还有大理寺，是中央负责刑罚具体事务的办事机构，正长官是大理卿，副长官是大理少卿，下设丞、主簿、录事、正、监、评、司直、律博士、明法、狱掾等官吏。首都和地方州郡、县（隋代地方实行州县或郡县两级制），也都设有司法机构法曹和相应的官吏。开皇三年（583），隋文帝将都官尚书改名为刑部尚书。开皇五年（585），隋文帝下诏撤销律博士等。事情的原由是这样的：这年，侍官（府兵）慕容天远揭发都督田元找借口侵吞民间自置用于灾年自救的义仓所藏的粮食，但始平县（今陕西省兴平县东南）的律生辅恩，不去追究犯罪嫌疑人的罪责，却舞文弄法，反坐揭发者为诬陷罪。隋文帝很生气，下诏说："人命至重，悬在律文，刊定科条，俾令易晓。分官命职，恒选循吏，小大之狱，理无疑舛。而因袭往代，别置律官，报判之人，推其为首。杀生之柄，常委小人，刑罚所以未清，威福所以妄作。为政之失，莫大于斯。其大理律博士、尚书刑部曹明法、州县律生，并可停废。"（《隋书》卷25《刑法志》）此后，各司法部门判决案件，一律要求写出所依据的律文。开皇六年（586），隋文帝又诏令各州长史以下行参军以上的官吏，都必须学习隋律，集结京师时，要组织考试来检查他们对于律文的掌握程度。
隋炀帝执政后，对执法机构中官员的名称和人数做过一些小的变动。刑部增设宪部郎。大理寺丞改为勾检官，与寺正分判狱事。司直、评事等都增加了定员。不过，这些变动都没有实质性的意义。
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