遇波涛乃不摇动；余则否），轻重亦异（木老则坚而重，否则轻）；必得良材，轻重配合，如人一身筋骨相配，然后善于运动也。故水师必讲于造舟者，此其一也。水师之湾泊，犹陆师之安营。凡水师不能于外洋觅战，皆于进港交锋；所以湾泊之处，即是战争之场。我舟先至，利在居要以争上风；然风信难凭，透发之后，往往转变，先要泊稳；傥一澳中有南风澳、北风澳不同，则宁泊南风澳以待；此又老将之持重，不可执一而论也。故水师必明于湾泊者，此其一也。水师之入港，犹陆师之克城。凡港门为贼所守，而险隘尤为贼所恃；兵法有挟制其险而攻其虚之说，以险处多虚，故险可制而虚可攻耳。故水师必详于入港者，此其一也。此水师之大概也，而其要在机；曰扼要、曰伺隙、曰察变、曰虚中四者。夫扼要则握其权矣，伺隙则分其力矣，察变则夺其守矣，虚中则避其害矣；此所以能于衽席之上以过吾师，克期取敌捷如也。要而言之，师之用在舟，舟之用在水，水之用在风；舟与师相习，风与水相遭，其用在于变而通之以尽利，神而明之存乎人。易曰：「刳本为舟，剡木为楫；舟楫之利，以济不通，盖取诸涣」。涣者，风水之义。圣人一言尽之矣』（同上）。
『彭湖出洋巡哨，由妈祖宫澳开驾，向西至西屿头，经内堑、外堑，复收泊西屿头内大果叶登岸。大果叶二里，左为缉马湾，右为小果叶，南四里至内堑；接季轮拨千、把各一员。澳口炮台一，东山顶烽台三。内堑西南三里至外堑澳口，炮台一，西山顶烽台三。再北经缉马湾、小里叶，八里至小池角，西北四里至大池角，十五里至小门，炮台一，烽台一；四里至鸽界头横礁，三里至竹篙湾，仍回至大里叶，十里，登舟。由内港驾至北山瓦硐港寄泊，登岸，四里至通梁，三里至后藔，二里至大北山山顶瞭望。北为吉贝屿、姑婆屿、土地公屿、铁砧屿、目屿、白沙仔屿险礁，东为湾贝屿、蓝笨仔屿、鸟屿、鸡膳屿、碇齿屿。欲赴吉贝各屿，须出吼门往北；若逆流、逆风，未可驾驶。瓦硐港四里至大赤嵌社南，有塘汛，按季轮拨千、把各一员；一里至小赤嵌，三里至港仔，东二里即崎头，东南一里至镇海，三里至港尾，二里至城前，仍至瓦硐港，登舟。从吼门出洋哨巡，由西屿头外收入内埯寄泊，回妈祖宫澳』。『再妈祖宫澳开船出哨，由西往南，经鸡笼屿、四角仔、桶盘屿、虎井，直抵八罩、金鸡澳，入挽门汛（南北风可泊五、六船）；按季轮拨千、把各一员，汛后山顶炮台一。由塘口往西南一里至网埯，南为半砰屿、头巾礁、铁砧屿、碀仔屿，西南为大屿，西北为花屿、猫屿、草屿，西北半里至瓮菜堀，北四里至花宅，四里至水埯；埯口北炮台一（南风时可泊船），复回挽门汛。东隔半里为将军澳，与挽门汛对峙（立冬后可泊四、五船）。东临海有石山，名船帆屿，山顶炮台一。向北为金鸡屿（南北风俱可泊船），在将军澳后，北有马鞍屿。由挽门登舟，出金鸡屿口往东南，至东吉、西吉、锄头精屿，至文良港驾回，经过锁管港、猪母落水、虎井、嵵里、风柜尾、鸡笼屿、四角仔，回妈祖宫澳』。『陆巡由妈祖宫澳四里至暗澳，有巡检司；三里至东卫，五里至大；城北三里至隘门仔，一里至林头仔、埯南、香炉屿、鼓架礁，四里至尖山仔，一里至文良港、东鼻头，烽台一，可望阳屿、阴屿；北五里至果叶仔，二里至奎壁港，北三里即奎壁港山；西三里白湾坑，二里至湖东，二里至湖西，五里至红罗罩；北三里至青螺仔。红罗罩半里至西溪仔，南三里至太武仔，西三里至港底，北一里至东石，六里至沙港头，南三里至鼎湾，西北三里至中墩屿，潮退可通；西南二里至潭边，南二里至港仔尾，三里至蚱脚屿，二里至东卫，四里至西卫，三里至后堀潭，四里至妈祖宫澳』。『再陆巡用大杉板往嵵里后山登岸；嵵里澳口炮台一，山顶烽台一。五里至风柜尾澳口；炮台一，烽台一。东二里至井仔埯，东南四里猪母落水，东北二里锁管港，西北一里鸡母坞，北五里至铁线尾，八里至乌嵌，五里至双头挂，与大城北相对；三里至菜园，三里至暗澳，回妈祖宫澳』（副将薄有成出哨月报）。
康熙辛丑，兵部奏准：彭湖系台湾咽喉紧要适中之地，移台湾总兵驻澎湖，台湾陆路改设副将。金门总兵黄英奏言：「彭湖为台湾之门户，今将台湾总兵移改彭湖，台湾设立副将，与水师彼此接应，遥度形势，尽善之谋无大于此。臣阅地势轻重，彭湖虽称三十六岛，居于台、厦之中，究皆一抔之土，错落弹丸，除妈宫、八罩略有人烟，余悉冷落荒屿，原设副将尽堪防守。兹台湾南北延袤二千余里，村庄、番社，闾井户口，不下百余万，丛山深林，最易藏奸，非总兵不足以资弹压。况安平水师及南北路副、参各员，与台湾副将职位不相上下，有事势必各怀己见，非若总兵可行调度。今若将总兵设在彭湖，与台湾悬隔，往来船只俱候风时；台湾水陆各营傥有紧急事机，不能朝发夕至。是彭湖固台湾之门户，而台湾实彭湖之腹心，形势重于彭湖，关系沿海各省要害。请将总兵仍设台湾，庶得居重驭轻之道，以造海宇无疆之福」。提督姚堂亦为陈请，仍照旧制驻札。
安平水师额设战船：中营平字号十八号，内赶缯十、双篷艍六、双篷■〈舟古〉二；左营定字号十六号，内赶缯八、双篷艍八；右营澄字号十八号，内赶缯十、双篷艍八。彭湖水师额设战船：左营绥字号十八号，右营宁字号十八号，与安平中、右营同。赶缯长四、五丈至七、八丈，双篷艍长二丈至五丈。设为分、总巡哨之法，每年二、三、四、五月为一巡期，六、七、八月为一巡期；轮拨本营将备一员带领兵船四分巡所辖洋面，副将统领兵船四总巡各营所辖洋面。大赶缯配兵六十、小赶缯五十、大艍四十、小艍三十四。巡期满日，官兵船只撤回安平水次。十月至正月，各船配兵一半，于本辖水汛巡哨。澹水营旧拨左营赶缯二，近又拨道标波字号赶缯四；又道标双篷艍四，亦归镇标。各船三年小修、六年大修、九年再大修、十二年拆造；小修自三十两至一百五、六十两，大修自四十两至二百三十余两，拆造自五十两至三百六十两不等。
凤山打狗港距鹿耳门水程三更，北风盛发，鹿耳门港道狭隘，舟不得进，而打狗可扬帆直入，由此登岸者甚多。水师把总配哨船二只，领兵防汛。下澹水离邑既远，奸宄易滋，陆路千总领兵防汛。此二处，为南路水陆扼要之地。
伪郑在台，民人往来至半线而止。自归版图后，澹水等处亦从无人踪。故北路营汛，止大肚安设百总一名，领兵防守；沙辘、牛骂二社，则为境外。自海盗郑尽心脱逃，部文行知：伙盗供称郑尽心约在江、浙交界之尽山、花鸟、台州之鱼山、福建台湾之澹水等处藏匿；维时总兵崔相国分拨千总一员领兵分防澹水。自后遂以为常，而业户开垦，往来渐众。
镇标原额兵三千三百五十名，道标兵三百六十名。康熙六十一年，提督姚堂奏准将道标裁归镇标。安平协二千五百名，彭湖协二千名，南路营八百九十名，北路营八百九十名，澹水营五百名；全郡共兵九千四百九十名（合拨闽省将军兵五百名，共一万）。六十年，总督满保疏请于府治增一千名，四面协护。南路增一千名，以五百驻冈山，前护本营，后护府东，并保护罗汉门口；以五百驻下澹水、新园，后护本营，前查龙桥东之阿猴林等处。北路增一千名，以五百驻斗六门，后护半线，前护本营，并查笨港海口，防御生番；以五百驻半线，后护澹水，前护斗六门，稽查鹿仔港，防护大江口。再北路营去府两日，又有大河，不能实时接应，于适中之地亦应增五百名，前则协护府治，后则稽查北路横港海口，堵截内山。共计增兵三千五百名。九卿议覆：「匪类聚众为乱，并非兵少之故；添设官兵，甚属无用」。遂寝其议。
癸巳九月，福督范时崇题准：在台逃亡汰革兵丁，不得在台募补，应于各原营挑选年力精壮有家业者，计有十名以上，即拨百队一名，押往补额。兵米：镇标三营，台邑支给；安平水师，凤山支给；彭湖水师，诸罗支给。
半线、澹水兵米，向皆折给：半线每石连脚价至九钱，澹水每石连脚价至一两五钱；尽派里民。邑令周锺瑄于半线建仓三间，贮榖三千七百有奇；澹水建仓二间，贮谷千余；随便拨补，就地砻给。
偷渡来台，厦门是其总路。又有自小港偷渡上舡者，如曾厝埯、白石头、大担、南山边、镇海、岐尾；或由刘武店至金门、料罗、金龟尾、安海、东石，每乘小渔船私上大船。曾厝埯、白石头、大担、南山边、刘武店系水师提标营汛，镇海、岐尾系海澄营汛，料罗、东石、金龟尾系金门镇标营汛，安海系泉州城守营汛：各汛亦有文员会同稽查。余有清台地莫若先严海口一疏。
近海港口哨船可出入者，只鹿耳门、南路打狗港（打狗山南岐后水中有鸡心礁）、北路蚊港、笨港、澹水港、小鸡笼、八尺门。其余如凤山大港、西溪、蚝港、蛲港、东港（通澹水）、茄藤港、放■〈纟索〉港（冬月沙淤，至夏秋溪涨，船始可行）、大昆麓社、寮港、后湾仔（俱琅峤地）、诸罗马沙沟、欧汪港、布袋澳、茅港尾、铁线桥、盐水港、井水港、八掌溪、猴树港、虎尾溪港、海丰港、二林港、三林港（二港亦多沙线，水退去口五、六里）、鹿仔港（潮长，大船可至内线，不能抵港，外线水退，去口十余里，不知港道，不敢出入）、水里港、牛骂、大甲、猫干、吞霄、房里、后垄、中港、竹堑、南嵌、八里坌、蛤仔烂，可通杉板船。台湾州仔尾、西港仔、湾里，凤山喜树港、万丹港，诸罗海翁堀、崩山港，只容■〈舟古〉仔小船。再凤山岐后、枋寮、加六堂、谢必益、龟壁港、大绣房、鱼房港，诸罗冂仔、穵象领，今尽淤塞，惟小鱼船往来耳。山后大洋，北有山名钓鱼台，可泊大船十余；崇爻之薛坡兰，可进杉板。
沿海暗沙险礁，哨船龙骨艰于驾驶。即有可以开驾者，必俟潮水平时方可进港，否则沙坚水浅，终于望洋港外；更值风暴，又无收泊之所。或云：当改制杉板■〈舟古〉仔数只，质轻底平，随波上下，易于巡防，随处可以收泊。高知府铎云：「朱逆之变，士民避乱，及平台后，商旅贸易，乘■〈舟彭〉仔等平底船，在洪涛巨浪中，往来如织。康熙壬寅五月，水师营雇坐■〈舟彭〉仔出哨，遭风失桅，飘至浙江黄岩，人船卒致保全」。是在内港既属相宜，即外洋亦可无患。
鹿耳门炮台，今圯。炮十五位，中、左、右三营各五位；以木架之，中有一枢，随向转动，名曰转轮炮。雍正甲辰，总兵林亮新修炮架，上横梁前后各长四尺，中实三尺，下横梁前后各长五尺，中实三尺，上下直梁各长四尺，梁柱各五寸，四方直柱各高四尺，接笋处俱裹以铁，下坐板厚三寸、横八尺、阔七尺，柱脚木九根，围一尺八寸、长五尺、入地四尺五寸。盖以木为之，如屋顶式，可以避风雨剥蚀；两边用环勾牵，然炮时掀下极易。
修造哨船工料：大吉木（八丈以上）、中吉木（六丈以上，俱杉木名）、浮溪木（松柏木）、高洋木（即土杉木，福州出）、舵、碇、龙骨（每丈配桅一丈二尺）、大桅（赶缯长八丈二尺、围六尺五寸，篷艍长五、六丈、围四尺五寸）、头桅（赶缯长六丈、围四尺，篷艍长四丈五尺、围三尺五寸）、大橹、小橹、大小风篷、大小桅饼（大木圈，或十余、或数个，用套大桅，便于起篷）、大小无底升（亦木圈。风篷挂于桅上、用木圈以动之。赶缯一千三百个，双篷艍七、八百个）、樟梁、头梁座、大桅座、头桅座、头尾托浪板、斗盖、水柜、头禁水（镶船头木）、尾禁水（镶船尾木）、上金（尾楼边高起木）、下金（在船尾水内，用以拴舵）、招（船顶上招子，便于头起也）、撑面（舱盖）、扛罩（舱口直木。此木自官厅口起至大桅兜止，所罩舱之撑盖，俱扛于此，故名；隔舱板木，乃横木也，在大桅处名■〈人口，上中下〉檀，又曰梁头，在各舱则名堵经）、披枋（杉木板，隔船两边水）、笨枋（船顶板，在战棚枋之下）、占柜（铺官厅顶盖）、覆竹（船两旁所钉樟木）、车战棚（杉木板，重铺笨枋上）、车耳（扯篷起碇索缚于此）、稳仔（水蛇下湾木）、大缭极（系大绳索木）、湾极、直极、头尾八字极（俱樟木，用以镶船）、屈尺极（妈祖堂前两湾樟木；大赶缯用，双篷艍无）、番人耳（船头木）、头■〈人口，上中下〉檀（树头桅木）、大■〈人口，上中下〉檀（树大桅木
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