左营游击一员（驻南澳，右营属广东）、守备一员、千总二员、把总四员、外委千总三员、外委把总六员、额外外委四员，步战兵四百二十八名（外委额外在内）、守兵五百三十名（舵工在内），战船十只（见船政漳州厂）。一驻札南澳城陆汛，一瞭望金山，一防守深澳口，一防守草寮尾汛，一出洋巡查三澎外洋海汛、洋林湾内海汛，一防守竹栖墩，一防守西炮台汛，一防守云澳汛，一协防泰字楼炮台汛，一瞭望云澳烟墩山，一防守青澳汛，一瞭望青澳烟墩山，一出洋巡缉。
铜山营（海门营、达濠营属广东）参将一员（驻札漳浦铜山城）、守备一员、千总二员、把总四员、外委千总三员、外委把总六员、额外外委四员，步战兵四百二十六名（外委额外在内）、守兵五百九十名（舵工在内），战船见船政漳州厂。一驻防铜山汛，一瞭望铜山城内山顶，一瞭望铜山汛铜钵山顶，一分防六鳌汛及古雷汛，一瞭望六鳌汛虎头山顶，一巡查古雷水汛、六鳌水汛，一分防北山汛，一苏尖汛山顶瞭望，一巡查北山顶水汛，一分防悬钟港口水汛，一扼守畬洲门，一扼守八尺门，一出洋巡缉。
福宁镇（原系陆路分防，驻福安县，嘉庆七年改为水师，移驻三沙，该镇听水师提督节制始此）
左营游击一员（驻三沙）、守备一员（驻三沙）、千总二员、把总三员、外委千总二员、外委把总三员、额外外委四员，步战兵四百七名（外委额外在内）、守兵三百四十三名（舵工在内），战船见船政福州厂。一驻防三沙，一分防青皓、小皓、西洋、虞公、三沙等塘汛，一分防斗米，一分防北礵汛，一带领出洋。
烽火营参将一员（出洋巡缉）、守备一员、千总二员、把总四员、外委千总二员、外委把总四员、额外外委三员，步战兵三百七十七名（外委额外在内）、守兵四百七十八名（舵工在内），战船见船政福州厂。一驻防蓁屿汛，一防守后澳仑炮台汛，一瞭望牳屿山顶，一瞭望南透山顶，一扼守大仑山，一驻防七都水汛，一驻泊南关水汛，一瞭望南镇山顶，一瞭望屏峰山顶，一瞭望沙埕山顶，一带领出洋。
台湾镇（康熙二十三年设，辖本标中、左、右三营、城守左、右军、水师协标三营、北路协标二营、嘉义营、澎湖协标二营、南路营、南路下淡水营、艋舺营兼辖沪尾水师营、新设噶玛兰营，听福州将军、闽浙总督、福建水师提督节制）
挂印总兵官一员，驻札台湾府城，雍正十一年准照山陕沿边之例挂方印。
镇标中营游击一员（驻札府城中路口）、守备一员、千总二员、把总四员、外委千总二员、外委把总三员、额外外委三员，马战兵四十名（外委额外在内）、步战兵四百九名、守兵四百二十五名，兵战马四十匹。
左营游击一员（兼管右营事，驻札府城北路口）、守备一员、千总二员、把总四员（原四员，道光四年拨一员北路右营）、外委千总一员、外委把总三员、额外外委三员，马战兵四十名（外委额外在内）、步战兵三百十八名、守兵三百九十五名、兵战马四十匹。
右营游击一员（道光六年移驻竹堑，改为北路右营游击，归北路协副将兼辖，本缺归左营兼管，十三年奉准照旧增设）、守备一员、千总一员（嘉庆十四年裁归艋舺一员）、把总三员、外委五员、额外外委二员，马战兵四十名（外委额外在内）、步战兵二百六十五名、守兵三百四十八名，兵战马四十匹。道光六年，统归左营兼管（原额标下中、左、右三营共兵二千七百七十名，康熙六十年移驻澎湖，六十一年仍移旧台湾府，自后复经增改调汰，今存兵额如右。）
台湾城守营（雍正十一年添设，辖标下左、右二军）
参将一员，驻札台湾府城。
左军守备一员（驻防冈山汛）、千总二员、把总二员、外委千总一员、外委把总三员、额外外委一员，马战兵二十名（外委额外在内）、步战兵百九十四名、守兵二百八十一名，兵战马二十匹。一驻札台湾府治并拨防涂堑埕南炮台塘，一驻防岗山汛，一防守罗汉门、茂公等塘汛，一防守猴洞口汛，一防守埤仔头汛，一防守盐水埔汛，一防守大湖半路竹港岗塘，一防守角带围塘。
右军守备一员（驻防下加冬汛）、千总二员、把总二员、外委六员、额外外委一员，马战兵二十名（外委额外在内）、步战兵二百四十名、守兵三百四十二名，兵战马二十匹。一随防台湾府治，一驻防下加冬汛兼辖八奖溪、急水溪、北势埔、茅港尾、铁线桥、水堀头等六小塘，一分防加溜湾汛兼辖溪边、水栅、柴头港、北炮台、茑松等五小塘，一分防大穆降汛，一分防旧社汛，一分防新添大武垄汛，一分防新添大排竹汛，一分防新添麻豆汛（雍正十一年增设台湾城守，原额兵共一千名，除增改调汰外，今额如右）
水师协（辖本标中、左、右三营，康熙二十三年添设）
副将一员，驻安平镇城。
中营游击一员（驻札安平镇）、守备一员（驻札安平镇）、千总二员、把总四员、外委千总二员、外委把总三员、额外外委三员，步战兵三百五十九名（外委额外在内）、守兵四百二十二名，战船见船政台湾厂。一驻防安平镇城内，一驻防安平镇城
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