侯安都字成师，始兴曲江人。世代都是郡中显姓。父亲侯文捍，年轻时任州郡一级官吏，以忠诚谨慎闻名，侯安都地位显赫以后，他官至光禄大夫、始兴内史，俸禄刚好二千石。
侯安都擅长隶书，会弹琴，读了不少书籍，所作的五言诗，也很高洁美好，并且擅长骑马射箭，是县里的英雄豪杰。梁始兴内史萧子范征召他担任主簿。侯景之乱时，他招集士兵，达到三千人。高祖来援京都，侯安都带兵跟随，攻打蔡路养，打败李迁仕，攻克平定侯景，他都全力作战建有战功。元帝任命他为猛烈将军、通直散骑常侍，封为富川县子，食邑三百户。跟随高祖镇守京口，任兰陵太守。高祖计划袭击王僧辩，各路将领都无人知晓，只和侯安都商订计策，并派侯安都率领水军从京口奔赴石头，高祖亲自率领骑兵、步兵经江乘、罗落，和他会合。侯安都到达石头北面，弃船上岸，王僧辩毫无觉察。石头城北与山岭相接，城上如齿状的矮墙不是很高很陡，侯安都身披铠甲、手持大刀，士兵们把他用手托起投到矮墙内，士兵们跟着入城，逼向王僧辩的卧室。高祖的大部队赶到，和王僧辩在听堂前交战，侯安都从里面配合杀出，前后夹击王僧辩，于是生擒王僧辩。
绍泰元年(555)，按功劳任侯安都为使持节、散骑常侍、都督南徐州诸军事、仁威将军、南徐州刺史。高祖向东讨伐杜龛，侯安都留在朝廷据守。徐嗣徽、任约等人率北齐军进据石头，流动突袭的骑兵到了城楼下。侯安都关闭城门、放倒旗帜，向敌人示弱，并命令城里的人说：“登上城墙向敌人观望者斩首。”到了晚上，敌人收兵回石头，侯安都命令士兵秘密准备御敌的器具。天快亮时，敌骑兵又来了，侯安都率领身穿铠甲的士兵三百人，打开东西两边的侧门与敌军交战，大败敌军，敌军于是退回石头，不敢再逼近朝廷禁城。高祖赶到后，以侯安都为水军，在半途切断敌军的粮食运输线。又袭击秦郡，攻破徐嗣徽的栅城，拘捕他家陈书的人口，并缴获了他家的马驴和辎重。取了徐嗣徽常弹的琵琶和饲养的鹰，派使者馈赠徐嗣徽，说：“昨天到你弟弟的住处得到了这些东西，今天还给你。”徐嗣徽等人看到东西后非常害怕，不久求和，高祖听任他回到北方。徐嗣徽等人渡江时，北齐残兵还占据着采石，守备很严，于是又派侯安都去攻打，俘虏了敌军大部。
第二年春，皇帝诏令侯安都率军镇守梁山，以防备北齐入侵。徐嗣徽等人再次进入丹阳，到了湖熟，高祖催令侯安都回来，率领骑兵、步兵在高桥拒敌。又在耕坛南面交战，侯安都带领二十名骑兵突入敌阵，打败了敌人，活捉了北齐的仪同乞伏无劳。又把北齐将领东方老刺落马下，适逢敌骑兵赶来，救走了东方老。敌人向北越过蒋山，侯安都又和北齐将领王敬宝在龙尾交战，派堂弟侯晓、军主张纂去闯敌阵。侯晓中枪落马，张纂战死。侯安都飞马赶去救侯晓，杀敌骑兵十一人，取了张纂的尸体返回，北齐军不敢迫近。高祖和北齐军在莫府山交战，命令侯安都率领步兵、骑兵一千多人，从白下横击敌军后部，敌军大败。侯安都又率领手下人马追到摄山，俘获敌军首领及许多士卒。按照功劳晋爵为侯，增加食邑五百户，送给一部鼓吹。又晋号平南将军，改封为西江县公。
再次统领水军出豫章，协助豫州刺史周文育讨伐萧勃。侯安都尚未赶到，周文育就已杀了萧勃，并且活捉了他的部将欧阳..、傅泰等人。只剩下余孝顷和萧勃之子萧孜还占据着豫章的石头，筑了两座城，余孝顷和萧孜各据一城，又布置了很多船舰，在河流两岸布下阵势，侯安都到来，就在夜晚秘密行动，烧毁了敌军船舰。周文育率水军，侯安都率步兵、骑兵，上岸结成阵势。余孝顷不久切断了他们的后路，侯安都于是命令士兵砍了很多松木，扎起栅栏，排成横路逐步推进，连战皆捷，萧孜于是投降。余孝顷逃回新吴，请求用继子作人质，保证归顺，侯安都答应了他。率军返回，按照功劳晋号镇北将军，升任开府仪同三司。
又准备率军在武昌与周文育会合，一起向西讨伐王琳。出发前，王公以下官员在新林为他饯行，他策马腾跃过桥，人马一起坠落水中，坐在..内又掉进了橹井，当时都认为这是不祥之兆。到达武昌，王琳的部将樊猛弃城逃跑。周文育也从豫章赶到。当时两位大将同行，不相统摄，于是部下发生争执，稍有骚动。部队到达郢州，王琳的部将潘纯..在城中向梁军发箭。侯安都很气愤，进军围攻，未能攻克而王琳已到了..口，侯安都于是舍弃郢州，全部人马都去沌口抵御王琳，遇到大风不能前进。王琳占据东岸，梁军占据西岸，相持了几天，于是交战，侯安都等人战败。侯安都与周文育、徐敬成都被王琳囚禁起来。王琳总是用一把长锁锁住他，关在..下，吩咐和他亲近的宦官王子晋负责看守他们。王琳下到湓城白水铺，侯安都等人甜言允诺赠送厚礼给王子晋。王子晋就假装乘小船靠着..钓鱼，夜晚载侯安都、周文育、徐敬成上岸，没入深草中，步行到官军营中。回到都城述罪，皇帝下诏全部赦免，恢复他们的官爵。
不久任丹阳尹，出任都督南豫州诸军事、镇西将军、南豫州刺史。命令后续周文育攻打余孝劢和王琳
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