乙亥（崇禎八年）
夏四月，福建遊擊鄭芝龍合粵兵擊劉香老於田尾遠洋。
初，劉香老蹈芝龍故轍，仍為海邊患。芝龍知其技力窘乏，視風色之東西，潮頭之上下，窮逼追擊，幾無泊處。香老恨已甚，訪芝龍之在漳鎮，選遣心膂，直搗芝龍之室，或殺或擒，期了局以杜後患。芝龍先知之，假歎曰：『我自就撫以來，為貪官污吏索縛，正欲仍來入夥，今眾義來邀，喜不可說』。即遣家眷行李登所來之船，並鍋鐵器械、海中所需必欲取之市者，無不席捲。芝龍曰：『室中酒肉甚多，何不暢飲、啖空而去』？速令治具，取精腆豐美者恣為飽啖，後則數拳高歌，更為碗酒塊肉，極量忘懷。海中來黨至醉，極酩酊矣。醉而酩酊者，腰刀快斧，咸掛於壁，或眠或坐，笑謔罔顧。芝龍陰伏兵於屋上，忽鳴鑼一聲，皆明甲明盔，奮勇從屋跳下。海中之黨，或醉臥未起，或解甲高歌，皆砍殺無遺。芝龍仍命舟中取上家口，解脫來人衣甲，家丁披掛，駕彼來船。芝龍挺立桅下，開船下海。劉香老遙望本船與駕船服飾稍別，再睨船前獨立果系芝龍，大喜，呼曰『來矣』！芝龍拱手而應曰：『來矣』！立躍上岸，乘其不備，舉刀亂砍。香老見勢蹶，脅兵備道洪雲蒸出船止兵。雲蒸大呼曰：『我矢死報國，亟擊勿失』！遂遇害。香老舉火自焚死，精銳皆盡。康承祖以老疾，卒於海。夏之本、張一傑脫歸。
八月，香老家屬六十餘人，部屬千餘人，至黃華降於溫處參軍。
庚辰（崇禎十三年）
秋八月，加福建參將鄭芝龍署總兵。
芝龍既俘劉香老，捲其資蓄，復來漳鎮。其八主皆為芝龍勁旅，從此海氛頗息。通販洋貨，內容外商，皆用鄭氏旗號，無儆無虞，商賈有廿倍之利。芝龍盡以海利交通朝貴，寖以大顯。
癸未（崇禎十六年）
冬十一月，設南贛兵三千，以副總兵鄭鴻逵統之。
甲申（崇禎十七年三月，北京陷，崇禎亡。世祖章皇帝順治元年。福王即位南京）。
春正月，兵科給事中曾應遴薦副總兵鄭鴻逵緩急可用，詔益南贛兵三千，命鴻逵鎮守。
五月十五日，誠意伯劉孔昭、司禮監韓贊周等立福王，即位南京，改元宏光。兵部尚書史可法請督師江北，鳳陽總督馬士英入專國政。
封福建總兵官鄭芝龍為南安伯，賜蟒衣。
乙酉（大清順治二年，宏光元年。五月，南京破，宏光亡；閏六月，唐王即位福州，改元隆武）。
封鄭鴻逵靖虜伯。
左良玉下武昌，破九江、安慶，至池州。時阮大鋮、黃蜚屯板子磯，鄭彩屯三山峽，黃得功屯蕪湖。阮大鋮築壘板子磯小山上，造二浮橋達北岸。諸軍俱艤舟磯下。天大霧，鄭彩溯江而上，劫左營，奪其舟數十艘於紫沙洲梅根，轉戰而前。黃蜚嫉其功，攔江，不聽彩艘下。左兵追之，砲擊彩舟，傷百餘人，殺四將領。彩訟之朝，蜚亦以彩越汛地邀功致敗，互相訐奏。朝命大鋮兩平之。
大清兵既破揚州，沿江窺渡。鄭鴻逵率水師禦之京口。大清兵編筏張燈向鎮江，而別由老鸛河渡。
五月，大清兵開閘放舟，蔽江而南。鄭鴻逵、鄭彩見之，楊帆東遁。
大清兵渡江，福王走至蕪湖，為降將劉良佐擒解豫王。鄭鴻逵、鄭彩守鎮江，擁舟師不戰，走還閩。至浙，於江口逢唐王，鴻逵奉之至福州。福建巡撫張肯堂、巡按御史吳春枝、禮部尚書黃道周、南安伯鄭芝龍等會議監國。鴻逵固請正位，以閏六月十五日即位，改元隆武。起曾櫻、何吾騶等入閣辦事。晉封芝龍為平虜侯，尋封平國公；鴻逵為定虜侯，尋封定國公；芝豹為澄濟伯；鄭彩為永勝伯；賜芝龍長子森國姓，名成功，封忠孝伯。賜姓以天啟甲子年七月十五日生於日本，母顏氏出也；芝龍後遣人將母子取回。又封芝龍部將施天福為武毅伯，洪旭為忠振伯，林習山忠定怕，張進忠匡伯，陳輝忠靖伯；鴻逵部將陳豹為忠勇侯，林察為輔明侯。
八月，隆武詔至粵西，有靖江王稱監國，不奉詔；總制丁魁楚、巡撫瞿式耜擒送至閩，斬之。
十月（此二字疑為衍文），芝龍集廷臣議戰守事宜。自僊霞關外，守者共一百餘處。其戰兵，以元年冬操練，二年春出關。一支出浙東，一支出江右。略計兵共二十萬，合八閩、兩粵餉計之，不支一年。鄭芝龍遣給事中梁應奇入廣督餉。應奇往督，因參遲誤者數十人，俱奉旨提問；然遲疑未有提至者。潮州知府楊球欲入朝，聞旨遂止粵界，不敢入。
芝龍又令撫按以下，皆捐俸助餉。官助之外，有紳助。紳助之外，有大戶助。又借徵次年錢糧。又搜括府縣庫積存銀，厘毫皆解。不足，又大鬻官爵：部司價銀三百兩，後減至百兩；武紮僅數十兩，或數兩。娼優廝隸，盡列衣冠，但無俸、無衙門，空銜而已；然借此倩軒蓋、雇僕役，拜謁官府，鞭撻鄰里，甚至府縣蒞訟，兩造皆稱職官，立語不跪，互毆於庭而莫可制。
鄭芝龍所招關門兵，不過數百疲癃。廷臣請出關者章滿公車。隆武每欲躬履行閒，而芝龍俱以缺餉為辭。
十月，隆武未有嗣，芝龍令子鄭森入侍。隆武意有所嚮，先賜國姓，改名成功（此八字疑為衍文），成功輒先得以告芝龍，由是廷臣無敢異用者。芝龍、鴻逵自恃有援立功，驕蹇無禮。唐王嘗賜宴大臣，芝龍以侯爵位輔臣上。大學士黃道周引祖制武臣無班文臣右者，固爭之，遂首道周，芝龍怏怏不悅。諸生有佞芝龍者，上書言道周迂腐，非宰相才；唐王怒，敕督學御史杖之。芝龍又薦其門下士朱作楫為吏科給事中、葉正發為戶部主事，皆不允；以是益懷怨望。唐王行郊天禮於南臺，二鄭皆稱疾不出。戶部尚書何楷劾奏：『郊天大典，芝龍、鴻逵不出陪祭，無人臣禮，當正其罪』。唐王賞楷有風裁，即日令掌都御史事。已而鴻逵揮扇殿上，楷呵止之。二鄭皆怒。楷知不為所容，亟請告退。唐王欲曲全之，允其回籍，俟再召。楷至中途，盜截其一耳以去，抵家未久死；蓋芝龍令部曲楊耿害之也。兵科給事中劉中藻亦以忤鄭氏去。有密告芝龍攬權者，隆武輒責芝龍；芝龍怒，佯欲謝事。隆武心知芝龍不可恃，無以制之，因復固留曰：『此非朕意，乃某人言也』。芝龍潛中傷之。於是左右無一同心矣。
廷臣屢請命芝龍出關，芝龍亦知不出關無以服眾心，因分兵為二，聲言萬人，實不滿千；以鄭鴻逵為大元帥出浙東，鄭彩為副元帥出江西。隆武倣淮陰故事，築壇郊拜而送之。二帥既出關，疏稱候餉，不行，逗遛月餘，隆武下詔切責曰：『倘畏縮不前，自有國法在』。二帥不得已逾關行四、五百里，仍疏言餉絕，留住如故。
大學士黃道周憤師不前，因請以募兵江西，以江西多其門生子弟也。隆武命芝龍與之資，芝龍不予一錢。隆武給空札百函為行資。道周以劄聯絡忠義，糾合鄉勇，得九千人，駐廣信，與楊廷麟、萬元吉相應，出兵金衢，前後斬級數百。適衢撫與議不合，忌其師屯境上，密疏其短，道周不知也。繼而請兵請餉，絕不一應。及知其由，遂決意長驅，深入婺源，出徽。婺源令，其門人也。北帥張天祿執令妻子，命令設計誘道周至明堂里執之，並從軍主事趙士起、中書毛之冰、蔡時培、賴叔儒俱送南京，不屈見殺。
時閣臣蔣得璟（明史作「蔣德璟」，卷二百五十一有傳）自請行關，相機督戰，隆武許之。比至，則疲兵弱卒，朽甲鈍戈，無一可為，因歎息告病去。
鄭遵謙起兵江上，與張國維、陳函輝、熊汝霖等迎魯王於臺州監國，駐紹興。遣都督陳謙奉書至閩，久住衢州，持兩端，云魯王已封芝龍靖鹵侯，欲以此邀封於唐王。唐王敕芝龍取其侯印為驗，謙齎印，唐王即召入關，啟函稱「皇叔父」，不稱「陛下」，隆武大怒。御史錢邦芑劾其久住三衢，徘徊閩、浙之界，自以舉足左右，足為重輕，因欲要取封侯，以閩要浙，以浙要閩，祇恃搆鬪之謀，敢行挾制之術。又歷數其在衢姦淫不法狀。遂下之獄。謙，武進人，乙酉春齎宏光詔封芝龍南安伯，比讀券，誤書安南，謙謂芝龍曰：『南安僅一邑，安南則兼兩廣，請留券易詔』，厚贈而別。及半途，而南京變，謙遂留閩。芝龍德之，故力為申救，行賄五千金於邦芑，請免謙死。邦芑懼以聞於唐王。遂決意殺之，即命邦芑監刑。芝龍聞之，過市，命且停刑，亟入朝見唐王，請以官贖謙死。唐王密斥行刑，故與芝龍久語慰勞之，過期，芝龍出，而謙已斬矣。芝龍伏屍哭極哀，以千金厚殮之。從此益懷異志。
先是，芝龍、鴻逵已密遣人通內院洪承疇、御史黃熙允（胤），及聞錢唐信息，因疏稱『海寇猝至，今三關餉取之臣，臣取之海，無海則無家，非遄征不可』。拜表即行。隆武手敕留之曰：『先生稍遲，朕與先生同行』。使奉敕至河，而芝龍飛帆已過延平矣。
芝龍既去，守關將施天福聲言缺餉，盡撤兵還海。僊霞嶺二百里間，空無一兵，惟所遣守關主事及內臣文員偵探兵信以聞耳。
丙戌（順治三年、隆武二年）
二月，江楚迎駕疏相繼而至，唐王遂決意幸贛，與湖南為聲援。芝龍欲挾君以自重，固請回天興，命軍民數萬人遮道號呼，擁駕不得行，乃駐驆延平。芝龍初以海寇受撫，雖晉爵五等，與地方有司不相統屬，閩士大夫輒呼之為「賊」，絕不與通。及擁戴唐王即位，芝龍位益尊，權益重，全閩兵馬錢糧皆領於芝龍兄弟。是芝龍以虛名奉君，而君以全閩予芝龍也。故芝龍不肯聽唐王出關，思長有閩也。
三月，大清貝勒王駐兵錢唐北岸。
五月，江上師潰。
六月初一日，大清兵渡江，江潮不至。方國安、馬士英欲獻監國為投降計，遣人守監國；守者忽病，乃得脫，遂上海船，遁入舟山。督師張國維、興國公王之仁、兵部侍郎陳函輝、大學士朱大典俱死之。方逢年、方國安及刑部尚書蘇壯俱薙髮投誠。馬土英、阮大鋮猶擁殘兵數千，請入關，隆武以其罪大，不許。士英前後七疏自理。有李蘧者，士英私人也，與唐王有舊，密疏言：『士英有治兵才，與阮大鋮皆宜在使過之列』。唐王特允士英以青衣視事，戴罪立功，但無錢糧兵馬專任。士英計窮，逃至天臺寺為僧，為大兵搜獲。阮大鋮迎降。貝勒俱令隨內院辦事。大兵過順昌，獲龍扛，搜之，得馬士英、阮大鋮、方國安父子及方逢年連名請駕出關為內應疏，在已降後。大鋮方遊山，聞信，知不免，自投崖死；仍命戮屍。士英等四人俱斬於延平城下，家眷百餘口悉給賜兵丁。時杉關守將陳秀、陳曦投降，而僊霞關無一守兵，寂如也。
大兵過延平而東。時隆武定計入贛，已至汀洲，見兵未至，因停一日曬龍鳳衣。忽有數十騎叩城曰：『我扈蹕兵也』，門者納之。陳謙之子追至，直入行宮，遂及於難。
九月，大兵入泉州，德化知縣陳光晉迎降。既而汀、漳皆陷。惟鄭芝龍退保安平，軍容烜赫，戰艦齊備，砲聲不絕，響振天地，樓船尚五百艘。因前通洪承疇信未到達，故不敢迎降，乃使人言其撤兵不守，以待大兵之至，有功，當得大用。貝勒知泉紳郭必昌與芝龍有舊，因遣招之。芝龍曰：『我非不欲忠於大清，恐以立唐王為罪耳』。會大清固山兵逼安平，芝龍怒曰：『既招我，何相逼也』！貝勒聞之，乃切責固山，令離安平三十里駐軍，別遣內員二人持書至安平。書略曰：『吾所以重將軍者，以將軍能擁立也。人臣事主，苟有可為，必竭其力，力盡不勝天，則投明而事，乘時建功，此豪傑事也。若將軍不輔立，吾何用將軍哉？且兩粵未平，今鑄閩粵總督印以相待。吾欲見將軍者，欲商地方人才及取兩廣事宜也』。芝龍得書大悅，劫眾議降。諸將多不欲。有周崔（鶴）芝者，以死諫，不聽。其弟鴻逵、芝虎皆勸芝龍入海，曰：『魚不可脫於淵』，芝龍不從。其子成功涕泣力諫，芝龍不聽。於十一月十五日至福州朝見貝勒，握手甚歡，折箭為誓。芝龍益喜，命酒痛飲，賂遺不可勝計。飲至三日，夜半，忽拔營起，遂挾之北去。至京，封同安侯。
閩事略定，貝勒將歸，邀芝龍送之。貝勒過芝龍舟，必進一食，必加贊嘆，見一人，必加褒獎，信宿乃去。芝龍過舟投謁，貝勒疑之曰：『我所用人，粗悍鹵莽，何足當公意』？命悉取芝龍舟中庖廚僕從來供飲食，侍左右。芝龍乃大喜，不知墮其術中也。留信宿。已出閩，乃謂芝龍曰：『公功高，同我入京一見天子如何』？芝龍以未宿戒辭。曰：『公之左右僕從，悉
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