石增加。在陶以前，扁鹊弟子李当之，吴普著《李氏药录》《吴氏本草》，今全书不可知，从《名医别录》可见一二。
陶弘景所出之《神农本草经》是否神农造，甚可疑，因其内所记多为汉地名。其时与西域交通，为葡萄，胡麻之类均被采录。晋张华《博物志》及《神农经》《神农本草》是否与陶书同本也有疑问。想此书与张仲景有关。或是张于原书加入当时地名也不可知。但亦未即为陶书。如《博物志》引《神农本草》鸡卵造琥珀，在今本《本草经》全无。《博物志》记狼毒，巴豆，黎卢，天雄等毒物，及其解毒剂，弘景书则大变其体裁。然今本《本草经》之分法与《博物志》也有相合处，如上药中药等分法是，葛弘之《抱朴子》亦依此分法。故知《本草经》之源甚古。三类者，上药养命，即持续服之无害，反增康健；中药养性，不能常服，疾时用之。下药有毒，只驱病时服之。此可说为普通，剧毒三种。陶书中，上药百二十种，中药百二十种，下药百二十五种，合三百六十五种，应一年三百六十五日之毒。
陶弘景与葛弘同为道教之信者。葛弘积其炼丹工夫著为《抱朴子》，及其他关于道教书甚多。陶弘景为崇拜葛弘者，但一方亦信佛教，持佛道一致论，陶对于仙药有疑问，比葛弘更进一层，如芝，在《本草经》便不记，因他疑这物果否服之能轻身不老之故。
现存《神农本草经》有陶隐居之体系，因到宋后次序稍改，故多少是原本不得而知。从敦煌所出之《本草经》，知隐居选定是药为七百三十种，其中有名无实者百七十九种，常用者五百五十一种。弘景以前之药数，若依此经，当为五百九十五或四百三十一，或三百十九，故约定之，当时有五百种，与今日所用之数略同。
中国药品原来多在旧文明的区域，山西，山东，河北，河南诸省，但北方的药草含有香气的很少，因为含有香油的植物以南方为多，而这些植物古本草都未著录，自与外国交通后，这些芳香品逐渐加入，如丁香，龙脑，白檀，沉香，茉莉，没药，龙延香，安息香，阿魏，荜菝，白豆蔻等由波斯，交趾，锡兰等处输入。在外国芳香药品输入以前，古时只用椒，兰，比起南方之芳香性植物大有云泥之别，外国药之输入与佛教大有关系；陆由西域，水由南海，输入新植物不少。
三 唐代道教与本草
自与外国交通后，药数增加，高宗显庆四年（西六五九）敕李细述《唐本草》，同年订正为《唐新修本草》。《神农本草经》为陶弘景私撰；至于《新修本草》则为敕修之官版药书，集各地的学者，及各处之药，一一正其异同以定舍取，新增百十四种，药图二十五卷，别附图经七卷，给药物知识一大便利。古时铅与锡每混为一，至是则分别为二，又橙与柚，防葵与狼毒都判别出来。可惜此《新修本草》已佚，不过有二三册残本存在日本而已。唐时信道教的人很多，太宗也信服饵之法，常常至百二十岁翁甄权私第，问长寿法，甄权为著《药性本草》。这时道士明医的很多，医药与道教直分不开，如孙思邈为隐于太白山之学者，著《千金要方》，极有名。此外可注意者为集《本草经》及《新修本草》之遗漏的《本草拾遗》，陈藏器撰，述外国药品的有《海药本草》《胡本草》二书。《胡本草》已佚。
四 宋代之本草
唐以后，药方有变动，蜀孟昶乃造《蜀本草》，宋太祖开宝六年（西九七三年）造《开宝本草》，距《唐本草》已四百年，药数增加九百八十三种，新药增百三十三种。此后八十年，仁宗嘉祐间敕撰《嘉祐补注本草》，药数至千八十二种之多，因为数目很多，图形错杂，原物形态难知，仁宗又特选《图经本草》，谓天下郡县，就所产地描图上进，现行之《本草纲目》插图恐怕是以基于《图经本草》而作的《证类本草》为的本的。从《纲目》的图与《证类本草》比较，其中已有多少差异，将《证类》与《图经》较，也有多少不同，现存《图经本草》恐非旧观。
宋徽宗善画，好道，故对于本草之趣味恐怕很浓。大观间蜀医唐慎微献《证类本草》，朝廷名之为《大观本草》，付梓刊行。政和间又校正刊行，称为《政和本草》，名异而实同。为今存本草之最古刊本。此本草为李时珍《本草纲目》之母本，多存古代药名，慎微之功可谓至巨，此本有大德本与泰和本两种，今多为泰和本。
五 明清之本草
宋以后，本草书有名者甚少，变药物学，处方学为医术之理论，而忘却本草之真意，采药者当时少，于本草之进步当然有碍。一方，医学之理论渐离道家之说而就近儒家，与真药之接触少，而多理论。又“本草”成为广义，如《食物本草》《救荒本草》，出现于明代，全失本草之原义，有博物学之意。李时珍之分类亦受此时代学术倾向之影响。在明代可特记之书还有《庚辛玉册》，此书为宁献王于宣德年中编成；与医用全别，乃为册炉之用，其中分金石，灵苗，灵植，羽毛，鳞甲，饮馔，鼎器七部，列举五百四十一种药名。
李时珍之《本草纲目》，起嘉靖三十一年，迄万历六年（一五五二—一五七八年）至三十六年，集药千八百九十二种，全五十二卷，分十六部。时珍分无机性之药为水，火，土，金，石。植物性为草，谷，菜，果，木，服器。动物性为虫，鳞，介，禽，兽，人。更分细目，如草木部，有山草，芳草，毒草，蔓草，水草，石草，苔，杂草等。区分明了，甚便检阅。
自李书出后，曾有种种本草，但皆偏之处方及理论，于药物无研究。惟李中立之《本草元始》实就本草精神而作，为明清之际之特出。道光二十八年（西元一八四八），吴其濬本《本草纲目》，作《植物名实图考》，除药用植物外，并及各种，详加考证，所得约千八百种，为植物学上之大著。
现在中国药物共有二千五百九十六种，分类如下：
水六十七种，天水十三，地水三十，其它水二十四；火三十一种；土七十九种；金三十九种；玉十四种；石九十九种；草六百二十种；谷八十八种；菜百四十五种；果百六十六种；木百三十九种；藤二十五种；花三十一种；服器百二十七种（此类最可笑：如病人衣，孝子衫等是）；虫百三十九种；鳞百十一种；介三十三种；禽九十一种；兽百十一种；人三十五种（阴毛，肉，头垢，月水，牙，阳属，木乃伊等，计二十项）。
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