半线皆奸宄纵横之区，沿海口岸，皆当防汛戍守，近山一带，又有野番出没。以八九百里险阻丛杂之边地，而委之北路一营八百九十名之兵，聚不足以及远，散不足以树威，此杞人所终夜忧思而不能寐者也。台民好为盗贼，不因饥寒。方庆削平，又图复起。去岁平台大定之后，尚有布散流言，啸聚岩谷，复谋作乱者数次，屡经扑灭，岁余始殄。而王忠一贼，伏匿深山，至我皇上即位，乃克就缚。可见地方广大，搜捕弗周，虽平台仅在七日，而拔尽根柢，东擒西剿，亦有两载艰难。欲为谋善后之策，非添兵设官、经营措置不可也。以愚管见，划诸罗县地而两之。于半线以上，另设一县，管辖六百里。虽钱粮无多，而合之番饷，岁征银九千余两。草莱一辟，贡赋日增，数年间巍然大邑也。半线县治，设守备一营，兵五百。淡水八里岔设巡检一员，佐半线县令之所不及。罗汉门素为贼薮，于内门设千总一员，兵三百。下淡水新园设守备一营，兵五百。郎娇极南僻远，为逸盗窜伏之区，亦设千总一员，兵三百，驻札其地。使千余里幅员声息相通。又择实心任事之员，为台民培元气。寇乱、风灾、大兵、大疫而后，民之憔悴极矣。然土沃而出产多，但勿加之刻剥，二三年可复其故。惟化导整齐之。均赋役，平狱讼，设义学，兴教化，奖孝弟力田之彦，行保甲民兵之法，听开垦以尽地力，建城池以资守御，此亦寻常设施耳。而以实心行实政，自觉月异而岁不同。一年而民气可静，二年而疆圉可固，三年而礼让可兴；而生番化为熟番，熟番化为人民；而全台不久安长治，吾不信也。顾或谓台湾海外，不宜辟地聚民，是亦有说。但今民人已数百万，不能尽驱回籍，必当因其势而利导约束之，使归善良，则多多益善。从来疆域既开，有日辟，无日蹙，气运使然。即欲委而弃之，必有从而取之。如澎湖、南澳皆为海外荒陬，明初江夏侯周德兴皆尝迁其民而墟其地，其后皆为贼窠，闽广罢敝。及设兵戌守，迄今皆为重镇。台湾古无人知，明中叶乃知之，而岛彝盗贼，后先窃踞，至为边患。比设郡县，遂成乐郊。由此观之，可见有地不可无人。经营疆理，则为户口贡赋之区；废置空虚，则为盗贼祸乱之所
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